摘要
对羟基苯甲酸(para-hydroxybenzoicacid,PHBA)是重要的芳香族化合物,广泛应用于聚酯等高分子材料的生产,并在抗菌药物中发挥重要作用。与依赖于石油的化学合成法相比,微生物发酵法为PHBA的生产提供了一种绿色可持续的生产方法。然而,复杂的胞内代谢通量分布和产物毒性限制了微生物生产PHBA的能力。本研究基于化学计量分析,选择了一株实验室保藏的高产苯丙氨酸的大肠杆菌(Escherichiacoli)作为生产PHBA的底盘菌株,并通过启动子工程、模块化工程等系统代谢工程策略提高了PHBA的产量。此外,通过构建并应用加速适应性进化系统,显著提高了菌株的耐受和生产能力。最后,通过优化发酵条件,实现了PHBA的高效生产。主要研究结果如下: (1)基于化学计量分析筛选底盘菌株:首先,通过化学计量分析微生物合成PHBA的代谢途径,选择PEP/E4P需求比例与PHBA合成相同的芳香族氨基酸生产菌株,作为生产PHBA的备选底盘菌株。其次,通过阻断下游途径,过表达EcubiC强化PHBA的合成,成功构建生产PHBA的底盘菌株。摇瓶测试表明,苯丙氨酸高产菌株最适合作为底盘菌株,PHBA产量达到0.68g·L-1。 (2)系统代谢工程改造促进PHBA生产:首先,基于关键节点将整个合成路径划分为三个模块,并通过引入aroGS180F、ppsA和tktA,敲除poxB和ldhA,提高了DAHP的供应。其次,通过启动子工程,优化了模块二中关键酶aroB和aroE的表达水平,实现了碳代谢流富集。进一步地,通过体外级联确定了模块三中的关键酶AroA和AroC,并在体内实现了代谢重构,得到的工程菌株E.coliPHBA05的PHBA产量达到3.97g·L-1,但质粒负担导致的生长抑制使菌株的最大OD610仅为25.1。最后,通过拷贝数优化、RBS工程和重复表达策略优化模块间的代谢流,得到的工程菌株E.coliPHBA07在摇瓶中的PHBA产量为6.35g·L-1,在5L发酵罐水平的PHBA产量、得率和生产强度分别为14.17g·L-1、0.15g·g-1和0.30g·L-1·h-1。 (3)适应性进化提高耐受和生产能力:首先,基于文献调研,设计由突变模块和传感模块构成的加速适应性进化系统。其次,借助不同的抗生素对突变模块的诱变效率、突变位点及突变谱系等进行探究,确定了最优突变模块Mutator2。此外,研究了传感模块PyhcN-mKate2对PHBA浓度的响应。最后,将进化系统应用于工程菌株E.coliPHBA07,进化终点的PHBA浓度为7.75g·L-1,比对照株提高了35%;得到的最优突变株的摇瓶产量为8.12g·L-1,比E.coliPHBA07提高了28%,IC50为6.59g·L-1,比E.coliPHBA07提高了47%。 (4)发酵优化实现PHBA高效生产:为了进一步释放菌株的生产潜力,提高PHBA产量和得率,对发酵过程中的pH和诱导OD进行了优化。当pH维持在6.9,OD为19时进行诱导,对PHBA的生产最为有利。在最优发酵条件下,对补糖速率进行精细调控,E.coliPHBA09的PHBA产量、得率和生产强度分别达到21.35g·L-1、0.19g·g-1和0.44g·L-1·h-1。