摘要
我国地方鸡遗传资源丰富，外来引进品种众多，有效保护地方鸡种质资源、合理保存引进品种资源一直受到业界和遗传育种工作者们高度关注和重视。开展种质资源亲缘关系鉴定，为种质资源评价、良种繁育和地方鸡遗传资源保护、开发与利用奠定基础。本研究应用SSR分子标记技术，将20个微卫星标记位点对6个地方鸡种、3个引进品种进行了基因分型和遗传多样性分析。根据基因分型、数字化DNA指纹图谱构建和亲缘关系分析，研究结果如下： 试验一：鸡微卫星DNA遗传多样性分析 20个微卫星位点在6个地方鸡种，3个引进鸡种中共检测出355个等位基因，多态信息含量均值为0.916。9个群体的有效等位基因数在3.322~6.993之间；观测杂合度在0.163~0.529之间；期望杂合度在0.699~0.860之间；多态信息含量在0.663~0.829之间；9个群体的固定指数在0.382~0.810之间；计算了不同品种之间的Nei氏遗传距离并构建了系统发育树。各组微卫星位点多态信息含量丰富，可用于数字化DNA指纹图谱的构建及地方鸡种之间的亲缘关系分析。 试验二：数字化DNA指纹图谱的初步构建 20个微卫星位点在6个地方鸡种，3个引进鸡种中共检测出403个基因型，平均检测出44.77个基因型。通过将引物组进行组合，筛选出引物MCW120、MCW150、MCW0183及组合引物AM225+32，用于构建198个实验样本的数字化DNA指纹图谱。并从每个种群中随机选择4个样本进行了专属二维码的构建，二维码中包括样本的品种、名称、该样本的数字化图谱及构建数字化图谱所需的引物。 试验三：DNA指纹图谱地方鸡种间亲缘关系分析 基于构建DNA指纹图谱所筛选出的引物组合对6个地方鸡种进行亲缘关系分析。结果显示，6个地方鸡种间的遗传距离DA为0.3180~0.4333，品种间遗传相似系数为0.575~0.6822。聚类结果表明莱芜黑鸡和琅琊鸡亲缘关系最近，京红一号蛋鸡与寿光黑鸡、吉林黑鸡与济宁百日鸡亲缘关系较近。 本研究初步构建的数字化DNA指纹图谱，为种质资源鉴定及保护奠定了基础。
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