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m6A去甲基化酶ALKBH5在甲状腺 乳头状癌中的表达及其临床意义研究

邓云洋

m6A去甲基化酶ALKBH5在甲状腺 乳头状癌中的表达及其临床意义研究

邓云洋1
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作者信息

  • 1. 桂林医学院
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摘要

目的:本文在生物信息学数据库中初步探讨AlkB同系物5(AlkBHomolog5,ALKBH5)在甲状腺癌中的表达情况及其与临床参数的相关性,并分析其可能参与的生物学过程和信号通路;此外,我们利用免疫组化实验检测ALKBH5在甲状腺乳头状癌中的表达情况并分析其临床意义;为ALKBH5有可能成为预测甲状腺乳头状癌进展和预后的新型生物标记及其靶向治疗提供线索。 方法:1.基于癌症基因组学图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)数据库中甲状腺癌病例资料,探究在甲状腺癌与正常甲状腺组织中ALKBH5的表达差异,并深入分析其与不同临床因素间的关系;通过使用Kaplan-Meier生存分析,探究ALKBH5在甲状腺癌组织中的表达水平是否与患者无复发生存期有关。 2.利用基因本体论(GeneOntology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)通路富集分析,分别探究在甲状腺癌中ALKBH5可能参与的生物学过程和通路。 3.通过收集在桂林医学院附属医院病理科确诊为甲状腺乳头状癌患者的术后标本并制成石蜡切片,将对应的距肿瘤边缘大于2cm以上的正常甲状腺组织作为对照组,进行免疫组化实验;使用卡方检验分析m6A去甲基化酶ALKBH5在甲状腺乳头状癌和正常甲状腺组织中的表达差异,以及与相关临床因素间的关系。 结果:TCGA数据库分析结果表明,ALKBH5在甲状腺癌中的表达低于正常甲状腺组织(P<0.001);ALKBH5在甲状腺癌中的表达与临床分期、病理分型有关(P<0.001);ALKBH5在甲状腺癌中的表达与有无淋巴结转移相关(P<0.001);不同种族、性别、年龄分组的甲状腺癌患者中ALKBH5的表达差异无统计学意义(P>0.05);ALKBH5的表达水平与甲状腺癌患者的无复发生存期相关(P<0.001);GO功能富集显示,ALKBH5在甲状腺癌中可能参与的生物学过程包括蛋白质泛素化、细胞内蛋白转运、DNA转录调控、泛素依赖性蛋白质分解代谢、内质网到高尔基囊泡介导的转运等过程;KEGG通路富集分析显示,ALKBH5在甲状腺癌中可能参与的通路包括内质网蛋白质加工、自噬信号通路、胰岛素信号通路等;免疫组化结果显示,ALKBH5在甲状腺乳头状癌中的表达低于正常甲状腺组织(P<0.01);甲状腺乳头状癌中ALKBH5的表达与有无淋巴结转移相关(P<0.05),但与患者年龄、性别、肿瘤大小无明显相关(P>0.05); 结论:m6A去甲基化酶ALKBH5在甲状腺乳头状癌中的表达低于正常甲状腺组织,且表达水平与有无淋巴结转移负相关,与年龄、性别,肿瘤大小无明显相关,提示可能参与了甲状腺乳头状癌发生发展的过程。

关键词

甲状腺乳头状癌/m6A去甲基化酶/ALKBH5/生物信息学

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授予学位

硕士

学科专业

外科学

导师

孙达欣

学位年度

2023

学位授予单位

桂林医学院

语种

中文

中图分类号

R73
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