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基于PROTAC技术的吲哚-2-酮类BRD4降解剂的设计合成及生物活性研究

王朝阳

基于PROTAC技术的吲哚-2-酮类BRD4降解剂的设计合成及生物活性研究

王朝阳1
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  • 1. 兰州大学
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摘要

溴结构域蛋白4(BRD4)是一种表观遗传调控因子,通过结合乙酰化赖氨酸、调节c-Myc的表达调控生物学进程,其异常表达与肿瘤、炎症等疾病的发生发展密切相关。尽管有多个BRD4抑制剂进入临床研究阶段,但临床研究中出现的低效高毒和耐药性等问题,限制了抑制剂的发展。PROTAC作为一种靶向蛋白降解技术,可精准靶向并降解消除致病性蛋白,相比于传统小分子抑制剂具有催化降解功能、选择性和特异性高等优势。因此,通过PROTAC技术降解BRD4蛋白,是一种针对BRD4靶点的有效的癌症治疗策略。 化合物Y47为课题组前期基于PFI-1通过骨架跃迁策略研发的吲哚-2-酮类BRD4抑制剂,具备良好的BRD4抑制活性,但肿瘤细胞抗增殖活性较弱,需进一步优化。本论文基于化合物Y47,采用不同的Linker和E3泛素连接酶配体,设计合成23个吲哚-2-酮类BRD4降解剂,经细胞抗增殖活性和蛋白降解活性筛选,得优选化合物P6。化合物P6能有效抑制MV-4-11细胞增殖(IC50=0.64±0.02μM),对正常细胞系WI-38毒性较低(IC50>100μM),并对BRD4蛋白具有良好的降解活性(DC50=1.07±0.11μM,D%=75.9%)。BRD4蛋白降解机制表明,化合物P6以浓度和时间依赖降解蛋白,进一步的分子建模对接和动力学模拟显示,P6可以与BRD4和VHL蛋白中的多个关键氨基酸(Asn433,Tyr98,Arg107,Ser111和His115等)相互作用,并形成稳定的三元复合物(RMSD<2?)。此外,化合物P6通过下调c-Myc的表达、阻滞细胞周期、诱导细胞凋亡和上调促凋亡蛋白的表达(BAD和BAX蛋白)发挥抗肿瘤活性。类药性评价结果显示化合物P6有良好的肝微粒体代谢稳定性(t1/2=49.5min;Cl=0.028mL/min/mg)。 综上所述,基于PROTAC技术,发现一类吲哚-2-酮BRD4降解剂,为解决BRD4抑制剂的低效及毒性问题提供了一定的理论依据和经验总结,并为白血病药物的研发提供一定的研究基础。

关键词

BRD4抑制剂/吲哚-2-酮/PROTAC技术/抗肿瘤活性

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授予学位

硕士

学科专业

药学

导师

陈世武

学位年度

2024

学位授予单位

兰州大学

语种

中文

中图分类号

R9
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