摘要
鱼类的生长发育与其肠道菌群关系密切，而肠道菌群的构建与环境细菌微生物也有密切的关联。目前，关于淡水鱼类育苗全程其肠道菌群的演替变化以及其与养殖水体细菌微生物的相关性尚缺乏相关报道。本研究以溪流性淡水鱼类-光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)为研究对象，系统研究光唇鱼育苗全程其肠道菌群的演替变化，揭示肠道菌群随幼体发育过程的组成、结构及演替机制;分析光唇鱼育苗全程其养殖水体中细菌群落的组成和结构，阐明光唇鱼肠道菌群的构建与其养殖水体细菌微生物的相关性;研究室内水泥池养殖环境和室外池塘养殖环境下光唇鱼幼鱼的消化酶、免疫酶活性变化以及肠道菌群的组成和结构，阐明生境差异下光唇鱼的生理响应以及其肠道菌群的生境适应性变化;对比分析光唇鱼越冬前、中、后其消化酶和免疫酶的活性变化以及其肠道细菌群落的组成，揭示光唇鱼越冬环境的适应性响应策略。具体结果如下: 1、光唇鱼仔稚幼鱼肠道菌群的演替变化及其与养殖水体细菌群落的相关性分析 采用16SrRNA高通量测序，系统研究了光唇鱼仔鱼、稚鱼和幼鱼肠道菌群组成及与同时期养殖水体细菌群落的相关性。研究结果表明，光唇鱼仔鱼和稚鱼肠道菌群中的优势菌门由变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)组成，同时期养殖水体中优势菌门为变形菌门;光唇鱼幼鱼肠道菌群中的优势菌门为梭杆菌门(Fusobacteria)和变形菌门，同时期养殖水体中优势菌门为变形菌门、拟杆菌门和梭杆菌门。线性回归分析结果显示，随光唇鱼幼体发育，在光唇鱼肠道菌群中变形菌门、厚壁菌门和梭杆菌门相对丰度的时序变化趋势与其在养殖水体中相同。在属水平上，光唇鱼仔鱼、稚鱼肠道菌群中优势菌属为醋酸杆菌属(Acetobacter),而幼鱼肠道菌群中优势菌属为鲸杆菌属(Cetobacterium)。稀有菌群和条件稀有菌群是光唇鱼肠道菌群和养殖水体细菌群落中的主要细菌分类类群。相关性分析表明，光唇鱼肠道菌群与养殖水体细菌群落组成相关性不显著(P＞0.05)。 2、不同养殖环境下光唇鱼消化、免疫及其肠道菌群分析 本实验对比研究了室内水泥池养殖环境和室外池塘养殖环境差异下，光唇鱼的生理变化和其肠道菌群的适应性。研究结果表明，池塘养殖环境下光唇鱼肠道α-淀粉酶显著高于水泥池养殖环境光唇鱼(P＜0.05);池塘养殖环境下光唇鱼肠道组织的碱性磷酸酶、酸性磷酸酶和超氧化物歧化酶活性显著高于室内水泥池养殖环境下的光唇鱼(P＜0.05);室内水泥池养殖环境光唇鱼肌肉组织的碱性磷酸酶和超氧化物歧化酶活性显著高于池塘养殖环境(P＜0.05)。光唇鱼肠道绒毛高度、宽度和肠壁厚度在两种养殖环境下均没有显著差异(P＞0.05)。PcoA分析和ANOSIM分析结果显示，两种养殖环境下光唇鱼肠道菌群组成差异显著(P＞0.05)。两种养殖环境下光唇鱼肠道菌群优势菌门为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门(Actinobacteria)和梭杆菌门;变形菌门相对丰度显著高于其他优势菌门(P＜0.05)。水泥池养殖环境光唇鱼肠道优势菌属为Ralstonia、气单胞菌属(Aeromonas)、普雷沃氏菌属(Prevotella)和鲸杆菌属;池塘养殖环境光唇鱼肠道菌群优势菌属由奈瑟菌属(Neisseria)、Ralstonia、普雷沃氏菌属和气单胞菌属组成。 3、光唇鱼越冬前中后光唇鱼消化、免疫及其肠道菌群分析 室外池塘养殖是光唇鱼主要的养殖环境之一。通过研究池塘养殖环境下光唇鱼越冬前中后的生理变化及其肠道菌群组成，揭示光唇鱼的越冬环境的适应性响应策略。结果表明，越冬前光唇鱼肠道α-淀粉酶和脂肪酶活性显著高于越冬后光唇鱼肠道。越冬中光唇鱼肠道酸性磷酸酶、超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性最高;越冬中光唇鱼肌肉组织酸性磷酸酶和过氧化氢酶活性最高;越冬中光唇鱼鳃组织碱性磷酸酶、酸性磷酸酶和过氧化氢酶活性最低。越冬前、中、后光唇鱼肠道菌群α-多样性指数没有显著差异(P＞0.05)。PCoA分析和ANOSIM分析结果显示，越冬前和越冬后唇鱼肠道菌群组成差异显著(P＜0.05)。越冬前、中、后光唇鱼肠道菌群优势菌门由变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门和放线菌门组成，其中变形菌门的相对丰度显著高于其他优势菌门(P＜0.05)。Ralstonia、奈瑟菌属和普雷沃氏菌属一直作为优势菌属存在于越冬前、中、后光唇鱼肠道中。
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