摘要
猪流感（Swine influenza, SI）是由正粘病毒科流感病毒属A型流感病毒猪流感病毒（Swine influenza virus，SIV）引起的重要呼吸道疾病。猪呼吸道上皮细胞中同时含有α-2,3-和α-2,6-半乳糖苷唾液酸受体，利于禽和哺乳动物源流感病毒复制。猪对人、猪和禽类流感病毒都很敏感，被认为是产生具有大流行潜力新型病毒的“混合容器”。中国是全球最大的猪肉生产国，拥有最复杂的SIVs生态系统，包括经典猪型（CS）、北美三重配型（TR）、欧亚类禽型（EA）和H1N1大流行/2009（pdm/09）谱系，这些谱系与H1N1、H1N2和H3N2亚型SIVs一起在猪群中流行，导致了新重组体的频繁出现。 2016?2020年，我们在中国广东、河南和山东三省收集了1818份屠宰场猪和2375份养殖场猪的鼻拭子样品，共获得39份SIVs的全基因组。广泛分析了1974?2020年中国SIVs 的演化和传播，将中国 SIVs划分为 48 种基因型，其中 19种 EA基因型（EAG0?G18）、13种CS基因型（EAG0?G12）以及16种hl-H3N2基因型（hl-H3N2G0?G15）。系统地理分析显示，SIVs的不同亚型（H1和H3）和亚型中的不同谱系（H1 EA和 H1 CS）显示出不同的时空传播模式，突出了频繁的长距离传播事件可能与人类介导猪的贸易和运输有关。 受体结合特性分析结果表明，毒株SW/GD/8/16（EAG7）、SW/GD/18Y/17（EAG7）、SW/GD/1903/19 （ EAG14 ）、SW/GD/2T/16 （ EAG14 ）、SW/GD/7/16 （ EAG18 ）和SW/GD/19/18（EAG18）对α-2,6半乳糖苷受体具有很强的亲和力；SW/GD/8/16（EAG7）、SW/GD/1903/19（EAG14）和SW/GD/19/18（EAG18）可与两种受体结合，但与α-2, 6受体的结合能力比与α-2, 3受体结合能力强。 豚鼠致病性实验表明， SW/GD/8/16 （ EAG7 ）、SW/GD/1903/19 （ EAG14 ）和SW/GD/7/16（EAG18）在豚鼠呼吸道中有效复制，可通过直接接触在豚鼠之间传播，其中 SW/GD/8/16 （ EAG7 ）在豚鼠间传播能力最强。SW/GD/8/16 （ EAG7 ）、SW/GD/1903/19（EAG14）和SW/GD/7/16（EAG18）均可在豚鼠鼻甲骨、气管和肺组织中有效复制；豚鼠血清均转阳，滴度为1：20～1：2560。猪的致病性实验结果表明，猪鼻腔感染SW/GD/8/16（EAG7）可有效排毒，并通过直接接触感染猪；感染组猪在1?7 dpi持续排毒，在5 dpi排毒达到高峰为5.6 lgTCID50/mL；接触组猪在3?9 dpi持续排毒，在5 dpi排毒达到高峰为4.5 lgTCID50/mL。3dpi，感染组2头猪脏器中病毒复制滴度为2.2～5.3 lgTCID50/mL，接触组滴度为2.1～3.5 lgTCID50/mL；5 dpi，感染组猪呼吸道脏器中病毒复制滴度为 3.2～5.7 lgTCID50/mL，接触组滴度为 1.8～4.5 lgTCID50/mL；猪血清均转阳，HI滴度为1：80～1：2560。 综上所述，基于对本实验室与公共数据库一共712个SIVs全基因组的系统发育分析，系统地描述了中国SIVs演化和传播情况；不同基因型（EAG7、G14和G18） SIVs在豚鼠体内有效复制，并可通过直接接触在豚鼠间水平传播；SW/GD/8/16（EAG7）感染猪后可在猪体内高效复制，可通过直接接触在猪之间传播。新出现的 SIVs 基因型具有适应人类和其它哺乳动物的潜在风险，有必要对其进行持续监测。
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