摘要
同源盒基因（SIX）家族包括SIX1、SIX2、SIX3、SIX4、SIX5以及SIX6共计6个成员，是一组转录调控因子，对基因的表达具有重要的调节作用，结构上高度保守，包含有同源异型结构域（HD，Homedomain）。 SIX1基因位于人类染色体14q23上，编码的蛋白质是由HD以及Six两个结构域组成的复合体，存在极为广泛，在各类生物体中都有一定程度的表达，研究表明其与生物体的生长发育有关，在胚胎发育过程中的作用已被证实，与耳朵、肝、肾及肌肉等器官的发育也密不可分。近年来的研究发现，SIX1基因对细胞增殖及分化具有影响，也可促进细胞的迁移。同时，SIX1在肿瘤中的作用受到广泛了关注，研究报道SIX1在肿瘤发生发展过程中发挥了重要作用，具体机制仍有待进一步探讨。 研究目的： 1)探索SIX1在乳腺癌中的表达情况并研究其在乳腺癌的发生发展过程中所发挥的作用； 2)寻找SIX1作用于乳腺癌的机制及相关的靶基因； 3)对SIX1可能的相互作用蛋白进行预测。 研究方法： 1)利用在线数据库TCGA、GEPIA2及HPA分析SIX1在乳腺癌中的表达情况；2)EdU与Transwell实验探究SIX1对乳腺癌细胞增殖和侵袭能力的影响； 3)通过TCGA数据及乳腺癌细胞的RNA-seq结果分析SIX1作用于乳腺癌的机制； 4)利用已发表的GEO数据以及KM-plotter分析SIX1与靶基因表达的相关性及与乳腺癌病人预后的关系； 5)在线软件GCBI、GeneMANIA、String预测SIX1的相互作用蛋白。 研究结果： 1)通过分析TCGA数据库和GEPIA2在线数据库有关数据，发现SIX1在乳腺癌中的表达显著高于正常乳腺组织，且在不同分子的亚型Basal-like、HER2、LuminalA、LuminalB中也证实了这一点；同时HPA数据库分析发现，SIX1免疫组化蛋白表达水平高于正常乳腺组织，以上结果均证明SIX1基因在乳腺癌中高表达。 2)EdU以及Transwell实验结果表明SIX1可以促进乳腺癌细胞增殖和侵袭。 3)TCGA数据库乳腺癌的转录组分析及乳腺癌细胞中SIX1调控的转录组分析结果表明，SIX1通过代谢及干细胞调控通路促进乳腺癌的发生发展。 4)通过分析GEO临床数据集以及KM-plotter相关数据，发现MYC、SNAI2、EGFR，与SIX1的表达正相关且SIX1、MYC、SNAI2与EGFR的高表达与患者不良预后相关。 结论： 我们的研究表明SIX1在乳腺癌中的表达高于正常组织，同时具有促进乳腺癌细胞增殖及侵袭的作用；SIX1可能通过上调MYC、SNAI2及EGFR，促进乳腺癌的发生发展。这为乳腺癌的诊断治疗提供了一个新思路，为进一步深入研究该基因提供了线索。
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