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基于DNA条形码的西江来宾段鱼类早期资源鉴定及多样性分析

王一菲

基于DNA条形码的西江来宾段鱼类早期资源鉴定及多样性分析

王一菲1
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作者信息

  • 1. 桂林理工大学
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摘要

西江是珠江流域的主流,鱼类资源丰富,水域生态环境多样化。但由于梯级水利枢纽的建设、环境污染以及过度捕捞等原因,使鱼类资源遭到一定程度的破坏,导致有些鱼类的产卵场消失,鱼类早期资源越来越少。本研究于2021年4~8月在西江来宾段的柳江下游江段和红水河下游江段,设置两个采样点,定时采集鱼卵和仔稚鱼并进行环境因子的测定。通过DNA条形码的方法进行物种鉴定,从而开展西江来宾段的鱼类早期资源物种组成、多样性现状及鱼类早期资源与环境因子的关系等研究。主要结果如下: (1)柳江采样点选择158个样本进行DNA提取实验,通过测序获得了118个有效序列,平均长度为648bp。经GenBank基因库的BLAST比对得出,隶属于3目6科18种,其中包括鱼卵10种,仔稚鱼15种。所获的鱼卵和仔稚鱼样本中,均以产漂流性卵的物种为主,优势种及常见种以银鮈(Squalidusargentatus)和伍氏华吸鳅(Sinogastromyzonwui)等小型鱼类为主。 (2)红水河采样点选择86个样本进行DNA提取实验,通过测序获得了69个有效序列,平均长度为648bp。经GenBank基因库的BLAST比对得出,隶属于3目6科17种,其中包括鱼卵14种,仔稚鱼8种。所获的鱼卵和仔稚鱼样本中,均以产漂流性卵的物种为主,优势种及常见种以银鮈、南方拟?(Pseudohemiculterdispar)等小型鱼类为主。 (3)鱼类早期资源的渔获数量主要集中于涨水期,两江段的物种数均为涨水期高于涨水前期和涨水后期,且具有显著性差异(P<0.05)。涨水期的物种密度高于涨水前期和涨水后期,但没有显著性差异(P>0.05)。涨水期的Margalef丰富度指数(DMa)和生物多样性指数(H’)与其他两个时期具有显著性差异(P<0.05),但柳江江段的均匀度指数(J)三个时期均没有显著性差异(P>0.05)。 (4)主成分分析(PCA)和冗余分析(RDA)结果表明,对两江段的鱼类早期资源群落结构有显著性影响的环境因子分别为:透明度、水位和流量(P<0.05)。无度量多维排序(NMDS)以及相似性分析(ANOSIM)分析结果表明,柳江江段涨水期的物种组成与涨水前期、涨水后期的物种组成均呈现显著性差异(P<0.05);而红水河江段,涨水过程对物种组成变化的影响不显著(P>0.05)。 (5)通过对GenBank基因库中没有记录的西江流域鱼类即海南拟?(Pseudohemiculterhainanensis)的线粒体全基因组测序分析得出,海南拟?线粒体基因组全长为16,647bp,呈现A+T含量高于G+C含量。将海南拟?与鲌亚科的10个物种构建NJ系统发育树,结果表明,海南拟?形成了一个独立的分支,且与海南似鱎(Toxabramishoudemeri)在一近支。

关键词

DNA条形码/鱼类早期资源/物种组成/群落多样性

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授予学位

硕士

学科专业

环境科学与工程

导师

吴志强/黄亮亮

学位年度

2023

学位授予单位

桂林理工大学

语种

中文

中图分类号

S9
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