首页|基于多组学探究绵羊对F17大肠杆菌抗性的遗传调控机制

基于多组学探究绵羊对F17大肠杆菌抗性的遗传调控机制

陈炜昊

基于多组学探究绵羊对F17大肠杆菌抗性的遗传调控机制

陈炜昊1
扫码查看

作者信息

  • 1. 扬州大学
  • 折叠

摘要

羔羊腹泻病是绵羊饲养生产过程中最为常见的问题,为绵羊养殖业带来了巨大的经济损失,F17大肠杆菌(E.coliF17)则是导致羔羊腹泻病的主要病原菌之一。流行病学调查显示,F17大肠杆菌在世界各地的羔羊与犊牛中广泛传播,且呈现较高的检出率与死亡率特征,此外,F17大肠杆菌的耐药性情况也十分严重,因此,提高宿主自身对F17大肠杆菌的免疫力和抗病力,才是解决F17大肠杆菌感染问题的有效途径。 本课题组在前期F17大肠杆菌攻毒实验中发现,在湖羊品种内部存在F17大肠杆菌易感和拮抗两种类型个体,且相关遗传变异可能是造成对F17大肠杆菌抗性差异的底层原因,因此,在分子层面上深入解析F17大肠杆菌抗性的调控机制,不仅对于理解绵羊腹泻病的病理生理过程至关重要,也能够未来的绵羊腹泻病的防治和抗病育种工作提供理论参考。本研究利用16srRNA测序、代谢组测序、转录组测序技术,结合机器学习算法,整合分析多组学数据,构建F17大肠杆菌抗性调控中肠道菌群、代谢物、宿主转录表达之间的互作网络,并筛选得到绵羊对F17大肠杆菌抗性调控网络中的关键lncRNA——DRB1-AS1。最后,通过体外验证实验,明确了DRB1-AS1通过miR-3957-5p/TFF2/CXCR4轴影响绵羊小肠上皮细胞F17大肠杆菌抗性的分子调控机制。

关键词

绵羊/调控机制/F17大肠杆菌/多组学

引用本文复制引用

授予学位

博士

学科专业

畜牧学

导师

孙伟/吕晓阳

学位年度

2024

学位授予单位

扬州大学

语种

中文

中图分类号

S8
段落导航相关论文