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温州市海鱼中寄生异尖线虫的鉴定和群体遗传结构分析

姜盈盈

温州市海鱼中寄生异尖线虫的鉴定和群体遗传结构分析

姜盈盈1
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作者信息

  • 1. 内蒙古大学
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摘要

温州市是中国东海沿岸一个重要的海产渔业基地,其渔业产值在全国排名前列。目前,鱼类感染异尖线虫已经成为我国渔业面临的一个重要问题,然而关于温州市海鱼感染异尖线虫的全面的流行病学调查相关研究报道几乎没有。本研究调查了温州市常见鱼种的异尖线虫感染情况,并对异尖线虫种类进行形态学鉴定,还利用ITS和COⅡ分子标记研究异尖线虫群体遗传多样性及遗传结构,分析不同种群的遗传分化、基因流、种群动态等特点,为该地区防治异尖线虫感染提供参考依据。主要研究结果如下: 1、本研究共解剖了 11种海鱼共158尾,并从8种83尾感染线虫的宿主样本中检出了 2306条异尖科线虫。异尖线虫的感染率、感染强度和感染丰度呈现出季节性变化。其中感染率在2月和3月较高;平均感染强度及丰度的变化趋势更为明显,其中9月和10月较低,3月两项指标均为最高。本研究共发现线虫13种2306条,其中异尖属线虫4种,宫脂属线虫7种,针晶蛔属线虫2种,其中派式异尖线虫(Anisakis pegreffii)占比最高。 2、基于ITS序列数据,共检出27种ITS单倍型,并且发现单倍型Hap1在所有的种群中都有分布,基于ML构建的单倍型系统发育树大致可分为两大分支,其中频率最高的是Hap1和Hap4。基于COⅡ序列数据,共检出408种COⅡ单倍型。Hap3和Hap4为主要单倍型。基于ML构建的单倍型系统发育树大致可分为两大分支,其中频率最高的是Hap4和Hap21。 3、基于ITS基因派式异尖线虫总的单倍型多态性(Hd)为0.33841,核苷酸多态性(Pi)为0.15410。种群间的遗传多样性水平差异较大(Hd=0.00000~0.40623,Pi=0.00000~0.19195)。总体而言,派式异尖线虫种群的遗传多样性水平较高。种群内的遗传变异(86.27%)大于种群间的遗传变异(13.73%),Fst-0.17618,Nm=2.34>1,基因流水平较高。基于COⅡ派式异尖线虫总的单倍型多态性(Hd)为0.9117,核苷酸多态性(Pi)为0.28438。各个种群间的的遗传多样性水平有很大的差异(Hd=0.00000~0.29766,Pi=0.00000~1.00000)。整体而言,派式异尖线虫种群的遗传多样性较高。种群内的遗传变异(74.92%)大于种群间的遗传变异(25.08%),Fst=0.31956,Nm=1.06,个别种群存在密切基因交流,总体而言基因交流水平较弱。 研究结果表明,温州市常见鱼种普遍存在异尖线虫感染,并且异尖线虫群体具有一定的遗传多样性,不同种群之间存在一定程度的遗传分化与基因交流。该研究揭示了温州市常见鱼类感染异尖线虫的现状,为相关疾病研究和监测提供参考;同时,了解异尖线虫在不同鱼类种群中的遗传分化和基因交流情况,有助于评估其对生态系统的影响及潜在生态风险。

关键词

海鱼寄生异尖线虫/遗传结构/遗传多样性

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授予学位

硕士

学科专业

生物与医药

导师

胡薇

学位年度

2023

学位授予单位

内蒙古大学

语种

中文

中图分类号

S9
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