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RRM1基因在肾透明细胞癌中的表达、预后价值与免疫特性的相关性分析

钱城

RRM1基因在肾透明细胞癌中的表达、预后价值与免疫特性的相关性分析

钱城1
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作者信息

  • 1. 遵义医科大学
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摘要

目的: 肾透明细胞癌(KidneyClearCellCarcinoma,KIRC)是最常见和恶性程度高的肾癌病理类型。为寻找较为准确的生物标志物对于改善KIRC患者的预后至关重要。我们通过生物信息学分析核糖核苷酸还原酶亚基M1(RibonucleotideReductaseM1,RRM1)在肾透明细胞癌中的表达情况、预后价值以及与免疫特性的相关性分析,并用786-O细胞株探讨RRM1对肾癌增殖的影响。 方法: 原始资料均从癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)和高通量基因表达数据库(GeostationaryEarthOrbit,GEO)数据库中获取,运用R语言(3.6.3版本)分析RRM1在各种肿瘤中的表达状态、肾透明细胞癌的基因表达水平以及生存分析情况。还运用qRT-PCR以及IHC实验技术进行验证RRM1在肾癌的表达水平,并选择786-O细胞株构建敲低RRM1后的细胞系,进行CCK8以及克隆形成实验技术分析RRM1表达对肾癌的增殖状态。最后运用TIMER数据库分析了在肾透明细胞癌中RRM1表达和免疫细胞特征之间的相关性。 结果: 泛癌分析的结果显示包括KIRC在内的多种肿瘤中比起正常组织RRM1的表达值是上升的,接着通过人类蛋白质图谱(TheHumanProteinAtlas,THPA)数据库分析在KIRC中RRM1的表达量也处于上调状态,并且生存分析结果表明RRM1的高表达的KIRC患者生存期缩短。经过qRT-PCR以及IHC实验证实,RRM1在肾透明细胞癌中表现出显著的过表达,其中在786-O细胞株中表达量最多,这一结果为进一步研究提供了重要线索。在KIRC中,RRM1表达与细胞毒性T淋巴细胞(CD8T+细胞)(图7A,R=-0.159,Plt;0.001)、细胞毒性细胞(Cytotoxiccells)(图7B,R=-0.305,Plt;0.001)、Nkcd56brightcells亚群(图7C,R=-0.345,Plt;0.001)、浆细胞样树突状细胞(PDC)(图7D,R=-0.098,P=0.022)以及TReg细胞(图7E,R=-0.126,P=0.003)等细胞成负相关,但与树突状细胞(DC细胞)(图7F,R=0.152,Plt;0.001)、巨噬细胞(Marcophages)(图7G,R=0.261,Plt;0.001)、肥大细胞(Mastcells)(图7H,R=0.282,Plt;0.001)、未成熟树突状细胞(iDC)(图7I,R=0.155,Plt;0.001)、辅助性T淋巴细胞(Thelpercells)(图7J,R=0.261,Plt;0.001)、中央记忆型T细胞(Tcm)(图7K,R=0.395,Plt;0.001)、效应记忆型T细胞(Tem)(图7L,R=0.145,Plt;0.001)、γδT细胞(Tgd)(图7M,R=0.269,Plt;0.001)、Th17淋巴细胞(图7N,R=0.212,Plt;0.001)以及Th2淋巴细胞(图7O,R=0.321,Plt;0.001)等细胞呈正向关。并且CCK8以及克隆形成实验结果表明敲减RRM1后的786-O细胞的增殖能力明显减缓。 结论: 1、RRM1在KIRC中处于过表达状态,且与不良的预后相关,有可能变为KIRC患者的生物标志物; 2、敲减RRM1后能够抑制786-O细胞株的增殖能力; 3、RRM1在KIRC中还可能参与并调节多种免疫细胞的浸润程度。

关键词

肾透明细胞癌/RRM1基因/TCGA数据库/786-O细胞系/免疫特性

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授予学位

硕士

学科专业

泌尿外科

导师

朱建国

学位年度

2023

学位授予单位

遵义医科大学

语种

中文

中图分类号

R73
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