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绿壳蛋鸡蛋壳颜色深浅候选基因挖掘

黄艳琼

绿壳蛋鸡蛋壳颜色深浅候选基因挖掘

黄艳琼1
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作者信息

  • 1. 广西科技大学
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摘要

为研究绿壳蛋鸡新品系L系生产性能,不同绿壳颜色的蛋品质差异以及进一步挖掘影响绿壳颜色深浅的基因共表达网络模块及关键基因,试验选取1日龄L系母鸡1000只,记录1~48周体重,开产后进行个体产蛋记录至48周,测定44、50周龄体尺。63周龄时选取20只体重相近的母鸡进行屠宰性能与肉品质测定。对L系个体绿壳蛋颜色主效基因SLCO1B3进行分型,选取O/O基因型个体,根据蛋壳颜色分成浅酱色、深酱色、浅绿色与深绿色四组,于50、56和63周从四组各选取30枚蛋进行蛋品质测定。63周龄时从四组各选5只鸡,采集子宫部位组织样品进行转录组测序,进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)。结果如下: 1、L系生长曲线拟合结果表明:以Gompertz和VonBertalanffy模型对生长拟合度最好,R2都为0.997,VonBertalanffy模型的拐点周龄为7.887W,拐点体重为458.78g。L系产蛋率曲线拟合结果表明:Yang-Ning模型对产蛋率进行拟合的效果最好,拟合度为0.995,63周龄全净膛率为67.98%,屠宰率为94.51%。 2、50、56、63周龄时,四组之间蛋形指数、蛋壳强度、蛋黄颜色以及蛋壳重均无显著差异(P>0.05),50周龄时浅酱色组蛋白高度与哈氏单位均显著高于其它3组(P<0.05),56周龄时深酱和深绿色组蛋白高度与哈氏单位显著低于浅酱色组(P<0.05),63周龄时浅酱色组哈氏单位与蛋白高度均显著高于其它3组(P<0.05)。 3、WGCNA分析共将23421个基因划分为79个网络模块,其中4个网络模块可能与蛋壳颜色相关,分别是orange4(R=-0.49,p=0.03)、darkolivegreen1(R=-0.47,p=0.04)、green4(R=0.5,p=0.03)和chocolate4(R=-0.49,p=0.03)模块,通过基因与性状相关性GS>0.2和基因与模块相关性MM>0.8筛选出模块中的枢纽基因,chocolate4模块中发现70个枢纽基因,我们重点关注chocolate4模块,通过GO富集分析,主要集中在与线粒体活动和钙离子通道有关的通路上,其中4个候选基因SLC37A4、TIMM21、C10orf88和TOMM20,可能与绿壳颜色深浅的形成有关。 综上所述,L系屠宰率、全淨膛率分別在90%和60%以上,浅酱色组蛋白高度和哈氏单位最好。chocolate4模块显著与绿壳颜色深浅相关,其中SLC37A4、TOMM20、C10orf88和TIMM21可能是影响绿壳颜色深浅的关键基因。

关键词

绿壳蛋鸡/蛋壳颜色/转录组测序/加权基因共表达网络分析

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授予学位

硕士

学科专业

畜牧

导师

郭兴/姚爱叶

学位年度

2024

学位授予单位

安徽农业大学

语种

中文

中图分类号

S8
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