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期刊信息/Journal information
南方医科大学学报
南方医科大学
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南方医科大学

陈敏生

月刊

1673-4254

xbbjb@fimmu.com

020-61648175

510515

广州市广州大道北1838号

南方医科大学学报/Journal Journal of Southern Medical UniversityCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊为综合性医学学术期刊，反映该校学科科研进展与动态，刊登基础医学方面的研究成果及临床诊疗经验。主要栏目有：基础研究、临床研究、技术方法、经验交流、病例报告、科研管理、短篇报道等。读者对象为医学研究人员、医务工作者及医学院校师生。本刊被美国《医学索引》（IM）、《化学文摘》等收录，2005年中国科技信息所公布的影响因子为0.869。
正式出版
收录年代

    早幼粒细胞白血病蛋白与TAK1结合蛋白相互作用的生物信息学分析与验证

    成佳聪李智慧刘鳐李成...
    179-186页
    查看更多>>摘要：目的 通过生物信息学方法预测早幼粒细胞白血病蛋白与TAK1结合蛋白的相互作用，并通过免疫共沉淀方法进行实验验证。方法 使用Rosetta软件，采用比较建模的方法，构建TAB1蛋白的三维模型;在PDB数据库中检索PML蛋白二级结构，并解析其晶体结构和三维结构。Zdock3。0。2软件进行PML与TAB1的蛋白-蛋白对接，并提取最佳构象进行对接模型的分子结构分析。α-MMC处理的M1炎性巨噬细胞，利用免疫共沉淀技术检测两种蛋白的相互作用。结果 以PML的6IMQ为对接部位时，PML蛋白与TAB1蛋白能形成3个盐桥、6个氢键和6个疏水作用;以PML的5YUF为对接部位时，PML蛋白与TAB1蛋白能形成1个氢键、3个静电相互作用和9个疏水作用，两种对接模式皆能形成良好的分子对接和相互作用;在α-MMC处理4h后，其PML-IP组的细胞裂解沉淀液中分别能检测到显著的PML和TAB1阳性蛋白条带。结论 PML蛋白与TAB1蛋白能发生较强的相互作用。

    TAB1蛋白PML蛋白生物信息学蛋白-蛋白对接免疫共沉淀

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    LncRNA SOX2OT靶向SIRT1/自噬通路增强胆管癌细胞5-FU耐药

    辛辰王笑影李响陈宇...
    187-193页
    查看更多>>摘要：目的 探讨LncRNA SOX2OT靶向SIRT1/自噬通路调节胆管癌细胞5-FU耐药的机制。方法 将未用5-FU处理HCCC-9810细胞和不同浓度(50、100、150、200 μg/mL)5-FU处理的HCCC-9810细胞分为对照组和模型组，qRT-PCR检测LncRNA SOX2OT、SIRT1 mRNA表达水平，Western blot检测SIRT1、Beclin1、LC3和p62蛋白表达。pcDNA3。1-SOX2OT和pcDNA3。1-NC转染HCCC-9810/5-FU耐药细胞，CCK-8检测细胞耐药性，划痕实验检测细胞迁移能力，qRT-PCR检测LncRNA SOX2OT、SIRT1 mRNA表达水平，Western blot检测SIRT1、Beclin1、LC3和p62表达。在以上基础上做了Rescue实验，将OV-SOX2OT(2 μg/孔)和si-NC(75 pmol/孔)、OV-SOX2OT(2 μg/孔)和si-SIRT1(75 pmol/孔)分别共转染HCCC-9810/5-FU耐药细胞，分组为OV-SOX2OT+si-NC组和OV-SOX2OT+si-SIRT1组，以证明LncRNA SOX2OT通过SIRT1影响自噬，并由此影响胆管癌细胞对5-FU的耐药性。RNA Pulldown验证SOX2OT与SIRT1的靶向结合关系。结果 不同浓度的5-FU均能抑制HCCC-9810细胞增殖(P<0。05)。与对照组相比，模型组SIRT1、Beclin1(P<0。001)和p62(P<0。01)蛋白表达、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ比值(P<0。001)、SIRT1和LncRNA SOX2OT mRNA水平(P<0。05)均明显增加。与OV-NC组相比，OV-SOX2OT组细胞迁移能力、SIRT1、Beclin1(P<0。001)和p62(P<0。05)蛋白表达、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ比值(P<0。001)、SIRT1和LncRNA SOX2OT mRNA(P<0。05)水平均明显增加。沉默SIRT1表达导致LncRNA SOX2OT过表达的HCCC-9810细胞对5-FU的耐药性显著降低。与OV-SOX2OT+ si-NC组相比，OV-SOX2OT+si-SIRT1组SIRT1(P<0。001)、p62和Beclin1(P<0。01)蛋白表达、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ比值(P<0。01)、SIRT1 mRNA(P<0。05)水平均明显降低。RNA Pulldown检测结果显示SOX2OT能够直接与SIRT1结合。结论 LncRNA SOX2OT通过上调SIRT1表达促进自噬来增强胆管癌HCCC-9810细胞5-FU耐药性。

    LncRNASOX2OTSIRT1自噬胆管癌细胞5-FU耐药

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    基于磁共振图像机器学习放射组学模型预测脑胶质瘤的强化

    何慧珊郭二嘉蒙文仪王彧...
    194-200,封3页
    查看更多>>摘要：目的 开发一个基于T2液体衰减反转恢复序列(T2-FLAIR)图像准确预测胶质瘤MRI强化模式的机器学习放射组学模型，为优化胶质瘤患者的MRI检查流程提供潜在的理论依据。方法 回顾性收集385例手术病理确诊的脑胶质瘤的术前MRI T2-FLAIR图像，根据强化模式分成强化和无强化两类，在训练组(201例)基于高斯过程、线性回归、线性回归最小绝对收缩和选择算子、支持向量机、线性判别分析和朴素贝叶斯这6种分类器分别建立预测胶质瘤强化模式的组学模型，并在内部验证组(85例)和外部验证组(99例)进行测试。应用受试者操作特征曲线评估其预测性能。结果 以高斯过程作为分类器的由15个放射组学特征组成的预测模型在训练组和内部验证组均具有最高的预测性能，其曲线下面积分别是0。88(95%CI:0。81，0。94)和0。80(95%CI:0。71，0。88)，在外部验证组的曲线下面积、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别是0。81(95%CI:0。71，0。90)、0。98、0。61、0。76、0。96。结论 基于T2-FLAIR的机器学习放射组学模型可准确预测胶质瘤的MRI强化模式。

    脑肿瘤磁共振成像机器学习放射组学

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