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DCAF7、LCORL和PRKG2基因遗传变异与德州驴胸腰椎数量及胴体性状的相关性研究
王天琦1
作者信息
摘要
德州驴是我国五大优良驴种之一，具有良好的生产特性和稳定的遗传性能， 2011年被列入了国家级畜禽遗传资源保护名录。先前研究表明德州驴有三种胸椎类型，即17、18、19根胸椎，以及两种腰椎类型，即5和6根腰椎，胸腰椎数的组合存在五种类型：T17L5、T18L5、T17L6、T18L6、T19L5（T为胸椎，L为腰椎），德州驴多一根椎骨，其体长、胴体重均有一定的正增长。DCAF7基因（DDB1 and CUL4 associated factor 7）在先前的研究中表明与肌肉骨骼发育息息相关，LCORL基因（ligand dependent nuclear receptor corepressor like）在马、牛、羊等家畜上发现与体高、体重、体型、骨骼等生长性状显著相关，PRKG2基因（protein kinase cGMP-dependent 2）与人类的侏儒症、身高和成骨细胞生成相关。因此本研究利用靶向测序技术及 Sanger 测序技术检测了 DCAF7、LCORL 及PRKG2基因的遗传变异，并对406头的德州驴群体上述基因的SNPs（单核苷酸多态性）与其胸腰椎数目及胴体性状进行了相关性分析，以期发现对胸腰椎数性状具有显著效应的遗传标记，为多胸腰椎数驴品系的培育奠定基础。 本研究得到了以下结果: 1. DCAF7 基因多态性与驴胸腰椎数数目及胴体性状相关性分析 通过靶向测序和Sanger测序发现了DCAF7基因的7个SNPs，且均位于内含子区域。g.48991059 T＞G的多态性与皮重显著相关（P ＜ 0.05）；g.48978712 T＞C、g.48985896 A＞G、g.48987539 C＞T、g.48988058 A＞G和 g.48992171 C＞T 位点与胸椎数量显著相关（P ＜ 0.05）。此外，单倍型组合 Hap2Hap4（TCAGTTCC）的胸椎长度显著高于单倍型组合Hap1Hap2（TTAAGTCC）和Hap1Hap3（TCAGGTCT） （P ＜ 0.05）。本研究表明 DCAF7基因可作为驴遗传育种的潜在分子标记。 2. PRKG2基因多态性与驴胸腰椎数数目及胴体性状相关性分析 通过靶向测序鉴定出15个SNPs，均位于PRKG2基因的内含子区域。关联分析表明， g.162153251 G＞A、 g.162156524 C＞T、 g.162158453 C＞T 和 g.162163775 T＞G与胴体重显著相关（P ＜ 0.05），g.162166224 G＞A、 g.162166654 T＞A、 g.162167165 C＞A、g.162167314 A＞C 和 g.162172653 G＞C 与胸椎数显著相关（P ＜ 0.05），g.162140112 A＞G、g.162158453 C＞T、g.162163775 T＞G 和 g.162216538 G＞A 分别与腰椎数、腰椎长度、胸腰椎总数、胸椎长度显著相关（P＜ 0.05）。PRKG2 基因可成为选育具有多胸腰椎数和较好胴体性状德州驴的分子标记，为培育产肉量高的优秀大型驴品种奠定了基础。 3. LCORL基因多态性与驴皮重及体尺性状相关性分析 采用靶向测序技术在LCORL基因的内含子1检测到一个SNP位点。关联分析显示，该位点GG基因型个体的体高、体长、胸围和皮重都显著高于具有AA基因型的个体（P ＜ 0.05）。这表明 g.112558859 A＞G位点可以作为培育德州驴的潜在候选标记，为培育产皮量高的大型驴品种提供了基础。 综上所述，DCAF7和PRKG2基因与德州驴胸腰椎数数目显著相关，LCORL基因与驴皮重量显著相关，为培育产肉量及产皮量高的优秀大型驴品种奠定了基础。
关键词
德州驴/胸腰椎数目/胴体性状/DCAF7基因/LCORL基因/PRKG2基因/遗传变异/单核苷酸多态性引用本文复制引用
授予学位
硕士学科专业
动物学导师
王长法/柴文琼学位年度
2023学位授予单位
聊城大学语种
中文中图分类号
S8