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宏基因组二代测序技术在脊柱感染病原学诊断中的应用

王震

宏基因组二代测序技术在脊柱感染病原学诊断中的应用

王震1
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作者信息

  • 1. 福建医科大学
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摘要

目的:通过对比宏基因组二代测序(Metagenomicnext-generationsequencing,mNGS)与传统细菌培养两种技术的诊断效能,探讨mNGS技术在脊柱感染病原学诊断中的优势以及临床诊疗中的应用价值。 方法:回顾性分析2020年1月至2021年8月我科收治的最终诊断为脊柱感染并接受mNGS检测的41例患者的临床资料和mNGS检测结果。每个患者采集的标本均送检mNGS检测、传统细菌培养和组织病理学检查。描述mNGS和传统细菌培养的病原体分布情况,对比mNGS和传统细菌培养的敏感性和特异度,分析mNGS和传统细菌培养对病原体检测的一致性,并探讨影响mNGS检测结果的因素。通过比较所有患者入院时和治疗3个月后的炎症指标(白细胞计数、红细胞沉降率和C反应蛋白),监测疗效。 结果:mNGS病原体检测结果阳性26例,阴性15例。在26例阳性的mNGS标本中,共检出病原体48株,其中细菌43株(结核分枝杆菌6株、布鲁氏菌5株),真菌2株,病毒3株。传统细菌培养阳性6例,共检出6株细菌,阴性35例。组织病理学结果阳性21例,包括11例化脓性感染和10例结核,其余20例为组织病理学阴性,仅提示炎症性病变。mNGS的敏感性为80.95%(17/21),特异度为55.00%(11/20)。传统细菌培养的敏感性为19.05%(4/21),特异度为90.00%(18/20)。mNGS检测的敏感性显著高于传统细菌培养,差异具有统计学意义(P<0.001)。标本类型与mNGS检测结果具有相关性(P=0.034),选择肉芽组织作为病原体检测标本可以提高mNGS的阳性率。所有患者均完成3个月以上随访,治疗3个月后白细胞计数由(8.06?2.04)×109/L降至(7.47?1.50)×109/L(t=1.745,P=0.089),差异没有统计学意义;红细胞沉降率由(67.66?31.96)mm/L降至(19.17?10.22)mm/L(t=11.587,P<0.001),C反应蛋白由(48.56?27.60)mg/L降至(5.89?4.62)mg/L(t=9.654,P<0.001),后两者的差异具有统计学意义。 结论:mNGS技术的敏感性优于传统细菌培养,可提高临床脊柱感染患者的病原体检出率。mNGS比传统细菌培养具有更广的病原体检测谱。选择肉芽组织作为病原体检测标本可以提高mNGS的阳性率。对于传统细菌培养阴性的患者,mNGS作为一种诊断技术的补充,可提供重要的病原学证据,这在脊柱感染的临床诊疗中具有一定的应用价值。

关键词

脊柱感染/宏基因组二代测序/病原学诊断/敏感性

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授予学位

硕士

学科专业

外科学(骨外)

导师

许卫红

学位年度

2022

学位授予单位

福建医科大学

语种

中文

中图分类号

R6
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