摘要
百色马是主产于广西百色地区的地方马品种，具有悠久的历史。根据史料记载，百色地区自古以来就是连接云南、贵州和广西三省的交通枢纽和物资集散地，马匹贸易活动频繁且历史悠久。关于百色马的起源目前尚无相关研究。为了探究百色马的起源问题，本研究基于7个国内地方品种、5个国外品种以及1个野马品种共236匹马的全基因组重测序数据，通过群体遗传结构、祖先成分和选择信号的分析方法，拟对百色马的起源和祖先成分进行深入研究，并鉴定百色马基因组受选择区域。 群体遗传结构分析结果显示，国内地方品种与国外马品种之间遗传关系较远，没有明显的基因交流，由此可知国外马对百色马品种的形成没有显著影响。在国内地方品种当中，西南马类群（德保矮马、晋江马）与百色马的关系最近。主成分、邻接树和Admixture分析结果显示，地理位置相近的品种遗传关系也较近。Treemix迁移分析结果显示，岔口驿马对百色马的品种形成具有一定的影响。通过Admixtools分析发现，岔口驿马与哈萨克马最有可能是百色马的祖先。结合前人的研究结果，本研究推测出一条从中国北方的哈萨克马与蒙古马开始，到岔口驿马再到百色马的迁移路线。结合人文历史因素，本研究推测百色马的品种形成受到地理分布邻近的西南马类群的影响，北方家马沿着迁移路线对百色马的形成产生了重要的影响。在百色马的形成过程中没有受到国外马的显著影响。 选择信号分析结果显示，百色马与晋江马在RCC1L、嗅觉受体基因、DISP1、CA10等基因上具有较强的选择信号，这些基因富集在神经系统的发育、细胞的增殖分化以及细胞粘附等通路;百色马与哈萨克马在CTIF、RTEL1、TACC2以及DISP1、CA10等基因上具有较强的选择信号，上述基因富集在DNA的合成与转录、细胞粘附等通路。 本研究探明了百色马的品种起源、群体遗传结构、与其它主要马品种的遗传关系和基因组受选择区域，这些研究成果对于百色马的品种保护以及遗传资源的开发利用都具有重要意义。
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