摘要
杨树( Populus L.)是木本植物中的模式物种之一，有着速生丰产的优秀品质。维管系统是在树的机械支持、物质运输和信号转导中起着重要的作用。维管形成层向内发育成木质部向外发育成韧皮部。影响维管发育的因素有很多，其中植物激素和次生代谢物质是其中重要的组成部分。植物激素包括生长素、细胞分裂素、脱落酸、乙烯等。次生代谢物质则包括酚类、多肽等，其中多肽是本研究中最为关注的。 CEPP多肽家族是一种末端保守的小肽家族，CEPP小肽一般来说是长度不超过200 aa的多肽。多肽前体经过剪切加工修饰形成的成熟的多肽的长度会更短。目前已经报道的符合CEPP多肽家族定义的小肽家族共有7种，其中包括了CLE（CLA V-ATA3/Embryo Surrounding Region-related）、GOLVEN（GLV）/ROOT GROWTH FA-CTORS（RGF）/CLE-Like、PSK（PHYTOSULFOKINE）、PSY1（PLANT PEPT IDE CO-NTAINING SULFATED TYROSINE1）、IDA/IDA-like（INFLORESCENCE DEFICIE-NT IN ABSCISSION-IDA-LIKE）、CEP（C-TERMINALLY ENCODED PEPTIDE）和CIF（Casparian strip integrity factor）家族，这其中CLE家族的研究最为深入。 CEPP由于其特殊性，因此只在杨树中寻找很有可能会漏掉可能的CEPP，因此采用在广泛的69个物种中一起鉴定，这样有助寻找到更多的杨树CEPP多肽。 本研究首先对CEP家族进行了鉴定，由于CEP家族和CLE家族一样都已经有了深入的研究和大规模的鉴定。并且 CEP 家族的保守基序和 CLE 家族同样是等长无且插入的因此CEP家族采用本实验已经建立的短肽家族的鉴定方法。根据已经报的916基因作为训练集对 Phytozome V12 版本的 68个物种以及欧洲云杉的基因进行鉴定，鉴定出个464个CEP基因。 对于未有大量报道的IDA/IDAL、CLEL、PSY、PSK和CIF家族，采用BLAST和 HMM 相结合的方法进行鉴定，将上述的家族在拟南芥中已经报道的成员作为BLAST 的输入数据集，得到结果再通过 HMMER3 进行鉴定，分别鉴定到 452 个IDA/IDAL、631个CLEL、491个PSY、485个PSK和221个CIF家族候选基因。并对每个家族和全部CEPP候选基因做了聚类分析推测可能的进化关系。 最终鉴定除了CLE外51个杨树的CEPP的多肽，其中得到包括10个CEP、2个CIF、13个CLEL、9个IDA/IDAL、8个PSK和9个PSY基因。
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