摘要
目的：探讨肾移植患者肺部感染的病原学特点及支气管肺泡灌洗液宏基因二代测序的诊断价值，为临床医师提供精准的诊疗依据。 方法：采用回顾性研究方法，收集2020年09月至2022年11月昆明市第一人民医院收治的81例肾移植术后初步诊断为肺部感染的患者，均已行支气管肺泡灌洗液mNGS及常规检测（血培养、BALF和痰培养及涂片染色、抗原检测、病毒核酸等）。收集患者的基线资料、主要症状、影像学检查、mNGS检测结果、常规方法结果、合并基础疾病、住院时间等资料，结合各项资料确定临床诊断。对比mNGS和常规检测方法病原菌的分布特点。以临床诊断为金标准，计算敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值等指标，比较mNGS、常规检测以及二者联合诊断的检测效能；比较mNGS与常规方法在混合感染以及各类病原体中的检出例数，并对mNGS的阴性结果进行分析。 结果： 1.在81例肾移植患者中，mNGS阳性有74例，检测出可供参考的病原体33种、127株,排名前五位的病原体有：耶氏肺孢子菌46株、巨细胞病毒25株、EB病毒6株、金黄色葡萄糖球菌4株、白色假丝酵母菌4株；常规检测方法阳性有47例，检测出可供参考的病原体20种、65株，其中排名前五位病原体有：巨细胞病毒16株、EB病毒14株、耶氏肺孢子菌8株、鲍曼不动杆菌5株、隐球菌/烟曲霉菌4株。与常规检测方法相比，mNGS检测出的菌种和菌株更为丰富。 2.与常规检测方法相比，mNGS可显著提高肾移植患者肺部感染的病原菌阳性率，差异具有统计学意义(P＜0.01)；但一致性较差(Kappa=0.060＜0.4,P＜0.001)。在两者均阳性病例中，mNGS检出的病原体数目高于常规检测，且mNGS的检测时间明显短于常规方法(P＜0.001)。mNGS在真菌检测中阳性率高于常规检测，差异有统计学意义(P＜0.05)，在细菌、病毒检测中的差异没有统计学意义(P＞0.05)。 3.通过病原学检测和临床综合分析确定临床诊断，mNGS在73例患者中检测出致病病原体，共30种，120株，其中细菌18种，真菌5种，病毒5种，非典型病原体2种；常规病原学检测在46例患者中检测出致病病原体，共19种，58株，其中细菌11种，真菌5种，病毒2种，非典型病原体1种。 4.结合临床资料及两种检测方法结果，最终77例患者确诊为肺部感染，以临床诊断为金标准，二者联合诊断、mNGS、常规检测的灵敏度分别为98.70％、94.81%、59.74%，约登指数分别为0.74、0.70、0.35，Kappa值分别为：0.737、0.515、0.076，阴性预测值分别为：75.00%、42.86%、8.82%。mNGS检测细菌、真菌的敏感度均高于常规检测，差异有统计学意义(P＜0.05)。 5.与常规检测相比，mNGS对于≥3种病原体检出率具有明显优势(P=0.005)；且在革兰阳性细菌、耶氏肺孢子菌、白色假丝酵母菌、巨细胞病毒、罕见病毒中的检验效能均高于常规检测，差异有统计学意义(P＜0.05)。 6.42例患者诊断为混合感染，mNGS对混合感染的检出率明显高于常规方法，差异有统计学意义(71.43%vs33.33%,P＜0.05)。混合感染中较常见的感染类型为病毒+真菌感染(18/42)，真菌+病毒+细菌感染(8/42)。 7.mNGS为阴性结果的7例患者，其中真阴性3例、假阴性4例。真阴性组中2例为间质性肺疾病、1例为肺腺癌；假阴性组中1例为结核分枝杆菌、1例为隐球菌、1例为曲霉菌、1例为嗜肺军团菌。 结论： 1.在肾移植术后肺部感染的患者中，mNGS在检测病原体类型、检测速度、阳性率、敏感度和混合感染诊断率等方面均优于常规检测方法，其中在耶氏肺孢子菌、巨细胞病毒和罕见病原体方面优势明显。 2.mNGS的诊断效能高于常规检测，同时二者联合检测对于病原菌的检出具有更好的价值。 3.mNGS的阴性结果有助于排除肺部感染，同时为非感染性疾病的诊断提供支持证据。
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