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油菜MYB86的转基因功能和分子互作研究

魏松震

油菜MYB86的转基因功能和分子互作研究

魏松震1
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作者信息

  • 1. 西南大学
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摘要

甘蓝型油菜(Brassica napus)是产油效率最高的油料作物之一,是我国国产植物油的第一大油源。但是油菜的产量水平低,原因是经济系数低,而且严重植株倒伏、病虫害、旱涝胁迫、高低温胁迫以及低效的机械化收割等。通过多种手段提高油菜的产量,已成为我国油菜遗传改良的重中之重。 MYB 转录因子(V-MYB avian myeloblastosis viral oncogene homologs)在植物中家族基因数量庞大,功能繁多,几乎参与调控植株生长发育与代谢的各个方面,在植物对生物胁迫和非生物胁迫的反应中也发挥重要作用。MYB86属于R2R3型MYB转录因子,其功能在植物界目前还鲜有报道。 本课题组此前研究表明,甘蓝型油菜MYB86(BnMYB86)家族在茎、根等木质化器官中优势表达,而且快速响应核盘菌诱导,推测BnMYB86同时参与调控次生壁木质化和抗病性。因此,本研究分析了BnMYB86家族的分子特征,利用超表达转基因油菜揭示了BnMYB86调控农艺性状和维管发育-次生木质化的功能。构建了甘蓝型油菜的全长cDNA文库,通过酵母双杂交(Y2H)筛库、生信预测及功能特征提出了 MYB86的候选互作蛋白,并进行了 Y2H和双分子荧光互补(BiFC)验证,揭示了 MYB86的一批互作蛋白。此外,以拟南芥MYB86启动子为诱饵进行酵母单杂交(Y1H)筛库,结合生信预测及功能特征,提出了MYB86的候选上游转录因子,并进行了 Y1H和双荧光素酶报告实验(LUC)验证,揭示了结合MYB86启动子的多个上游转录因子。 1.BnMYB86 家族的分子特征 BnMYB86家族有6个成员,基因长度1008-1073 bp,均有2个内含子,氨基酸残基数335-357,分子量37.86-40.50 kDa,等电点7.1-7.6,磷酸化位点数在38-41之间,其中丝氨酸磷酸化占比均为最高。它们编码蛋白的二级结构主要为无规则卷曲(43.42%-47.16%),其次是α-螺旋(38.10%-34.86%),延伸链和β-转角均在15%以下。在线预测显示这6个蛋白均无信号肽,亚细胞定位在细胞核中。多重序列比对和系统发生分析均表明,油菜的6个MYB86基因是拟南芥MYB86的垂直同源基因,核酸和蛋白水平的一致性均很高。BnMYB86在茎中表达量最高,角果和根叶也有显著表达,推测BnMYB86家族在茎等器官中发挥调控功能。 由于BnMYB86成员较多,且启动子序列在不同数据库间差异巨大,因此选用拟南芥MYB86启动子进行分析,并且预测proAtMYB86启动子的主要元件在-3275bp以内,5''端截短实验结果显示重要激活元件位于-500bp以内和-1500至-2000bp之间,并且在-500至-1500 bp区间和-2500至-3000 bp区间存在强烈的抑制性元件。 2.超量表达BnMYB86改善了油菜农艺性状,提高了产量 本课题组前期获得了超表达BnMYB86的转基因油菜,本研究对其农艺性状的观察显示,转基因株系收获期的株高极显著地增高16.2%,主茎的直径显著增加了 15.4%;虽然单叶面积极显著减小18.1%,但总叶片数极显著增加84.7%,总叶片面积极显著增加42.1%;一次分枝数和二次分枝数显著增加了 35.1%和28.1%,分枝长度也显著增加22.6%和30.7%,一次分枝直径增加了 14.1%;二次分枝角果数增加了 137.3%,单株总角果数增加了 24.6%,角果长度增加了 13.5%,角果宽减小26.9%;千粒重平均增加了 20.8%,单株籽粒产量显著性增加了 15.8%。此外,转基因植株的根长增加了 40.8%,侧根数增加了 28.2%。 组织解剖学观察表明,转基因植株韧皮部厚度增加了 50.9%,木质部厚度增加了 54.9%,束间纤维面积增加了 105%,维管束面积增加了 185%,木纤维面积增加了 131.2%,上、中、下部茎的抗折能力平均显著提升了 22.1%。 综上所述,超表达BnMYB86促进了油菜茎秆、叶片、分枝和根系的生长发育,增强了植株的维管束发育、次生壁木质化和抗倒伏能力,改善了油菜的株型,增加了分枝数、角果数和千粒重,进而显著增加油菜的籽粒产量,具有重要的分子育种潜力。 3.成功构建甘蓝型油菜的酵母杂交全长cDNA文库 以甘蓝型油菜中双11的幼根、成熟根、下胚轴、子叶、真叶、嫩茎、中期茎、老茎、蕾、花、角果皮、幼种、嫩种、中期种、老种等15个器官组织的混合RNA为起始材料,用DSN处理、SMART法构建了甘蓝型油菜均一化的酵母杂交全长cDNA文库,文库滴度为8.00×107 cells/ml,达到标准。随机挑选24个单菌落用载体引物菌检,均为阳性,片段均在500-2000bp之间,重组率100%。 4.MYB86蛋白与12个转录因子和1个染色质修饰蛋白互作 克隆BnMYB86-1和AtMYB86的编码区,插入pGBKT7载体,转化Y2HGold,进行毒性和自激活检测,结果表明诱饵质粒对酵母无毒性,都有自激活活性。抑制背景表达的3-AT浓度以AtMYB86为诱饵时为4mM,以BnMYB86-1为诱饵时为1mM。以BnMYB86-1为诱饵进行酵母双杂交文库筛选,最终测序比对得到37个潜在候选蛋白,其中有两个转录因子。综合Y2H筛库结果、网站生信预测结果和转基因功能研究结果,共提出了 39个MYB86的候选互作蛋白,构建拟南芥和油菜基因的相应载体,通过Y2H和BiFC点对点验证,共验证出13个互作蛋白,即MYB43、MYB55、MYB69、KANT1、KNAT5、KNAT7、STM、MYC2、ABS5、bHLH94、VOZ2、MAC5B 和 BRIP1。其中,MYB43、MYB55、MYB69、BRIP1在拟南芥和油菜中与MYB86均表现出强互作,STM和MAC5B在拟南芥中与MYB86表现出强互作,ABS5、bHLH94、VOZ2和MYC2在油菜中与MYB86表现出强互作。 5.来自NAC、MYB、DOF等家族的10个转录因子可以结合AtMYB86的启动子 根据分析将proAtMYB86截断成三部分,分别构建酵母单杂交(Y1H)诱饵载体,依次命名为pAbAi-PA86-P3、pAbAi-PA86-P2、pAbAi-PA86-P1,并进行抑制背景筛选,筛选浓度分别为 200、200、150 ng·mL-1。然后分别进行了 Y1H筛库,初步得到共5个转录因子。综合Y1H筛库结果、网站生信预测结果和转基因功能研究结果,提出了 33个候选上游调控因子,并分别与三个诱饵菌株进行了Y1H和LUC点对点实验,初步得到10个与proAtMYB86结合的转录因子。它们包括调控次生细胞壁发生的一级开关VND6,同为NAC转录因子的XND1、VNI2,二级开关MYB46、MYB83,与衰老和防卫相关的WRKY53,参与调控茎尖发生的STM,同为KNOX家族的KNAT3,两个DOF转录因子 DOF1.8 和 DOF5.6。 本研究初步解析了MYB86的功能和分子育种潜力,揭示了 MYB86的一批蛋白-蛋白互作转录因子以及结合MYB86启动子的多个上游转录因子,是对植物界MYB86调控功能与机理的重要贡献。

关键词

甘蓝型油菜/MYB86基因/分子互作/农艺性状/遗传改良

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授予学位

硕士

学科专业

作物遗传育种

导师

柴友荣

学位年度

2023

学位授予单位

西南大学

语种

中文

中图分类号

S6
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