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CLEC11A在结肠癌肿瘤免疫微环境中的角色及其预后价值

顾宇旸

CLEC11A在结肠癌肿瘤免疫微环境中的角色及其预后价值

顾宇旸1
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作者信息

  • 1. 温州医科大学
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摘要

背景和目的 结肠癌(ColonCancer,COAD)是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一。近年来,结肠癌的发病率和死亡率呈逐年上升趋势。以手术治疗为主的综合治疗手段进步使得早期结肠癌患者的治疗效果较前明显好转。然而,相当比例的COAD患者发现时已处于中晚期,丧失了手术机会,预后极差。免疫治疗的出现改变了晚期结肠癌治疗的格局,但由于COAD发病机制复杂和肿瘤免疫逃逸,目前亟待挖掘新的免疫治疗靶点来进一步提升免疫治疗效果。近年来凝集素家族在肿瘤发生发展中的作用逐渐引起研究者的重视,C型凝集素结构域家族成员作为其中的重要成员在肿瘤信号转导、免疫逃逸等生物学过程中发挥了重要作用。CLEC11A是C型凝集素超家族中的一员,既往的研究表明,CLEC11A的甲基化和异常表达与胰腺癌、肝细胞癌、肺癌、急性白血病和多发性骨髓瘤等多种肿瘤密切相关,但在COAD中尚未见相关报道。因此,本研究的目的是为了探讨CLEC11A在结肠癌中的表达和预后价值及其在结肠癌肿瘤免疫微环境中的角色。 方法 1、从癌症基因图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)数据库平台收集并下载COAD患者基因表达谱数据及对应临床信息,借助R平台(4.1.3版本)分析CLEC11A在肿瘤组织和对应正常组织中在配对和非配对样本中的表达状况。从人类蛋白质表达图谱(TheHumanProteinAtlas,HPA)数据库中获取结肠癌组织和对应正常结肠组织的免疫组化结果验证CLEC11A表达差异。2、借助GEPIA(GeneExpressionProfilingInteractiveAnalysis)数据库survivalanalysis模块分析CLEC11A表达与总生存期(OverallSurvival,OS)之间的相关性,同时采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线图,分析CLEC11A表达量与疾病相关生存(DiseaseSpecificSurvival,DSS)和无进展间隔期(ProgressionFreeInterval,PFI)之间的关系;进一步整理分析TCGA-COAD数据资料并进行单-多因素COX回归分析,Logistic分析和Kruskal-Wallis检验回归分析CLEC11A与临床病理特征之间的相关性;3、采用CIBERSORT算法和TISIDB数据库分析CLEC11A和肿瘤浸润免疫细胞之间的相关性,TISIDB数据库分析CLEC11A与肿瘤免疫检查点分子之间的相关性,GEPIA数据库评估CLEC11A与免疫细胞相关生物标志物之间的联系;4、运用蛋白质相互作用分析数据库STRING筛选与CLEC11A关系最密切的50个蛋白,运用GEPIA筛选与CLEC11A最相关的100个基因,两者取交集分析并对全体行KEGG功能富集分析。5、绘制受试者工作特征曲线图(receiveroperatingcharacteristiccurve,ROC)判断诊断价值并构建疾病预后模型。 结果 1、从TCGA数据库中收集并下载521例样本,其中包括480例结肠癌样本和41例正常组织样本。配对差异分析和非配对差异分析结果均提示CLEC11A在COAD组织中的表达显著高于正常组织,HPA免疫组化结果与上述结果相一致。2、生存分析结果提示CLEC11A高表达与结肠癌不良预后密切相关,亚组分析结果提示该不良结局多见于老年人、肥胖人群、未发生远处转移的人群和有结肠息肉史的患者;单-多因素Cox回归分析提示CLEC11A高表达是结肠癌不良预后的独立危险因素;3、临床病理特征相关性分析提示CLEC11A与更高的T分期、N分期、病理分期相关,并能促进神经周围侵犯和淋巴浸润。3、免疫浸润分析提示CLEC11A与多种促瘤免疫细胞呈正相关,并与免疫检查点及免疫细胞相关生物标志物之间呈显著正相关,提示CLEC11A在结肠癌肿瘤免疫微环境中扮演了重要角色。4、共表达分析提示CLEC11A在蛋白和基因层面上均与ANGPTL2密切相关,同时与差异表达分析的功能富集分析共同提示CLEC11A可能通过靶向PI3K-AKT实现COAD的免疫逃逸。5、ROC曲线提示CLEC11A对于COAD具有较好的诊断价值。 结论 CLEC11A在COAD组织中的表达显著高于正常组织,其高表达是COAD不良预后的独立危险因素。CLEC11A高表达与COAD的多项临床病理特征显著相关;与肿瘤免疫微环境(TumorMicroenvironment,TME)中的肿瘤浸润免疫细胞、免疫检查点及免疫相关生物标志物之间关系密切;共表达分析和差异基因分析提示CLEC11A可能通过靶向ANGPTL2介导PI3K-AKT促进COAD免疫逃逸。以CLEC11A构建COAD诊断及预后模型具有较好预测价值。

关键词

结肠癌/生物信息学/免疫浸润/肿瘤微环境/CLEC11A表达

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授予学位

硕士

学科专业

肿瘤学

导师

陈文俊

学位年度

2023

学位授予单位

温州医科大学

语种

中文

中图分类号

R73
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