摘要
背景:胆囊胆固醇息肉及胆固醇结石是肝胆外科常见病。目前有关胆囊胆固醇息肉及胆固醇结石的形成机制存在诸多理论,但从微生物学角度切入的研究尚存在较大探索空间,且此两种疾病对人民群众的健康造成较大的影响,对医生的临床诊疗带来一定程度的挑战,鉴于第二代高通量测序技术的进步,本研究拟对上述疾病患者的胆道、肠道菌群进行展示。 目的:本研究拟基于高通量测序技术对胆囊胆固醇息肉、胆固醇结石患者的胆道(胆囊、胆道)、肠道菌群的构成进行展示,通过对患者胆道、肠道菌群构成以及差异性菌门、菌属的对比来探索胆道、肠道菌群与胆囊胆固醇息肉、胆固醇结石的相关性。 方法:选取于陕西省核工业二一五医院2021年7月至2022年7月普通外科住院行胆囊切除术,且术后病理证实为胆囊胆固醇结石、胆固醇息肉患者共22人,其中胆囊胆固醇结石组12人,获取到胆囊胆汁12例,胆道胆汁样本6例,粪便3例;胆囊胆固醇息肉组10人,获取到胆囊胆汁样本10例,胆道胆汁样本6例,粪便样本3例。所有研究对象均符合纳排标准。统一对样本进行DNA提取、16SrRNAV3+V4区扩增,最后利用IlluminaHiseq2500测序平台进行高通量测序、构建文库和生物信息分析。 结果: 1.本研究共测得2166610个高质量tags、其中胆固醇结石组样本共测得1110863个tags,胆固醇息肉组样本共测得1055747个tags。以97%序列相似性为基准,与公开数据库相比对后,胆固醇结石组鉴定出1927个OTUs、胆固醇息肉组鉴定出780个OTUs(包含样本间重复)。 2.在α多样性分析时,胆囊胆固醇结石及胆固醇息肉组内胆道、肠道菌群对比中;两组粪便样本对比、胆囊胆汁样本对比中,其α多样性具有统计学差异。 3.在β多样性分析时,胆囊胆固醇息肉、胆固醇结石组内胆道、肠道菌群对比中;胆囊胆汁样本对比中,其β多样性具有统计学差异。 4.在胆囊胆固醇结石及胆固醇息肉组内胆道、肠道菌群对比中;胆囊胆汁样本对比中,可在门、属水平鉴定出差异性物种。 结论:本研究首次使用IlluminaHiSeq平台同时对胆囊胆固醇结石和胆固醇息肉患者的胆道、肠道菌群进行了高通量测序,并展示了其胆道、肠道菌群的多样性和组成结构。在α多样性、β多样性、优势菌的门、属水平差异性物种鉴定中发现不同程度的差异,其反应的物种多样性及丰富度差异,优势菌门、菌属差异可能为两种疾病的微生物学发病机制不同之处。