摘要
蚧虫（Scale insects）隶属于半翅目（Hemiptera）蚧总科（Coccoidea），个体微小，体被蜡质，分布较广，危害性强，全世界记录蚧虫32科8000多种。目前，蚧总科分子系统发育方面的研究主要集中在蚧科、粉蚧科物种间的关系，对其内共生菌的研究仅有粉蚧科部分物种报道，存在相同的内共生菌。本研究利用高通量二代测序技术获得蚧总科部分物种线粒体基因组序列、单拷贝核基因序列以及内共生菌基因，进行系统发育和进化分析，主要研究结果如下： 1、本研究共获得蚧总科6科8属9个物种线粒体基因组序列，其中得到柑橘绿棉蚧线粒体全基因组序列，其余物种各获得7-11个蛋白编码基因。AT含量介于79.0%-90.3%之间，呈明显的AT偏好性。蛋白编码基因的起始和终止密码子均分别为标准的ATN和TAA或TAG。联合GenBank相关数据构建蚧总科8科20个物种ML系统发育树，结果支持粉蚧科和盾蚧科的单系性。仁蚧的高桥仁蚧与蚧科的朝鲜毛球蚧为姊妹种，然后嵌入蚧科其他物种中； 2、使用BUSCO软件对测得的蚧总科物种基因组组装质量进行评估，筛选单拷贝核基因，从GenBank中下载相关序列，构建ML基因树和物种树，结果显示拓扑结构一致。分歧时间估计推测古蚧类与新蚧类的分化时间在三叠纪早期（243.8-275.3Ma），蚧科和粉蚧科的分化时间在侏罗纪到三叠纪之间（187-258Ma），绒蚧科与胭蚧科的分化时间在白垩纪到侏罗纪之间（93.48-196.41Ma）； 3、从GenBank下载蚧总科cox1和EF-1α序列，联合本研究测得的序列，分别构建的蚧总科物种的ML系统发育树，联合基因序列分析结果支持粉蚧科、盾蚧科及壶蚧科的单系性。联合构建的系统发育树支持珠蚧科、粉蚧科、蚧科和盾蚧科的单系性，胭蚧科和毡蚧科形成姐妹群； 4、本研究从浅层二代基因组数据中挖掘蚧总科物种内共生菌序列，获得了草履蚧和吹绵蚧的内共生菌Walczuchella monophlebidarum、扶桑绵粉蚧和柑橘绿棉蚧的内共生菌Tremblaya phenacola全基因组序列。基因组大小介于140,625bp-296,040bp之间。基于蛋白编码基因构建的内共生菌Tremblaya princeps与宿主蚧虫单拷贝核基因构建的系统发育关系显示存在平行演化关系。
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