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基于生物信息学筛选KOA坏死性凋亡关键基因及化瘀祛湿方的干预研究

官岩兵

基于生物信息学筛选KOA坏死性凋亡关键基因及化瘀祛湿方的干预研究

官岩兵1
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作者信息

  • 1. 广西中医药大学
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摘要

目的:利用生物信息学技术联合临床干预试验探讨化瘀祛湿方对膝骨关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)坏死性凋亡关键基因表达水平的影响作用,旨在从另一途径阐述KOA发病机制提供新的思路;同时,也为分子水平上揭示化瘀祛湿方治疗KOA提供理论依据。 方法:①生物信息学部分:分别从GEO数据库与GeneCard数据库筛选KOA相关基因和坏死性凋亡相关基因,继而对两者取交集获取KOA坏死性凋亡相关基因,并进一步构建PPI网络,通过Cytoscape软件的五种计算方法得到KOA坏死性凋亡Hub基因,而后选用SD大鼠造模,取材后使用RT-PCR检测Hub基因相对表达情况,最后选取在大鼠KOA模型中差异性表达最为显著的前3个基因作为KOA坏死性凋亡关键基因(目标基因)。②临床干预试验部分:筛选出目标基因后,将符合纳排标准的42例门诊KOA患者随机分为试验组(化瘀祛湿方组)、对照组(艾瑞昔布组)两组,每组各21例;分别在治疗前及治疗后2周评估VAS评分、WOMAC评分并采取外周静脉血进行ELISA法检测目标基因的表达水平,而后进行组间、组内比较并统计总体治疗率。 结果:①生物信息学部分:共筛选出990个KOA相关基因及690个坏死性凋亡相关基因,交集后获得38个KOA坏死性凋亡基因;Cytoscape的5种不同算法进一步筛选出5个Hub基因:CYBB、FADD、IL-1β、MYC及EGFR;且RT-PCR检测提示在大鼠KOA模型中IL-1β、MYC及EGFR是差异性表达最为显著的前3个基因(P<0.05),即IL-1β、MYC及EGFR是KOA坏死性凋亡的关键基因(目标基因)。②临床干预试验部分:试验组共20例受试者(脱落1例),对照组共21例受试者完整参与受试过程;治疗前两组一般资料(性别、年龄、病程、K-L分级)及各观察指标(VAS评分、WOMAC评分和IL-1β、MYC及EGFR表达水平)无明显差别(P>0.05),具有可比性;治疗后,两组各观察指标(VAS评分、WOMAC评分和IL-1β、MYC及EGFR表达水平)组间比较有统计学意义(P<0.05);与治疗前相比,治疗后两组各观察指标(VAS评分、WOMAC评分和IL-1β、MYC及EGFR表达水平)组内比较有统计学意义(P<0.05),且就VAS评分而言,对照组差异程度大于试验组,但就WOMAC评分和IL-1β、MYC及EGFR表达水平而言,试验组差异程度大于对照组;另外总体治疗率相比,统计结果虽显示试验组为80%,对照组为74.1%,但组间比较无显著性差异(P>0.05)。 结论:①IL-1β、MYC及EGFR是KOA坏死性凋亡的关键基因。②化瘀祛湿方可起到艾瑞昔布的类似作用治疗KOA,并可能通过坏死性凋亡途径影响KOA中IL-1β、MYC及EGFR表达水平变化,且化瘀祛湿方对IL-1β、MYC及EGFR的调控作用可能强于艾瑞昔布。③单就止痛效果(VAS评分)而言,化瘀祛湿方不及艾瑞昔布;但就缓解关节疼痛、僵硬及活动度综合效果(WOMAC评分)来看,化瘀祛湿方强于艾瑞昔布。④就总体治疗率而言,化瘀祛湿方与艾瑞昔布疗效类似,无明显差别。

关键词

膝骨关节炎/坏死性凋亡/基因表达/化瘀祛湿方/止痛效果/生物信息学

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授予学位

硕士

学科专业

中医骨伤科学

导师

袁长深

学位年度

2023

学位授予单位

广西中医药大学

语种

中文

中图分类号

R6
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