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西藏生防菌短小芽孢杆菌T229的筛选、鉴定与特性分析

常波

西藏生防菌短小芽孢杆菌T229的筛选、鉴定与特性分析

常波1
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作者信息

  • 1. 湖南农业大学
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摘要

近年来,随着西藏地区的农业结构调整和设施农业的发展,设施辣椒种植在该地区辣椒产业中占据重要地位。由于温室大棚辣椒栽培的不断扩大,辣椒土传病害也日益增多。本研究从西藏大棚辣椒的55份大棚土壤样品中筛选获得5株可拮抗辣椒疫霉病菌的微生物,并从中筛选出一株拮抗效果最佳的短小芽孢杆菌T229。该菌株抑菌效果好、拮抗性质稳定、抑菌谱广泛,具有进一步开发为生物农药的潜能。为了解该菌株的遗传信息,解释关键代谢物的合成基因簇,对其进行了全因组测序及代谢物质检测,以探明其拮抗活性成分,为该菌株的进一步开发利用奠定基础。主要研究结果如下: 1.从55份土壤样品中共筛选出5株拮抗辣椒疫霉病菌的生防菌株,其抑菌效率在42%~77%之间,其中,菌株T229的抑菌效果最好,抑菌率为77%;并且菌株T229对多种植物病原菌有良好的抑制效果。通过对T229菌株进行形态特征观察、生理生化鉴定及分子鉴定,确定T229为Bacilluspumilus(短小芽孢杆菌)。 2.对T229的发酵条件进行了优化,确定其最优发酵培养基为FER培养基,最优发酵时长为72h,最优条件下,T229菌株对辣椒疫霉菌的抑菌效果为90%。 3.明确了高温、pH、紫外线、蛋白酶及储存时间对T229抑菌活性物质的影响。结果表明:短小芽孢杆菌T229的无菌发酵液在pH为1-5、高温(40℃-80℃)、紫外照射时长(45min以内)、胃蛋白酶、木瓜蛋白酶和胰蛋白酶作用、以及4℃保存56d时间内,其抑菌效果均可保持相对稳定。 4.短小芽孢杆菌T229基因组(含质粒)的大小为3608763bp,平均GC含量为41.95%,编码基因3731个,编码基因的总长度为3192792bp。通过anti-SMASH预测到T229基因组含有13个次生代谢产物基因簇,且多数与抑菌活性物质的合成相关。 5.通过对短小芽孢杆菌T229无菌发酵滤液进行LC-MS/MS检测分析,从发酵液中鉴定出一种新型广谱抗生素zwittermicinA,进一步分析发现,T229基因组的Cluster2中有44个基因与zwittermicinA合成相关,其中含有NRPS/PKS结构域的核心基因6个。本研究可为植物病原菌的生物防治提供良好的生防菌种和基因资源。

关键词

辣椒/疫霉病/短小芽孢杆菌/发酵条件/抑菌活性

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授予学位

硕士

学科专业

生物与医药

导师

田云/王芬

学位年度

2023

学位授予单位

湖南农业大学

语种

中文

中图分类号

S4
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