摘要
背景及研究目的： 类风湿性关节炎（RA）是一种以侵蚀性关节炎为特征的自身免疫性疾病，目前对RA的治疗未能达到临床医生和患者的预期效果。本研究旨在从基因组水平确定新型治疗和预后靶点，并筛选出对GZMB具有潜在抑制作用的理想化合物。 研究方法： 我们对基因表达总库（GeneExpressionOmnibus，GEO）中的GSE55235和GSE55457进行了差异基因分析，然后通过绘制维恩图得到了两个差异表达基因（DEGs）列表的交集。然后，我们对交集处的DEGs进行了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析、基因本体（GO）分析和京都基因组百科全书（KEGG）分析。接着，我们下载了颗粒酶B（GZMB）的晶体结构。在随后的实验中，我们利用分子对接技术筛选出了GZMB的潜在抑制剂，然后分析了这些潜在抑制剂的毒性和水溶性，为今后的药物实验提供了参考。接下来，通过分子动力学测试这些小分子与GZMB的对接是否稳定。最后，体外实验验证了ZINC000004557101对颗粒酶B的抑制作用，MTT实验证实，ZINC000004557101可以抑制成纤维细胞的存活与增殖，并且具有浓度依赖性。 研究结果： 我们发现了352个DEGs。根据PPI网络分析，得到了20个中心基因，其中GZMB基因引起了我们研究的关注。与GZMB结合的三种强效天然化合物ZINC000004557101、ZINC000012495776和ZINC000038143593表现出较好的结合亲和力。此外，根据预测，它们还具有较低的Amesmutagenicity（致突变性）、developmentaltoxicitypotential（发育毒性潜力）、rodentcarcinogenicity（啮齿动物致癌性）以及对细胞色素P4502D6的高耐受性。分子动力学模拟表明，ZINC000004557101和GZMB具有更有利的势能，可以在自然环境中稳定存在。此外，我们最终通过MTT试验验证了ZINC000004557101对颗粒酶B的抑制作用。 研究结论： 类风湿关节炎患者的GZMB表达增加。ZINC000004557101是一种治疗RA的潜在靶向GZMB药物。
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