摘要
目的:本研究基于生物信息学方法分析探究磷酸戊糖途径相关基因在子宫内膜癌中的表达情况及其与子宫内膜癌预后的关系,构建临床预测模型,挖掘潜在生物标志物。 方法:分别从TCGA数据库及GEO数据库中下载与子宫内膜癌相关的数据集,使用GEO2R在线分析工具和R软件筛选子宫内膜癌组织与正常组织的差异表达基因,再筛选出子宫内膜癌与磷酸戊糖途径相关的差异表达基因(PRDEGs)。对PRDEGs进行功能和信号通路富集分析,采用String数据库进行蛋白质-蛋白质互作网络分析,筛选关键基因,运用Cox分析构建子宫内膜癌风险预测模型,绘制ROC及DCA曲线,探讨其对子宫内膜癌的诊断及预后价值。 结果:基于TCGA、GEO数据库,共筛选出83个PRDEGs(|logFC|>0.5且P<0.05),其中有12个关键基因与子宫内膜癌高度相关,分别是:E2F1,GPX2,TP73,EGF,MDM2,IFNG,MYC,MAPK14,FOXM1,CASP3,CYCS,CDKN2A。GO和KEGG分析显示在PRDEGs主要富集在于转录调控、缺氧应激等生物学过程,以及富集于甲状腺激素信号通路、p53信号通路等信号通路过程。GSEA和GSVA富集分析提示子宫内膜癌数据集基因显著富集在IL-6信号通路、氧化磷酸化、TP53调控转录通路等通路中。ROC分析结果显示基因TP73和MAPK14具有较高的诊断价值。Cox回归分析模型提示PRDEGs对于子宫内膜癌患者具有临床价值。重点分析TP73与子宫内膜癌临床特征的关系,结果显示TP73表达水平与子宫内膜癌的临床预后相关。 结论:磷酸戊糖途径存在多个相关基因与子宫内膜癌相关,且对临床诊断及预后有一定价值,是子宫内膜癌发生发展的潜在分子机制。作为磷酸戊糖途径相关基因之一,基因TP73在子宫内膜癌中呈差异性表达,且与疾病进展密切相关,有望成为指导临床治疗和评估患者预后的分子指标。