摘要
兰州鲇（Silurus lanzhouensis）是黄河中上游特有的大型底层经济肉食性鱼类，味道鲜美，肉质紧实，具有很高的营养价值，被誉为“黄河鲶鱼活人参”。但因近年来兰州鲇市场需求不断扩大及网箱养殖增加，兰州鲇频繁出现易患病、苗种培育成活率低下、良种选育优势不足等现象，严重阻碍了兰州鲇养殖产业可持续发展。为提升兰州鲇苗种成活率和加大对兰州鲇重要经济性状改良工作，推动兰州鲇产业发展，本研究以 13 个家系 3 月龄兰州鲇为研究对象，采用通径分析等方法探索影响兰州鲇体重的主要性状，利用全基因关联分析（Genome-wide association study, GWAS），筛选与生长性状密切相关的分子标记，挖掘影响生长性状的候选基因，进一步利用最佳线性无偏预测法（Best linear unbiased prediction，BLUP）和基因组最佳线性无偏预测法（Genomic best linear unbiased prediction， GBLUP）比较了兰州鲇育种过程中遗传参数估计值和育种值。主要研究结果如下： （1）对兰州鲇3月龄4个不同生长性状对体重（Y）的影响进行了评估，4个生长性状包括体长（X1）、全长（X2）、头长（X3）和体高（X4），其次通过曲线模型拟合找到单个生长性状对体重的最优拟合模型，各生长性状与体重之间呈极显著正相关（P＜0.01），但相关性在不同生长性状之间存在差异；通径分析显示，3月龄兰州鲇4个生长性状对体重的通径系数均达到极显著水平（P＜0.01），体长对体重的直接作用最大，决定系数分析和通径分析结果一致。通过偏回归系数检验显著（P＜0.01）性状，建立与体重相关多元回归方程:??=?180.947?16.269??1+40.613??2+72.757??3?165.866??4，相关指数R2为6.488，远远大于0.85，说明体长等是影响兰州鲇体重的主要生长性状。 （2）利用兰州鲇 50K 液相芯片（Genotyping by pinpoint sequencing of liquid captured targets of 50K，50KcGPS）进行兰州鲇体重、体长、全长、头长和体高性状的全基因组关联分析。曼哈顿图（Manhattan plot）显示与生长性状显著相关的单核苷酸多态性位点（Single nucleotide polymorhism, SNP）分布于多条染色体上，共筛选到 12 个与 5 个生长性状显著关联的SNP位点，两个主成分对遗传结构的累计方差贡献率为17.907%，表明兰州鲇生长受多基因控制；基因注释共挖掘出17个候选基因，存在一因多效性，通过对应注释文件和Pathway 注释分析得知这些候选基因参与了细胞增殖分化、骨骼肌的形成等与生长发育和代谢通路有关的调控过程。 （3）基于兰州鲇50K液相芯片（50KcGPS）利用BLUP、GBLUP法对兰州鲇5个生长性状遗传参数和育种值进行评估。结果显示，除了体高外，其余性状采用BLUP法估计的遗传力在0.988~0.999之间，属于高等遗传力；而基于GBLUP法估计的遗传力均在中等水平；基于GBLUP 法估计体长、全长、头长和体高的表型和遗传相关系数均表现为高度正相关（r=0.891~0.999）；两种方法比较得知F-202306150807家系和F-202306040612家系各生长性状育种值相比较优于其他家系。综上所述，需要结合遗传力、遗传相关系数以及育种值，重点以兰州鲇体重、体长、全长和头长作为选育的主要目的性状，体高作为选育辅助性状，以兰州鲇F-202306150807家系和F-202306040612家系为亲鱼作为选育和繁殖亲本重点养殖培育，可为兰州鲇种质资源和苗种培育提供技术支撑。
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