摘要
随着分子技术的发展，分子标记辅助选择技术已成为番茄育种的常规手段。分子标记技术具有周期短和准确性高的特点，可以进行单株基因型分析，在缩短育种进程、加快品种选育方面具有显著优势。本研究通过番茄已知序列信息开发SNP和InDel功能标记（前景标记），通过番茄基因组重测序信息开发InDel背景标记，同时使用前景标记与背景标记对番茄育种材料进行分析，以提高选种效率，加速育种进程。主要研究结果如下: （1）针对已知的5个番茄抗病基因Tm-2,Pto,Sw-5,Ve1,Ty1和2个农艺性状基因ovate,sp的基因序列，设计开发了7个SNP标记和1个InDel标记。利用HRM技术对已知材料进行验证，上述标记均能准确鉴定目的基因的基因型;另外，通过验证已发表的Mi基因的共显性标记PMi的有效性，明确该标记可用于番茄线虫抗性辅助筛选。 （2）使用PMi标记和本试验开发的Ty1-InDel标记对本课题组的83份番茄材料进行鉴定，结果显示83份材料中有24份兼抗根结线虫和番茄黄化曲叶病毒，9份单抗番茄黄化曲叶病毒，18份单抗根结线虫。 （3）利用开发的372个InDel标记，对8份高代稳定材料和3组不同世代的群体材料进行背景分析发现:经过人工选育的8份高代稳定材料的杂合度虽然很低，但仍难以达到100％的纯合水平，在3组低代材料及其衍生系材料中，经过多代的选育，材料的杂合度降低，但高代材料在分子水平上仍存在一定程度的杂合。 （4）利用背景标记对4个F2分离群体的传统入选单株进行遗传分析，结果表明部分入选单株之间存在较高的遗传相似度，这是传统选择效率较低的原因。结合前景标记分析，从4个分离群体的入选单株中初步筛选了33份杂合度较低且遗传关系较远的单株。这些单株可作为重点株系进行下一轮的育种筛选。
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