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基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗胃癌的用药规律及作用机制

刘玲

基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药治疗胃癌的用药规律及作用机制

刘玲1
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作者信息

  • 1. 南京中医药大学
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摘要

目的: 为更好的挖掘胃癌的临床诊治经验,本研究运用数据挖掘技术,分别对国医大师胃癌医案、专业工具书所载胃癌方剂、陈玉超主任门诊胃癌病例所用药物进行分析,探讨其用药规律,并通过网络药理学方法研究核心药物治疗胃癌的作用机制,加深对中医药治疗胃癌的理解,为胃癌的临床应用提供一定的参考。 方法: (1)收集文献及图书中出现的国医大师治疗胃癌的相关医案,《肿瘤方剂大辞典》、《肿瘤良方大全》、《中国药典》、《国家中成药标准汇编》中记载的胃癌方剂以及2020年09月-2022年10月期间江苏省中医院陈玉超主任医师门诊胃癌病例。通过纳入排除标准筛选数据后,分别建立国医大师胃癌医案、工具书胃癌方剂和陈玉超主任门诊胃癌病例的原始数据库,并对数据进行规范。运用IBM SPSS Modeler 18.0和SPSS Statistic 22软件中的关联规则和聚类分析方法对所收集到的数据进行分析,通过Cytoscape 3.9.1绘制可视化网络图,挖掘潜在的药物组合和核心方药。 (2)对数据挖掘获取的中医药治疗胃癌的核心药物进行网络药理学分析。通过TCMSP数据库和相关文献收集核心药物的化学成分,使用PubChem数据库和SciFinder数据库获取化学成分的2D结构并下载SDF文件,将SDF文件导入SwissADME筛选有效活性成分,将SDF文件分别导入SwissADME数据库、SwissTargetPrediction数据库预测并筛选有效活性成分及其对应的有效靶点。通过GeneCards数据库、OMIM数据库和DRUGBANK数据库获取胃癌的疾病靶标,使用Venny2.1.0工具获取核心药物有效靶点和胃癌靶点基因的交集,构建“核心药物-活性成分-潜在靶点”网络。将潜在靶点导入STRING数据库进行PPI网络分析,并将其导入DAVID数据库获取GO和KEGG富集分析结果。利用分子对接技术获得核心成分和核心靶点的结合情况。 结果: (1)本次研究共纳入国医大师胃癌医案64例,包含226味药物,使用频率较高的药物是白术、茯苓、白花蛇舌草、太子参、白芍等,常用药对包括枳实-茯苓、石斛-太子参等。得到3个核心聚类方:①瓦楞子、仙鹤草、法半夏、太子参、麦冬、预知子、薏苡仁;②白术、党参、炙甘草;③黄芪、当归。 (2)本次研究共收集到406个工具书胃癌方剂,涉及510味药物,使用频率较高的中药分别是:白术、陈皮、茯苓、白花蛇舌草、甘草等,关联规则分析得到的常用药对为白术-党参、白术-茯苓等。聚类分析得到3类核心聚类方:①莪术、三棱;②半夏、陈皮、香附、木香、砂仁;③当归、人参、白术、茯苓、黄芪、党参、甘草。 (3)本次研究纳入陈玉超主任门诊胃癌病例113例,共出现228味药物,高频药物包括陈皮、炙甘草、白术、猕猴梨根、党参等,常用药对为陈皮-姜半夏、陈皮-白术。挖掘获取3个核心聚类方:①枇杷叶、紫苏梗、枳壳、姜半夏、神曲、鸡内金;②白芍、炙甘草;③当归、鸡血藤。 (4)13味核心药物(黄芪、党参、太子参、白术、茯苓、仙鹤草、白芍、陈皮、木香、莪术、白花蛇舌草、猕猴梨根、甘草)中112个成分(槲皮素、山奈酚、木犀草素、芹菜素、柚皮素、阿魏酸、白藜芦醇等)作用于79个胃癌相关靶点(SRC、AKT1、ESR1、EGFR等)。GO功能富集结果显示核心药物治疗胃癌的生物学过程主要涉及细胞增殖与凋亡、PKB信号和RTK信号的调控等。KEGG通路富集分析结果提示,核心药物治疗胃癌的信号通路包括PI3K-Akt信号通路、胃癌通路、HIF-1信号通路等。分子对接结果显示核心靶点与核心成分结合较好。 结论: 中医药治疗胃癌的用药特点是以扶正为主,健脾益气补其本,化痰散瘀、抗癌解毒攻其标。核心药物治疗胃癌通过多种活性成分、多个有效靶点、多条信号通路发挥作用。

关键词

胃癌/中药治疗/用药规律/数据挖掘/网络药理学

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授予学位

硕士

学科专业

中医内科学

导师

陈玉超

学位年度

2023

学位授予单位

南京中医药大学

语种

中文

中图分类号

R73
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