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河南省假俭草遗传多样性和群体遗传结构研究

吉轶楠

河南省假俭草遗传多样性和群体遗传结构研究

吉轶楠1
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作者信息

  • 1. 河南科技大学
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摘要

本研究以河南省8个居群共计141份野生假俭草(Eremochloaophiuroides)种质资源为研究对象,结合表型和SSR分子标记方法揭示了假俭草居群的遗传多样性及群体遗传结构。结合气候数据通过异常位点检测和环境关联分析找到了与环境关联的SSR位点,探究了影响河南省假俭草遗传分布格局和遗传变异的环境因子。本研究结果可为今后开发利用及保护河南省假俭草种质资源提供理论依据,为假俭草育种及开展景观基因组学研究奠定基础。本研究结果如下: (1)河南省假俭草资源不同表型性状的变异程度不同,匍匐茎叶长、草层高度、直立茎叶长及节间长度变异系数较高,花序小花数和小穗长度变异系数较小。河南省假俭草居群具有较丰富的表型多样性,可为多种用途的假俭草提供育种材料,表型遗传变异主要存在于居群内。聚类分析及Mantel检验结果均表明地理距离不是造成河南省假俭草居群表型变异的主要因素。冗余分析结果表明最干旱月份的降水量是形成河南省假俭草的表型遗传结构的主要因素。 (2)10对SSR引物共检测到99个等位基因,引物多态性信息含量为0.53~0.88,多态性条带百分率为98.75%,所选引物的多态性较高。造成河南省野生假俭草居群遗传变异的主要是居群内变异。聚类分析及Mantel检验均表明地理与遗传距离间无相关性。群体遗传结构分析与主坐标分析结果均表明大部分材料(85.11%)群体遗传背景单一,21份材料属于遗传背景较复杂的混合型群体,基因交流较频繁。冗余分析结果表明最干旱月份降水量是影响河南省假俭草种群结构的主要因素。结合BayeScan和FDIST2两种方法共同检测到4个异常位点。进一步做环境关联分析,结果表明4个异常位点都至少与一个环境变量相关。今后可进一步开展转录组学研究,进行基因功能注释,系统地揭示假俭草的适应性进化机制。

关键词

假俭草/表型性状/SSR标记/遗传多样性

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授予学位

硕士

学科专业

风景园林

导师

郑轶琦/邢辉

学位年度

2023

学位授予单位

河南科技大学

语种

中文

中图分类号

S5
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