摘要
【目的】 1.基于生物信息学分析探究TGFBI在宫颈癌中的表达情况及其与宫颈癌预后的关系，并初步探索TGFBI与宫颈癌发生发展相关的过程。 2.基于免疫组织化学实验探索TGFBI在宫颈癌临床样本中的蛋白表达水平。 【方法】 GEO数据库下载宫颈癌数据集GSE52903和GSE138080，GEO2R分析得到正常宫颈组织与宫颈癌组织的差异表达基因。GEPIA2数据库下载与宫颈癌相关的前500个生存相关基因，并与差异表达基因取交集，得到9个在宫颈癌中上调且与宫颈癌预后相关的关键基因。基于GEPIA2数据库、Kaplan-MeierPlotter数据库再次验证关键基因在宫颈癌中RNA表达水平及预后情况。linkomics数据库探索TGFBI相关基因，并通过WebGestalt数据库对TGFBI相关基因进行功能富集分析。Ualcan数据库用于分析TGFBI在宫颈癌中RNA表达水平与临床病理参数、基因甲基化的相关性。基于TCGA数据库，使用R语言分析TGFBI与肿瘤微环境、免疫检查点、免疫细胞的相关性。 收集了佛山市南海区人民医院病理科和妇科档案中宫颈癌组织24例，癌旁组织6例，符合纳入和排除标准，对患者进行随访，并进行免疫组化实验以探究TGFBI在宫颈癌中的蛋白表达情况以及与宫颈癌预后的相关性。 【结果】 基于GEO、GEPIA2数据库，我们得到CHAF1A、EFNA1、HELLS、HIST1H3G、IFI30、LIG1、LOXL2、MMP1、TGFBI共9个基因在宫颈癌中高表达并与预后相关。Kaplan-MeierPlotter数据库、GEPIA2数据库进一步验证了宫颈癌中TGFBI在RNA水平上表达上调且?表达组的总体生存时间更短，预后更差。通过LinkOmics网站，筛选出前100个TGFBI呈正相关的基因，并对其进行功能富集分析，结果显示TGFBI在生物学过程中与细胞外基质组织等相关；在细胞成分上与细胞外基质成分等相关；在分子功能上与信号受体结合等相关；在信号通路分析中发现其与人乳头瘤病毒感染等相关。基于Ualcan网站，我们发现TGFBIRNA表达水平与宫颈癌患者年龄、肿瘤分级呈正相关；在宫颈鳞癌中TGFBI的表达水平较其他肿瘤类型更?；TGFBI表达水平与肿瘤的分期及淋巴结转移?明显相关性；TGFBI在宫颈癌中极显著低甲基化。基于TCGA数据库及R语言分析，我们发现TGFBI与免疫检查点CD276、TNFSF9、NRP1、CD44、TNFRSF8、CD70、CD40、PDCD1LG2呈正相关，与VTCN1、LGALS9呈负相关；TGFBI与M0巨噬细胞正相关，与浆细胞、幼稚B细胞负相关。 免疫组化实验显示24例宫颈癌组织及6例癌旁组织均未见TGFBI蛋白水平明显表达。 【结论】 通过生信分析发现TGFBI启动子在宫颈癌中呈低甲基化从而导致TGFBIRNA在宫颈癌中表达上调；TGFBI可能通过参与宫颈癌肿瘤微环境从而与预后不良相关。TFGBI有望成为指导临床治疗和评估患者预后的指标。
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