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小花棘豆内生真菌Alternaria oxytropis OW7.8中swnH2基因功能对苦马豆素合成的影响

李丹

小花棘豆内生真菌Alternaria oxytropis OW7.8中swnH2基因功能对苦马豆素合成的影响

李丹1
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作者信息

  • 1. 内蒙古师范大学
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摘要

疯草主要指含苦马豆素(Swainsonine,SW)的棘豆属(OxytropisDC.)和黄芪属(AstragalusL.)有毒植物,对于草原畜牧业危害巨大。小花棘豆(OxytropisglabraDC.)是内蒙古草原主要的疯草物种,牲畜食用一段时间疯草后会出现中毒症状,如肌肉震颤、呕吐、母畜流产、公畜不育及死亡。经研究发现,小花棘豆的毒性来源并非植物本身,而是由其内生真菌Alternariaoxytropis产生的SW引起。 swnH2基因是SW合成相关基因簇成员,编码α-酮戊二酸和铁(Ⅱ)依赖性加氧酶。课题组前期构建了Alternaria.oxytropisOW7.8的swnH2基因敲除载体,本研究将swnH2基因敲除载体转化A.oxytropisOW7.8原生质体,构建和筛选出swnH2基因敲除突变株ΔswnH2,利用HPLC-MS检测其菌丝体SW水平,分析swnH2基因功能对SW合成的影响;对OW7.8与ΔswnH2进行高通量有参转录组测序及代谢组检测分析,主要研究结果如下: (1)将swnH2基因敲除载体通过PEG介导转化A.oxytropisOW7.8原生质体,利用同源重组敲除swnH2基因,在含Hyg(2μg/ml)的PDA培养基中筛选转化子,利用PCR和测序技术进行验证,筛选出基因敲除株ΔswnH2,与野生株相比,ΔswnH2菌落形态有所不同,生长初期为乳白色,形状不规则,呈松散颗粒状,正面背面均无色素积累,生长速度缓慢,生长后期菌落呈淡黄色,形状呈片层状堆叠;ΔswnH2菌丝体变短,指端膨大、隆起,部分菌丝体表面向内凹陷,整体结构致密。 (2)利用乙酸-氯仿溶液提取生长20d的A.oxytropisOW7.8和ΔswnH2菌丝体的SW,SW进入水相后,以阳离子交换树脂进行纯化、氨水进行洗脱,利用HPLC-MS技术检测菌丝体中SW水平,ΔswnH2中未测到SW,A.oxytropisOW7.8中的SW水平为111.83±61.940μg/g,说明swnH2基因功能促进SW的合成。 (3)利用IlluminaNovaSeq6000高通量测序平台对生长20d的A.oxytropisOW7.8和ΔswnH2进行转录组测序分析,共有2489个差异表达基因,其中1186个上调、1303个下调,进行了GO和KEGG功能富集分析;利用高分辨质谱(HRMS)技术对生长20d的A.oxytropisOW7.8和ΔswnH2进行代谢组检测,PCA分析、代谢物注释及分类,共有607个差异代谢物,其中398个上调、209个下调,利用KEGG和HMDB数据库对代谢产物进行富集分析,综合转录组和代谢组数据,推测和细化了A.oxytropisOW7.8中SW合成途径。 (4)利用RT-qPCR技术检测ΔswnH2和A.oxytropisOW7.8菌株中SW合成相关基因表达,结果显示sac、swnR、swnN、swnK、swnH1基因表达均下调,P5CR基因表达变化不显著。 (5)将swnH2cDNA与载体pBARGPE1-mCherry连接,构建出swnH2基因功能互补载体,含gPDA启动子、Trpc终止子,选择标记基因分别为Bar(真菌)、AmpR(E.coli)。 基于以上结果,推测A.oxytropisOW7.8内生真菌中与SW合成密切关联基因及SW合成途径,为明晰A.oxytropis中SW合成的分子机制与代谢途径提供基础数据,对于预防牲畜疯草病和疯草的控制利用有重要意义。

关键词

小花棘豆/内生真菌/苦马豆素/SWN基因簇/swnH2基因

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授予学位

硕士

学科专业

生物化学与分子生物学

导师

卢萍

学位年度

2024

学位授予单位

内蒙古师范大学

语种

中文

中图分类号

S8
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