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假裸囊菌属真菌分子系统学及生物地理学研究

邓永鹏

假裸囊菌属真菌分子系统学及生物地理学研究

邓永鹏1
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作者信息

  • 1. 河北大学
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摘要

假裸囊菌属(Pseudogymnoascus)隶属于盘菌亚门(Pezizomycotina)、锤舌菌纲(Leotiomycetes),寡囊盘菌目(Thelebolales)中的寡囊盘菌科(Thelebolaceae),目前已正式发表的有效种共22个。该属真菌是我国高海拔地区和南极、北极等寒冷环境中常见的嗜冷真菌类群,物种资源丰富,具有重要的应用前景和生态价值。然而,我国对假裸囊菌属的分类学和分子系统学研究起步较晚,物种资源多样性尚不明确,目前发现的假裸囊菌属真菌数量远高于已鉴定和描述的物种数量,另外,假裸囊菌属的演化历史和全球分布格局的成因仍是未知。因此,对假裸囊菌属真菌进行系统学及生物地理学研究尤为重要。 本研究对源自四川、云南地区以及南极地区的229株假裸囊菌属真菌进行形态学和系统发育学研究。基于多个基因片段,应用ABGD、ASAP、PTP、GMYC四种分子物种界定方法进行物种划分,同时,利用BEAST和RASP软件对假裸囊菌属可能的起源时间和祖先分布区进行推测。主要研究结果如下: (1)基于ITS、LSU、MCM7、RPB2和TEF1-α共5个基因片段,使用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树,均清晰地显示出假裸囊菌属的拓扑结构,且具有较高的单系支持率。基于ITS、MCM7、RPB2和TEF1-α四个基因及串联序列,采用4种分子物种界定方法对假裸囊菌属真菌进行物种界定分析,其中ABGD法界定出66个种,ASAP法界定出72个种,PTP法界定出89个种,GMYC法界定出100个种。结果显示,基于单个基因对属内物种界定的准确性不高,而基于串联序列得到的物种界定结果与系统发育分析中单系类群的划分基本一致,更为准确;但对某些物种的划分仍存在差异,其中GMYC法存在过度划分的情况,因此,应该选择相对保守的划分结果作为物种鉴定的参考。 (2)通过将系统发育分析发现单系、物种界定结果和形态学观察相结合的方法对假裸囊菌属真菌进行鉴定,发现疑似新种42个,并进行了详细的描述和讨论。 (3)以不同地区的假裸囊菌属真菌作为研究对象进行生物地理学分析。结果表明,假裸囊菌属起源于早第三纪(Palaeogene)的始新世(Eocene)末期,大约在40百万年(Mya)前开始分化,基于BBM模型推测北美洲地区是其最可能的祖先分布区域(统计概率77%)。始新世末期全球变冷事件的发生,白令陆桥将欧亚大陆同北美洲连接以及风、动物迁徙和人类活动等导致的长距离传播,对假裸囊菌属物种的演化和全球分布具有重要作用。

关键词

假裸囊菌属/分子系统学/物种界定/生物地理学

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授予学位

硕士

学科专业

微生物学

导师

王曼曼

学位年度

2023

学位授予单位

河北大学

语种

中文

中图分类号

Q94
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