摘要
目的构建与基因组不稳定性（genomicinstability，GI）相关的新型mRNA特征来预测肺腺癌（lungadenocarcinoma，LUAD）患者的临床预后及免疫浸润。 方法1.结合肿瘤基因组图谱（TheCancerGenomeAtlas，TCGA）数据库中LUAD的mRNA表达谱和体细胞突变谱，筛选出了与GI相关的mRNA（GI-associatedmRNA，GImRNAs）；2.通过单变量Cox回归分析获得了与预后相关的GImRNAs。通过多变量Cox回归分析，这些mRNA获得了风险系数，从而构建了与GI相关mRNA特征（GI-associatedmRNAsignature，GImRNASig）。通过ROC曲线评估特征的性能；3.通过TIDE、ESTIMATE、ppRophetic和CIBERSORT程序包比较了高风险组和低风险组的免疫治疗效果、肿瘤微环境（tumormicroenvironment，TME）、化疗药物敏感性和免疫细胞浸润；4.采用蛋白免疫印迹分析（westernblot，WB）和实时荧光定量聚合酶链反应（quantitativereal-timepolymerasechainreaction，qRT-PCR）检测LUAD组织及配对癌旁组织中ESCO2的表达水平；5.通过检测ESCO2蛋白表达水平在330例LUAD患者组织芯片的免疫组织化学染色结果，并分析其与LUAD患者的临床病理特征之间的相关性。 结果通过筛选获取五个与GI相关的mRNA用于构建GI相关mRNA特征。通过绘制ROC曲线验证GImRNASig在LUAD患者中具有良好的预后价值。计算GImRNASig的风险评分并将所有患者分为高风险组和低风险组，生存曲线表明低风险组预后更好。独立预后分析表明，GImRNASig可以独立预测LUAD患者的预后。此外，GImRNASig的突变相关性分析表明它与GI密切相关。富集分析显示，GImRNASig与GI密切相关。ESTIMATA分析表明两组之间基质评分、免疫评分和ESTIMATE评分存在显著差异。ssGSEA结果表明，低风险组患者的免疫细胞水平更高。多个免疫检查点在低危人群中的表达水平较高。ESCO2在LUAD组织中的mRNA水平和蛋白水平均高于正常组织，且ESCO2表达与LUAD临床病理分期、淋巴结转移情况及生存情况密切相关。 结论1.GImRNASig可作为肺腺癌患者的预后指标；2.GImRNASig可以评估肺腺癌患者的肿瘤免疫微环境；3.GImRNASig对化疗药物的疗效具有预测价值；4.ESCO2的mRNA水平和蛋白水平在肺腺癌组织中高表达；5.ESCO2表达水平与肺腺癌的临床分期、淋巴结转移情况显著相关，并与肺腺癌患者的生存预后密切相关。
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