摘要
辣椒在我国蔬菜中占据不可或缺的地位，中国市场辣椒遗传背景相对狭窄，因此利用现有辣椒品种进行遗传多样性研究对辣椒种质资源的收集和利用具有重大的意义。 针对辣椒缺乏稳定且高多态性的SNP标记问题，根据辣椒高密度遗传图谱和物理图谱的对应关系，设计了 234对KASP引物，筛选出153对高多态性辣椒KASP引物，成功率为67.9％;从中挑选出141对引物将其从引物筛选体系转化成高通量基因分型体系，转化成功130对KASP引物，转化率为92％。 根据分子标记结果，207份辣椒品种被聚成三个类群，聚类结果显示存在大量引种地来源不同的辣椒品种聚为一类的情况。遗传多样性参数显示，130个辣椒KASP标记在群体中多态性位点数为24～129个，多态性位点百分率为18.46％～99.23％;辣椒群体观测等位基因数为1.1846～1.9923;有效等位基因数为1.1446～1.5836;Nei''s遗传多样性指数为0.0798～0.3305;Shannon''s指数为0.1149～0.4861。遗传距离与遗传一致度分析显示，全国不同地区辣椒品种的遗传一致度变异范围是0.8312～0.9825;全国不同地区辣椒品种的遗传距离变异范围是0.0177～0.1849。遗传分化分析结果显示，全国辣椒品种的遗传分化程度为0.4293,群体内基因多样性为0.5445,群体间遗传分化系数为0.2019,基因流为0.9884。群体结构分析结果表明，207份辣椒品种组成的群体分为2个亚群。 构建的辣椒遗传图谱表明设计的130对辣椒KASP标记均匀分布在辣椒12条染色体上，构建了辣椒品种的DNA指纹图谱。 结论:得到一组包含130对KASP引物的均匀分布在辣椒12条染色体上的高多态性、稳定性强、适用于高通量基因分型的辣椒KASP分子标记集。所有收集到的辣椒品种基因交流广泛，不受地理位置影响，遗传分化程度低，亲缘关系近，群体结构相对简单，遗传背景相对狭窄。基于分子标记结果构建的辣椒DNA指纹图谱可用于品种鉴定。
NETL