摘要
近二十年来，人类社会遭遇了多次由病毒性病原体引起的疫情，如甲型流感病毒(InfluenzaAvirus)、尼帕病毒(Nipahvirus)、严重急性呼吸综合征(SevereAcuteRespiratorySyndrome,SARS)病毒、中东呼吸综合征(MiddleEastRespiratorySyndrome,MERS)病毒、埃博拉病毒(Ebolavirus)、新型冠状病毒(SARS-CoV-2)、猴痘病毒(Monkeypoxvirus)等。这些疫情不仅消耗了大量的社会资源，还引发了人们的恐慌甚至造成了病例的死亡，对人类社会构成了一大威胁。许多流行的病毒性病原体都是来源于野生动物的，这些病毒在野生动物宿主和家畜之间的跨种传播事件很难被观察到。但是它们有可能直接感染人类，因此有必要持续开展针对病毒自然宿主及其生态圈内相关动物的病毒组学研究。在众多可能的病毒自然宿主中，分布广泛、种类丰富的翼手目动物(蝙蝠)在SARS和新冠疫情的双重影响下，成为了病毒学研究领域最受关注的对象。我国是一个物种资源丰富的国家，目前已经发现了141种蝙蝠。通过基于二代测序技术的病毒组学方法，国内已经开展了十多年的蝙蝠病毒组学研究，但是由于采样点分布不均、样本数量不足、测序技术有限等原因，蝙蝠携带病毒的本底数据仍有缺失。 为获取蝙蝠携带病毒的本底特征数据，实现对具有潜在威胁病毒的早期预警,降低其可能造成的危害。本研究以我国丰富的蝙蝠物种资源为基础，对2016到2021年间在我国14个省份采集的8个科50余种蝙蝠共13105个蝙蝠样本进行了病毒组学研究与冠状病毒筛查。在1140余份冠状病毒阳性样本中没有发现与SARS-CoV-2相关的冠状病毒，表明SARS-CoV-2相关冠状病毒在中国蝙蝠中的传播可能是有限的。测序数据进行拼接和比对后获得了大量的病毒contigs,其中长度1000bp以上的病毒序列76186条。经过对其中脊椎动物病毒进行注释和系统进化分析，结果涵盖了大部分的脊椎动物相关病毒科。这些病毒序列扩展了已鉴定的病毒的遗传多样性，还包含了大量新型病毒序列信息，例如菊头蝠携带的痘病毒、伏翼蝠和菊头蝠以及蹄蝠携带的瘟病毒、鼠耳蝠携带的丝状病毒、果蝠携带的捷申病毒和蝙蝠泡沫病毒等。由于《人间传染的病原微生物名录》和《一、二、三类动物疫病病种名录》涵盖了人间和动物间传播的重要病原体，因此对与名录中存在较近亲缘关系的分类学单元，作为潜在威胁病原体进行重点关注和进一步的分析研究。例如黄病毒科的丙型肝炎病毒属和瘟病毒属、小RNA病毒科的甲型肝炎病毒属、副肠孤病毒属、萨佩罗病毒属、捷申病毒属、痘病毒科成员和丝状病毒科成员等。通过对瘟病毒属与蝙蝠戊型肝炎病毒属进化历史中跨种传播事件的预测分析，发现蝙蝠不仅是病毒的“捐赠者”，也常常作为病毒的“获取者”，因此后续需要客观研究蝙蝠在各种病毒传播中的角色。 本研究获得了大量蝙蝠携带病毒的序列数据，丰富了蝙蝠携带病毒数据库，还有助于提前预警潜在威胁病毒性病原体，切实为我国传染病防控和公共卫生工作提供数据支撑。
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