摘要
研究背景: 近年来，肿瘤免疫治疗开启了肿瘤治疗的新篇章。然而，免疫检查点抑制剂(ICIs)在结直肠癌(CRC)治疗中的应用仍有局限性。临床上急需精确的生物标记物筛选出适合ICIs治疗的CRC亚群。 研究目的: 1.分析不同NOTCH通路突变状态下接受ICIs治疗的CRC患者之间的预后差异; 2.分析不同NOTCH通路突变状态下CRC患者之间免疫原性、免疫微环境(TME)之间的差异; 3.不同NOTCH通路突变状态下CRC患者之间基因富集分析差异; 4.探索不同NOTCH通路突变状态影响TME的潜在机制。 研究方法: 收集接受ICIs治疗的CRC队列的突变和临床数据。采用单因素和多因素Cox回归模型分析NOTCH通路突变状态与CRC免疫治疗预后之间的关系。结合来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库的CRC队列数据和南方医科大学珠江医院的103例CRC样本的突变数据以获得不同NOTCH通路突变状态之间的免疫原性和TME差异的全面概述。 研究结果: 1.在ICIs治疗队列中，临床特征如年龄和样本类型与ICIs患者的生存率无关，NOTCH通路的突变状态与ICIs患者的临床预后密切相关;NOTCH通路的突变状态可作为CRC患者免疫治疗的独立保护因子;生存分析显示NOTCH-MTCRC患者的OS显著长于NOTCH-WT患者（P＜0.001,HR=0.42,95％Cl0.23-0.77）。 2.免疫原性方面，主要观察了肿瘤突变负荷（TMB）、新抗原负荷（NAL）和DNA损伤修复（DDR）通路的突变数量三个指标。在ICIs治疗队列、TCGA-CRC队列和本地队列中,NOTCH-MT组的TMB均显著大于NOTCH-WT组（P＜0.05）。在TCGA-CRC队列中，发现NOTCH-MT组有更高的NAL（P＜0.05）且DDR通路突变数显著增加（P＜0.05）。 3.在TCGA-CRC队列中，NOTCH-MT组和NOTCH-WT组之间的TME存在差异:在免疫细胞浸润方面，NOTCH-MT组的记忆B细胞、CD8+T细胞、活化NK细胞、M1巨噬细胞和中性粒细胞分布比例高于NOTCH-WT组（P＜0.05）。NOTCH-MT组的免疫相关评分均高于NOTCH-WT组（P＜0.05）。免疫检查点相关基因，NOTCH-MT组CD274、HAVCR2、LAG3、LAG1、IDO1、TIGIT、PDCD1、PDCD1LG2表达水平显著高于NOTCH-WT组（P＜0.05）。 4.在NOTCH-MT组中，参与免疫细胞杀伤功能通路及细胞因子相关的通路表达上调（均为P＜0.05,ES＞0）。相反，与免疫衰竭相关的途径中显著下调（P＜0.05,ES＜0）。 研究结论: 1.NOTCH通路的突变状态与接受ICIs的CRC患者的临床预后密切相关，NOTCH-MT可作为CRC患者接受免疫治疗的独立保护因素;NOTCH-MT组CRC患者的总生存率（OS）显著长于NOTCH-WT患者。 2.NOTCH-MT组的免疫原性显著增加:TMB、NAL和DDR通路的突变数量均显著增加。 3.NOTCH-MT组和NOTCH-WT组的TME存在差异，NOTCH-MT组有更高比例的免疫激活细胞和更高水平的免疫点相关基因表达，这些与免疫治疗更好的预后相关。 4.NOTCH通路突变状态可作为对CRC患者进行免疫治疗分层的生物标志物。
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