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基于生信学分析对IL7R在肺腺癌中表达及预后价值的研究

陈燕

基于生信学分析对IL7R在肺腺癌中表达及预后价值的研究

陈燕1
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作者信息

  • 1. 锦州医科大学
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摘要

目的 本研究通过GEO数据库和生物信息学技术,探讨了候选基因IL7R在肺腺癌及对照组织中的表达差异,验证IL7R表达水平与肺腺癌患者的临床病理特性及预后之间的相关性。 方法 通过GEO数据库获取肺腺癌相关的基因表达数据集GSE31547、GSE31548、GSE43458、GSE75037,并应用|Log2FC|≥2作为标准进行差异基因的筛选。使用UALCAN平台进一步验证候选基因在肺腺癌及癌旁组织中的表达差异。利用Kaplan-Meier数据库评估候选基因的表达与肺腺癌患者预后之间的相关性。借助GEPIA数据库分析候选基因在多种癌症中的表达情况。确定IL7R为研究的候选基因。通过STRING数据库探索IL7R相关的蛋白质及其参与的生物学通路。收集本院80例肺腺癌及30例癌旁组织的病理诊断资料和石蜡标本,用于组织切片的制备。应用免疫组化技术,对比肺腺癌及癌旁组织中IL7R的表达差异。探讨IL7R的差异表达与肺腺癌患者的临床病理特征及5年生存率之间的联系。 结果 1、通过对GEO数据库中肺腺癌相关的数据集GSE31547、GSE31548、GSE43458、GSE75037的分析,差异基因的鉴定结果分别为:GSE31547显示431个差异基因,其中97个上调,334个下调;GSE31548显示154个差异基因,其中33个上调,121个下调;GSE43458显示824个差异基因,其中209个上调, 615个下调;GSE75037显示2550个差异基因,其中1428个上调,1122个下调。韦恩图分析进一步筛选出包括IL7R在内的25个关键差异表达基因,确定IL7R作为研究的重点候选基因。 2、UALCAN对TCGA数据分析表明,肺腺癌组织中IL7R表达显著低于癌旁组织(P=1.85e-12),差异具有统计学意义。 3、Kaplan-Meier数据库分析揭示,IL7R高表达患者的总生存率显著高于低表达组(P=9.9e-6,HR=0.68),差异具有统计学意义。 4、GEPIA泛癌分析显示,肺腺癌中IL7R表达显著下调,与癌旁组织相比具有统计学意义。 5、免疫组化分析表明,肺腺癌组织中 IL7R 蛋白表达低于癌旁组织(P=0.036),差异具有统计学意义。 6、Kaplan-Meier生存分析表明,IL7R高表达组的5年总生存率显著高于低表达组(Log-rankχ2=6.025,P=0.014),表明IL7R高表达与较好的五年生存率正相关。 7、COX 回归模型分析表明, IL7R 表达[HR=0.057, 95% CI(0.24-0.136), P=0.0001]为肺腺癌独立的预后因素。 结论 1、通过整合GEO数据库与GEPIA、Kaplan-Meier Plotter、UALCAN等平台的分析,成功筛选出与肺腺癌差异表达及预后显著相关的关键基因IL7R。 2、应用蛋白互作网络分析研究IL7R 通过参与白介素7介导的信号通路、参与细胞因子介导等信号通路影响肺腺癌的发展。 3、肺腺癌组织中IL7R的表达显著低于癌旁组织,IL7R的下调可能促进了肺腺癌的发展,IL7R在肺腺癌的发生发展中具有一定的重要作用。 4、IL7R高表达在肺腺癌患者中预示良好预后,成为潜在的预后指标。

关键词

肺腺癌/白细胞介素7受体/临床病理/预后评估/生物信息学

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授予学位

硕士

学科专业

肿瘤学

导师

哈敏文

学位年度

2024

学位授予单位

锦州医科大学

语种

中文

中图分类号

R73
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