摘要
云南高原湖泊具有独特的生态环境,可能蕴含着具有代谢多样性的微生物资源,从其中的放线菌挖掘新颖结构的代谢产物,可为临床耐药菌感染提供抗菌先导化合物。 我们从来源于云南湖泊的样品中分离得到百余株放线菌,经形态学和分子生物学鉴定,得到68株链霉菌。以粪产碱菌(抗卡那霉素、链霉素、氨苄西林)、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等病原微生物为靶菌,从中筛选到2株活性放线菌——YIMS01863和YIMS01817;另有一株滇黄精根际土壤来源的链霉菌YINM00014,其具有抗大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌活性,通过全基因组分析,发现其有产生活性新化合物的潜力,一并纳入研究。以化学多样性和生物活性结果,确定了三株活性菌株的发酵培养基。 使用基于LC-MS/MS的分子网络技术,借助全球天然产物交互分子网络平台(GlobalNaturalProductSocialMolecularNetworking,GNPS)平台,对三株菌的发酵液建立分子网络并进行可视化分析,结果显示三株菌在发酵培养基条件下,能产生结构多样的次生代谢产物,进一步证明其具有产生新化合物的潜力。 从以上菌株的发酵产物中共获得31个单体化合物,YIMS01863产生11个化合物,其中化合物1为新天然产物,通过光谱、质谱手段,确定为全新的含有吲哚骨架的吡咯里西啶生物碱,命名为jiangchuanmycin;YINM00014产生15个化合物,其中化合物neosidomycin(14)是一种罕见的吲哚糖苷类抗生素,YINM00014为该化合物的另一生产者;YIMS01817发酵产物中分离得到5个化合物,鉴定为已知化合物。 Jiangchuanmycin(1)对H1299、MHCC97H、HCT116细胞抑制生长活性微弱,IC50分别为97.6μM、98.6μM、40.6μM;化合物1、4、5、6、14、19、22、28、30、31对粪肠球菌Enterococcusfaecalis抑制活性较弱,MIC值为128~256μg/mL;化合物6、14、16、29、31对枯草芽孢杆菌Bacillussubtilis抑制活性较弱,MIC值为128~256μg/mL;化合物6、16、17、22对白色念珠菌Candidaalbicans抑制活性较弱,MIC值为128~256μg/mL。