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大白猪高产仔数相关基因筛选

丁晶

大白猪高产仔数相关基因筛选

丁晶1
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作者信息

  • 1. 华中农业大学
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摘要

大白猪常做为生产杜长大三元杂种猪的第一母本,以高产仔数而著称。近年来加拿大大白猪平均窝产仔数达15头以上,某种猪场2013年11月从加拿大引入的大白母猪第一胎平均总产仔数高达15.22头,经产总产仔数平均值已达16.32头,最高窝产仔数为28头。近几十年来世界各国为提高猪的产仔数做了很多工作,利用分子标记进行育种成为提高种猪繁殖性能的有效方法。本研究主要以某种猪场高产仔数大白猪为研究对象,选择FSHβ、ESR1、NAT9、RNF4、NCOA1以及GPR149基因为候选基因,筛选影响该群体高产仔数基因,为标记辅助选择提供有用标记,本研究取得以下研究结果: 1.以566头大白母猪作为样本,共收集1880窝产仔记录。对产仔数性状进行分析,发现该群体头胎平均总产仔数为15.22头,最高窝产仔数为25头;经产平均总产仔数有16.32头,最高已达28头; 2.利用PCR与混池测序方法,在该大白猪群体中对候选基因进行SNP筛查,结果在6个基因中检测到7个SNP位点,其中ESR1存在PvuII位点(以下简称为ESR1P)和AluI位点(以下简称为ESR1A)两个SNP位点;使用PCR-RFLP对候选基因的基因型进行检测,计算各基因的基因型频率和等位基因频率,并进行哈代温伯格平衡检验,结果除GPR149基因(χ2=10.45gt;χ20.05(1)=3.84)外,其他基因χ2值均小于χ20.05(1),在试验群体中均达到了Hardy-Weinberg平衡(Pgt;0.05)。 3.构建混合线性模型,利用SAS软件,对7个SNP位点不同基因型与产仔数性状进行关联分析,结果表明:ESR1P在经产母猪中,AA型总产仔数与AB型差异极显著(Plt;0.01),与BB型差异显著(Plt;0.05);在经产猪中,NAT9基因AA型总产仔数与AG、GG型差异极显著(Plt;0.01),AA型产活仔数与GG型差异显著(Plt;0.05);RNF4基因在初产中,CC、TC平均总产仔数与平均产活仔数均显著高于TT型(Plt;0.05)。 4.采用逐步回归的方法分别在初产与经产中分析每两个基因间的联合效应对产仔数的影响,发现在初产中ESR1A-NCOA1基因,NCOA1-GPR149基因联合效应对产仔数性状影响显著,且ESR1A-NCOA1基因AA-AB组合总产仔数高于其他基因型组合,NCOA1-GPR149基因的AB-AA为优势基因型组合;在经产猪中,ESR1P-NAT9基因,ESR1P-RNF4基因的互作效应对产仔数性状影响显著,且ESR1P-NAT9合并基因型中BB-GG为优势基因型组合,对于总产仔数性状,RNF4-ESR1A基因的优势基因型为TT-AA组合。

关键词

大白猪/总产仔数/产活仔数/候选基因筛选/繁殖性能

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授予学位

硕士

学科专业

养殖

导师

刘榜/徐三平

学位年度

2016

学位授予单位

华中农业大学

语种

中文

中图分类号

S8
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