摘要
肌苷酸(IMP)又名次黄嘌呤核苷酸或次黄苷酸，是机体在嘌呤代谢过程中合成的物质，是反映肉质鲜味的重要指标。因此获得与肌苷酸调控相关的候选基因已成为畜禽遗传改良的重点工作之一。本研究以杜泊羊、滩羊和小尾寒羊(各3只)为研究对象，通过转录组测序技术筛选影响绵羊肌苷酸调控相关信号通路和基因，为分子水平上研究肌苷酸形成机制和宁夏优质肉羊新品种的培育提供新的基础，主要研究结果如下: 1.通过转录组测序技术，在|log2FoldChange|≥1和P-value＜0.05筛选标准下，筛选杜泊羊和滩羊、杜泊羊和小尾寒羊两组的差异表达mRNA并取交集。在杜泊羊和滩羊组筛选出578个差异mRNA,在杜泊羊和小尾寒羊组筛选出816个差异mRNA,两组差异表达mRNA取交集共得到232个差异mRNA。GO富集分析显示，两组交集的差异mRNA显著富集到92个GO条目中。KEGG通路富集显示，两组交集的差异mRNA富集到159条通路中，其中与肌苷酸调控相关通路有嘌呤代谢、代谢途径、酪氨酸代谢、组氨酸代谢等信号通路。进一步筛选出GDA基因可能与绵羊肌苷酸调控相关，可以作为绵羊肌苷酸调控的候选基因进行深入研究。 2.通过转录组测序技术，在|log2FoldChange|≥1和P-value＜0.05筛选标准下，筛选杜泊羊和滩羊、杜泊羊和小尾寒羊两组的差异表达lncRNA并取交集。结果显示:杜泊羊和滩羊组筛选出700个差异lncRNA,杜泊羊和小尾寒羊组筛选出797个差异lncRNA。两组差异表达lncRNA取交集共得到278个lncRNA。对差异表达lncRNA的交集部分进行靶基因预测，共预测到1657个靶基因，其中预测到803个共表达靶基因，854个共位置靶基因。分别对lncRNA的共表达和共位置的靶基因进行GO和KEGG功能富集分析。GO富集分析显示，共表达和共位置靶基因分别显著富集到130和137条GO条目中。KEGG通路富集显示，共表达和共位置靶基因分别富集到228和226条通路中，其中与肌苷酸调控相关通路有氨基酸糖和核苷酸糖的代谢、磷酸戊糖途径、嘧啶代谢、酪氨酸代谢、代谢途径、氨基酸的生物合成、谷胱甘肽代谢等信号通路。进一步筛选出 AMPD3、IMPDH2、GPI、PFKM、PAICS、PROCA1、PPAT、FGF21、HPRT1 基因及TCONS_00188653、TCONS_0000848、TCONS_00038332、TCONS_00093120、TCONS_00146462、TCONS_00148005、TCONS_00000696、TCONS_00008482、TCONS_00026449、TCONS_00173905、TCONS_00051563可能与绵羊肌苷酸调控相关，可以作为绵羊肌苷酸调控的候选基因及候选lncRNA进行深入研究。 本研究筛选出的一些基因及lncRNA可作为绵羊肌苷酸调控的相关候选基因及候选lncRNA,为宁夏优质肉羊新品种的培育提供新的基础。
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