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乙酰辅酶A羧化酶α在肝癌中的临床意义及靶向价值研究

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目的 1.探讨乙酰辅酶A羧化酶α(Acetyl-CoAcarboxylasealpha,ACC1)在肝细胞肝癌(HepatocellularCarcinoma,HCC)中的表达及其与肝癌患者临床病理参数之间的关系。 2.明确ACC1的编码基因ACACA对肝癌细胞增殖、迁移等恶性表型的影响。 3.初步研究ACC1调控肝癌恶性表型的分子机制。 方法 1.应用生物信息学分析,基于癌症蛋白质组图谱(TheCancerProteomeAtlasPortal,TCPA)数据库中筛选出具有显著预后意义的蛋白—ACC1。应用Oncomine(https://www.oncomine.org/)数据库分析ACC1编码基因ACACA在泛癌中的表达水平。 2.使用肿瘤免疫分析资源(TumorImmuneEstimationResource,TIMER)数据库进行ACACA的泛癌表达分析,利用HCCDB数据库对ACACA在肝细胞癌各亚组中的表达进行分析。 3.在癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)数据库中评价在高表达ACACA和低表达ACACA肝癌样本中干性指数的差异,并初步探索ACACA与免疫细胞浸润的关系。 4.运用基因本体(GeneOntology,GO)、京都基因与基因组百科全书(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)等富集分析预测ACACA与相关细胞信号通路的关系。单细胞转录组测序(Single-cellRNAsequencing,scRNA-seq)数据集分析ACACA在肿瘤微环境(Tumormicroenvironment,TME)中的表达特征。 5.通过细胞功能实验包括细胞计数试剂盒-8(CellCountingKit-8,CCK8)实验、划痕实验、Transwell实验、肿瘤成球实验、流式细胞术等,明确ACACA在HCC细胞恶性生物学行为中的潜在调控作用。 6.通过生信分析以及分子生物学实验,探索ACACA调控HCC细胞上皮间质转化(Epithelial-mesenchymaltransition,EMT)及Wnt/β-catenin信号通路的分子机制。 结果 1.基于TCPA数据库,发现ACC1是唯一在总生存期(Overallsurvival,OS)、无病生存期(Diseasefreesurvival,DFS)和无进展生存期(Progressionfreesurvival,PFS)中皆具有统计学意义的蛋白,提示其可能为潜在的肝癌预后标志物。 2.在TCGA数据库中进一步分析ACC1的编码基因ACACA,结果显示,与正常组织相比,ACACA在HCC中显著高表达,且与HCC患者的OS、疾病特异性生存期(Diseasespecificsurvival,DSS)、无进展间隔期(Progressionfreeinterval,PFI)显著相关。 3.定量逆转录聚合酶链反应(Quantitativereversetranscriptionpolymerasechainreaction,qRT-PCR)技术验证敲低效率,结果显示转染了si-ACACA-1#,si-ACACA-2#的SK-Hep1肝癌细胞系敲低成功。 4.在瞬时转染的敲低细胞系中进行划痕、Transwell、克隆、细胞周期以及干性成球等功能实验,结果显示敲低ACACA可以明显抑制肝癌细胞的迁移、增殖、克隆形成和自我更新能力。 5.ACACA与Wnt/β-catenin信号传导和肿瘤干细胞(Cancerstemcells,CSC)特性显著相关,进一步相关分析表明,ACACA与Wnt通路标记物(β-catenin、CTNNB1、CCND1、MYC)和肿瘤干细胞标记物(CD44、PROM1、POU5F1)呈正相关。敲低ACACA显著降低了细胞核中β-catenin的荧光强度。蛋白免疫印记显示,抑制ACACA表达可显著下调SK-Hep1细胞中β-catenin、CD44、c-Myc和CyclinD1的表达水平。此外,ACACA沉默诱导Vimentin和N-cadherin表达下调,E-cadherin表达上调,表明其参与EMT过程。 6.在TCGA-LIHC数据集中研究了ACACA表达与免疫细胞浸润之间的关系。通过单样本基因集富集分析(Single-samplegenesetenrichmentanalysis,ssGSEA)分析了ACACA水平与24种免疫细胞的相关性。ACACA的表达与嗜酸性粒细胞、T辅助细胞、Tcm和Th2细胞呈正相关,与DC细胞、CD8+T细胞和NK细胞呈负相关。单细胞数据集分析显示,ACACA可明显富集在CD8+T细胞等免疫细胞亚群中。以上结果提示ACACA在TME中具有潜在调控作用。 结论 通过TCPA数据库筛选出肝癌中唯一具有预后意义的蛋白—ACC1,进一步在TCGA-LIHC数据库中明确了其编码基因ACACA在肝癌中高表达且与预后差相关。敲低ACACA可以显著抑制HCC细胞的迁移、增殖、克隆形成以及自我更新能力。ACACA可能参与肿瘤免疫微环境的调控。机制分析显示,ACACA可能通过激活肝癌细胞上皮间质转化及Wnt/β-连环蛋白信号通路促进肝癌进展。本研究提示ACACA可能是HCC的潜在生物标志物和分子靶点。

王鑫

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肝癌 乙酰辅酶A羧化酶α 恶性表型 靶向治疗

硕士

临床医学;肿瘤学

郑文杰

2024

南通大学

中文

R73