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期刊信息/Journal information
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院
南方农业学报

广西壮族自治区农业科学院

李杨瑞

月刊

2095-1191

nfnyxb@163.com

0771-3243905、3244920

530007

广西南宁市大学东路174号

南方农业学报/Journal Journal of Southern AgricultureCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由广西农业科学院主办的综合性农业科技期刊，主要报道农业科研新成果、新技术、新方法，农业生产新经验、新产业等。
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    杜长大商品猪肌内脂肪含量的全基因组关联分析

    高广雄李斌高宁田宏山...
    985-990页
    查看更多>>摘要：[目的]通过全基因组关联分析,定位影响杜长大商品猪肌内脂肪含量的相关SNP位点及其重要候选基因,为利用分子生物学方法改良猪肌内脂肪含量提供科学依据.[方法]选取981头杜长大商品猪,包括阉割公猪447头、母猪534头,所有试验猪均在统一条件下饲养至150日龄后进行屠宰测定,屠宰后利用索氏浸提法对肌内脂肪含量进行测定.利用GeneSeek GGP 50K芯片进行基因分型,使用rMVP软件包的FarmCPU模型对肌内脂肪含量性状进行全基因组关联分析.[结果]杜长大商品猪平均肌内脂肪含量达2.27％,其变异系数为34.24％,基因组遗传力(h2)为0.39,属于中等遗传力性状,表明该性状具有较大的遗传改良空间.经质控后,剩余30600个SNPs位点用于全基因组关联分析,共发现有8个潜在SNPs位点与肌内脂肪含量相关,分别分布在2、3、5、11、12、13和14号染色体上.利用Gene On-tology数据库对可能影响肌内脂肪含量的候选基因进行GO功能注释分析,发现这些候选基因参与的代谢通路包括肌肉发育代谢过程、器官生长代谢、基因表达调控及RNA转录等生物学代谢过程,但主要以肌肉生长发育代谢通路为主,表明肌内脂肪含量与肌肉生长发育之间存在紧密联系.[结论]利用高密度芯片进行全基因组关联分析,发现有8个SNPs位点与肌内脂肪含量相关;根据基因生物学功能及相关研究文献,C2orf74、HS6ST3和ROBO2基因主要参与细胞增殖分化及脂肪代谢等生物学过程,可作为影响肌内脂肪含量的重要候选基因.

    肌内脂肪含量杜长大商品猪候选基因全基因组关联分析SNP位点

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    我国猪业标准化体系现状解析及其对策建议

    周全伍曼婷张雅惠巫婷婷...
    991-999页
    查看更多>>摘要：[目的]查找我国猪业标准及标准化工作存在的短板,明确我国猪业标准化工作今后努力的方向和发展对策,以促进我国猪业标准化工作高质量发展.[方法]通过阐述加强猪业标准化体系建设的重要性,从标准分类、标准有效期、标准性质及采标率等角度分析我国猪业标准化的发展现状及存在问题,比较中外猪业标准体系差异,并有针对性地提出对策建议.[结果]截至2020年12月,我国已发布的猪业及其相关国家标准和行业标准合计759项,围绕品种、饲料营养、兽医卫生、环境控制、重大猪病监测和应急处置机制、动物防疫标识和质量安全溯源等产前、产中、产后环节的标准化体系已初步建立,基本上可实现生产有标可用、检测有标可依、质量有标可判;但我国猪业标准化仍存在标准体系不够合理、标准更新不及时、标准国际化水平不高、标准实施效果不理想等问题,尤其是与畜牧业发达国家相比,我国猪业标准体系在技术指标、产品质量指标等方面还存在明显差异,其分类与数量各具特色.[建议]猪业标准化工作要以"养殖过程科学高效、养殖环境生态友好、产品质量安全可追溯"为切入点,集生猪全产业链及其关联产业的标准于一体,逐步形成一个接地气、切合生产实际需要、具有可操作性的标准化体系,并以此推动和促进猪育种新成果、新技术、新方法转化为生产力,实现生猪产业提质增效,具体措施包括:(1)提高认识,加大猪业标准体系建设资金投入;(2)科学引导,健全猪业标准化体系建设;(3)对标国际,提升猪业标准国际化水平;(4)加强宣贯,促进猪业标准推广应用.

    猪业标准化体系发展现状存在问题对策建议

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    蒜芥茄SsWRKY1基因克隆及黄萎病病原菌胁迫下表达分析

    尹梦莹蔚亚楠杜光辉桂敏...
    1000-1010页
    查看更多>>摘要：[目的]克隆蒜芥茄WRKY1基因(SsWRKY1),并分析其在黄萎病病原菌胁迫下的表达模式,为探究WRKY1基因在野生蒜芥茄黄萎病抗性中的调控机制提供理论参考.[方法]利用染色体步移技术克隆SsWRKY1基因,通过在线生物信息学软件进行序列分析及构建系统发育进化树;采用GFP融合蛋白表达法对WRKY1蛋白进行亚细胞定位,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测SsWRKY1基因在不同组织及接种黄萎病病原菌后不同时间的相对表达量.并分析9种野生茄材料接种黄萎病病原菌后的病情指数与WRKY1基因表达变化量的相关性.[结果]克隆获得的SsWRKY1基因(GenBank登录号MZ846202)ORF序列长度为1224 bp,编码407个氨基酸残基,蛋白相对分子量为44.87 kD,理论等电点(pI)为6.91,属于亲水性不稳定蛋白,亚细胞定位于细胞核,符合转录因子特征.Ss-WRKY1蛋白含有2个WRKY保守结构域和C2H2型锌指结构,属于Ⅰ类WRKY转录因子,其二级结构主要由α-螺旋(7.13％)、β-折叠(4.67％)、无规则卷曲(73.71％)和延伸链(14.50％)组成.SsWRKY1蛋白与番茄、野生潘那利番茄、野生番茄、马铃薯WRKY1蛋白的亲缘关系较近.SsWRKY1基因在根和茎的相对表达量显著高于叶中的相对表达量(P<0.05,下同).黄萎病病原菌接种后不同时间,SsWRKY1基因的相对表达量均低于对照组(无菌水接种),但仅在24 h时二者差异达显著水平.9种野生茄材料接种黄萎病病原菌后的病情指数与接种前后WRKY1基因表达变化量间呈显著正相关.[结论]SsWRKY1属于第Ⅰ类WRKY转录因子,序列高度保守,在细胞核中表达,其基因具有组织表达特异性,黄萎病菌胁迫后该基因的表达下调,推测WRKY1在野生茄黄萎病抗性中起负调控作用.

    蒜芥茄WRKY转录因子黄萎病基因克隆亚细胞定位表达分析

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    油棕SAUR基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

    周丽霞杨蒙迪曹红星杨耀东...
    1011-1020页
    查看更多>>摘要：[目的]挖掘并鉴定油棕生长素上调小RNA(SAUR)基因家族成员,并对其进行生物信息学分析,为油棕生长素信号转导机制的研究提供参考.[方法]根据拟南芥SAUR基因序列,在油棕全基因组数据库中同源序列搜索,并利用CDD和Pfam数据库进行SAUR蛋白结构域分析,剔除无保守结构域的序列,最后利用生物信息学软件对油棕SAUR基因家族成员进行可视化分析.[结果]从油棕全基因组中共鉴定出40个SAUR基因家族成员(EgSAUR1～EgSAUR40),有31个基因在油棕14条染色体上呈不均匀分布,其中4号染色体上分布的基因最多为7个;除EgSAUR14和EgSAUR24基因含有2个外显子外,其余38个基因均仅含1个外显子,无内含子.40个EgSAURs蛋白亚细胞定位于细胞核,其二级结构均由α-螺旋、β-转角、无规卷曲和延伸链组成,以无规卷曲和α-螺旋所占比例较高,其中有11个EgSAURs蛋白呈酸性,29个EgSAURs蛋白呈碱性.40个油棕SAUR蛋白被划分为四大类,其中第I(除EgSAUR27蛋白外)、II(除EgSAUR3和EgSAUR22外)、III、IV类蛋白均有Auxin_inducible保守结构域.40个EgSAURs蛋白共含10种保守基序(Motif),其中Motif 2存在于所有基因成员中.在花中特异表达的EgSAURs基因(EgSAUR4、EgSAUR9、EgSAUR10、EgSAUR24、EgSAUR29、EgSAUR30、EgSAUR32和EgSAUR33)数量最多,其次为根、茎和叶,在中果皮中特异表达的基因数最少.[结论]基因重复和组织表达特异性是油棕SAUR家族基因的两大特点,推测该家族基因对油棕花的生长发育及授粉受精过程发挥调控作用.

    油棕SAUR全基因组生长素生物信息分析鉴定

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    江西省芝麻地方种质表型性状遗传多样分析

    王郅琪孙建周红英颜小文...
    1021-1029页
    查看更多>>摘要：[目的]对江西省芝麻地方种质资源进行表型性状遗传多样分析,为江西芝麻种质资源的有效利用及开发提供理论参考.[方法]依托"第三次全国农作物种质资源普查与收集行动"从江西省39个县(市、区)收集到的132份芝麻地方种质为试验材料,对其23个表型性状(12个质量性状和11个数量性状)进行测定,并计算遗传多样性指数和变异系数.同时,对11个数量性状进行相关分析,并对供试种质进行聚类分析.[结果]23个表型性状的平均遗传多样性指数为1.2821,其中,12个质量性状的遗传多样性指数为0.3217～1.0307,平均0.7290;11个数量性状的变异系数为4.70％～43.58％,遗传多样性指数为1.6138～2.0627,平均1.8855.3种粒色类型芝麻种质中,以46份白芝麻种质表型性状的平均遗传多样性指数最高,为1.3602,74份黑芝麻种质和12份其他粒色(黄色、褐色、黄褐色、红褐色等)芝麻种质表型性状的平均遗传多样性指数分别为1.1782和1.0476.生育期与株高、始蒴高度、蒴果长、千粒重和蛋白含量呈极显著正相关(P<0.01,下同),但与含油量呈极显著负相关.供试的132份芝麻种质资源可分为四大类,不同类群种质的来源地存在地理位置的交错分布现象,其中,第Ⅰ类群可作为潜在选育芝麻高含油量新品种的亲本材料,第Ⅱ类群可作为潜在高产优良芝麻材料利用,第Ⅲ类群可作为潜在矮杆株型的亲本材料,第Ⅳ类群可作为潜在的高蛋白型亲本材料加以利用.[结论]江西芝麻地方种质资源的主要表型性状变异较大,遗传多样性较丰富,其中以46份白芝麻种质的遗传多样性更丰富.种质间亲缘关系与地理来源无必然联系.以高产高蛋白为育种目标时应选择株高较高,始蒴高度适中、蒴果较大、千粒重较高的材料为亲本,并据此进行后代选择.

    芝麻江西地方种质资源表型性状遗传多样性聚类分析

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    无刺龙舌兰叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析

    王飞辛雅萱董章宏赵文植...
    1030-1039页
    查看更多>>摘要：[目的]分析无刺龙舌兰叶绿体基因组特征及密码子偏好性,为无刺龙舌兰叶绿体相关基因的表达、修饰和物种进化研究提供参考.[方法]对无刺龙舌兰的叶绿体基因组进行测序、组装和注释,分析密码子偏好性及其影响因素,并通过建立高、低基因表达库,筛选出最优密码子.基于20个已发表的龙舌兰科植物叶绿体基因组数据构建系统发育进化树.[结果]无刺龙舌兰叶绿体基因组总长157579 bp,大单拷贝区(LSC)、小单拷贝区(SSC)和2个反向重复区(IRa和IRb)的长度分别为85940、18279和26680 bp,GC含量为37.8％,包括135个基因(85个蛋白编码基因、38个tRNA基因、8个rRNA基因及4个未知功能的基因),从中筛选出51个长度大于300 bp的基因编码区(CDS)序列,其有效密码子数(ENC)均大于41.0.GC1、GC2、GC3和GC3s含量分别为46.75％、39.61％、29.19％和26.06％,说明密码子第3位多以A/T结尾.GCall与GC1、GC2和GC3均呈极显著相关(P<0.01,下同),但GC3与GC1和GC2均无显著相关性(P>0.05,下同),表明密码子第1、2位的碱基组成相似,但与第3位的相似度不高.选择和突变是导致叶绿体基因组密码子偏好性的主要因素.筛选出14个多以A/U结尾的最优密码子.无刺龙舌兰与克雷塔罗丝兰和西地格丝兰为姊妹关系,自荐值为100％.[结论]无刺龙舌兰叶绿体基因组为保守的四分体结构,叶绿体基因组密码子偏好性较弱,主要受选择和突变等多因素影响.基于植物叶绿体基因组构建系统发育进化树在物种的分类鉴定及确定各物种间系统发育关系的研究中是一种准确、可靠的方法.

    无刺龙舌兰叶绿体基因组密码子偏好性系统发育分析

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    广西杉木炭疽病病原鉴定及生物学特性测定

    廖旺姣邹东霞罗辑吴耀军...
    1040-1048页
    查看更多>>摘要：[目的]明确广西杉木炭疽病的病原种类及生物学特性,为杉木抗病育种及杉木炭疽病的防治技术研究提供科学依据.[方法]采集广西河池、百色、桂林、柳州、贺州和南宁市杉木种子园及林地炭疽病样品,采用常规组织和单孢分离法获得杉木炭疽病病原菌菌株,通过形态特征结合病原菌核糖体内转录间隔区(ITS)、几丁质合成酶(CHS1)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(GPDH)、微管蛋白(TUB2)和肌动蛋白(ACT)多基因分子系统学分析,对获得的炭疽病菌菌株进行鉴定;采用平板培养法测定病原菌生物学特性.[结果]从杉木炭疽病样品中共分离获得60株炭疽菌属真菌,均具有致病性,但致病力存在差异.通过形态学结合病原菌多位点基因系统发育分析,确定广西杉木炭疽病病原菌种类为核果炭疽菌(Colletotrichum fructicola)和山茶炭疽菌(C.camelliae).生物学特性测定结果显示,C.fruc-ticola和C.camelliae菌丝生长及产孢最适温度分别为28和25℃;光照对C.fructicola菌丝生长无明显影响,但有利于C.camealliae菌丝生长,黑暗有利于2种病原菌产孢;pH 4时最适宜2种病原菌菌丝生长,pH 4最适宜C.fructicola产孢,pH 5最适宜C.camealliae产孢;2种病原菌对D-麦芽糖利用最好,乳糖和D-山梨醇最有利于C.fructicola产孢,可溶性淀粉和阿拉伯糖最有利于C.camelliae产孢;蛋白胨和酵母粉均有利于2种病原菌菌丝生长,酵母粉有利于C.fructi-colaz产孢,酵母粉和牛肉膏有利于C.camelliae产孢.[结论]广西杉木炭疽病病原为核果炭疽菌(C.fructicola)和山茶炭疽菌(C.camelliae).温度、pH和碳氮源对2种病原菌菌丝生长及产孢影响明显,光照对2种病原的影响略有不同.

    杉木炭疽病病原菌鉴定生物学特性广西

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    湖北省葡萄主产区灰葡萄孢菌多样性分析

    王泽琼刘勇王榕馨姜婷...
    1049-1056页
    查看更多>>摘要：[目的]了解湖北省葡萄主产区灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)多样性,为葡萄灰霉病防治提供科学依据.[方法]采用常规微生物分离法对从湖北省8个葡萄主产区采集的葡萄灰霉病样本进行灰葡萄孢菌分离,在PDA培养基上观察分离物菌落培养形态并测定菌丝生长速率;利用特异引物对各分离物的Flipper和Boty转座子片段进行扩增,区分转座子类型;扩增Bc-hch基因并用Hha I酶切检测分离物的多态性以区分组群;依据菌丝生长速率、菌落形态及转座子类型挑选4株典型分离物在4个葡萄品种果实上进行致病力测定.[结果]从病害样本中共分离获得51株分离物,菌落培养形态表明30株分离物为菌核型,20株为孢子型,仅1株为菌丝型,出现频率分别为58.82％、39.22％和1.96％.所有分离物菌丝生长速率均较高,在10.86～13.94 mm/d.分离物只存在2种转座子类型,其中50株为Transposa型,仅1株为Flipper型.Bc-hch基因Hha I酶切多态性鉴定结果表明,所有菌株均为GroupⅡ,为狭义的灰葡萄孢菌.分离物致病力测定结果表明,菌丝生长速率最低的WH3在供试葡萄品种上的致病力均最强,其次是Flipper型分离物SX1,菌丝生长速率最高的XN2和菌丝型WH6分离物致病力均较弱,且不同分离物在不同品种上致病力趋势不同.[结论]湖北省葡萄主产区灰葡萄孢菌菌落培养形态较丰富,所有分离物均为狭义灰葡萄孢菌,只存在Transposa和Flipper 2种转座子类型,前者占绝对优势,典型分离物间致病力差异明显.

    葡萄灰霉病灰葡萄孢菌多样性致病力湖北

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    多粘类芽胞杆菌分离鉴定及其对甘薯蔓割病的防治效果

    徐颖华柴沙沙李成阳张文英...
    1057-1065页
    查看更多>>摘要：[目的]筛选对甘薯蔓割病病原菌具有拮抗作用的芽胞杆菌,为甘薯蔓割病的生物防治提供菌种资源.[方法]通过平板对峙法从玉米根际土壤中筛选对甘薯蔓割病病原菌具有拮抗作用的芽胞杆菌;通过生物学特征和16S rDNA序列分析对拮抗菌株进行分类鉴定;通过盆栽试验进行拮抗菌株对甘薯蔓割病的防效试验,并检测拮抗菌株对甘薯叶片脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)含量,超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性及可溶性蛋白含量的影响.[结果]从玉米根际土壤中分离获得1株乳白色且具有拮抗作用的芽胞杆菌,命名为HAAS05,通过16S rDNA鉴定及系统发育进化树比对分析,将HAAS05菌株鉴定为多粘类芽胞杆菌(Paenibacillus polymyxa).盆栽试验结果显示,HAAS05菌株对甘薯蔓割病有明显的拮抗效果;OD600 nm=0.20和OD600 nm=0.40的HAAS05菌悬液处理第10 d后,甘薯叶片中ABA含量较仅接种病原菌处理(201.94 ng/g)显著降低(P<0.05,下同),分别为52.29和107.10 ng/g,而GA含量较仅接种病原菌处理(7.05 ng/g)显著升高,分别为8.10和10.31 ng/g,甘薯叶片SOD活性和可溶性蛋白含量均较仅接种病原菌处理显著升高,而POD活性变化无明显规律.[结论]多粘类芽胞杆菌HAAS05菌株对甘薯蔓割病有较好的拮抗作用,具有一定的开发应用潜力.

    甘薯蔓割病多粘类芽胞杆菌生物防治

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    云南不同地理种群草地贪夜蛾肠道可培养细菌多样性分析

    李永萍杜广祖狄藤孔德鸿...
    1066-1077页
    查看更多>>摘要：[目的]明确云南不同地理种群草地贪夜蛾幼虫肠道可培养细菌群落组成及种群间的差异,为草地贪夜蛾肠道细菌多样性及其生物学功能研究提供科学依据,并为解析草地贪夜蛾的环境适应机理打下基础.[方法]采用分离培养法对云南省普洱市澜沧、保山市隆阳、昆明市石林、红河州开远4个不同地理种群的草地贪夜蛾幼虫肠道细菌进行分离培养,结合形态学及16S rDNA测序方法进行细菌种类鉴定.[结果]从云南4个地理种群草地贪夜蛾幼虫肠道中共分离获得27株形态、颜色和大小各异的细菌菌株,27株细菌菌株分属4门9科12属19种,优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌属为厚壁菌门肠球菌属(Enterococcus).其中,澜沧、石林、开远和保山种群分别分离到3门4科6属8种共9株细菌、3门5科6属6种共6株细菌、2门3科4属5种共5株细菌和3门6科6属6种共7株细菌;4个地理种群草地贪夜蛾幼虫肠道内均存在肠球菌属和克雷伯氏菌属(Klebsiella)细菌;4个地理种群草地贪夜蛾幼虫肠道细菌的丰富度指数、Shannon指数、Simpson指数和均匀度指数分别为0.705～1.277、0.969～1.381、0.615～0.635及0.602～0.753.[结论]云南4个不同地理种群草地贪夜蛾幼虫肠道内可培养细菌较丰富,不同地理种群肠道细菌多样性存在差异,但优势菌均为厚壁菌门的肠球菌属细菌,肠球菌属细菌对草地贪夜蛾肠道细菌群落起着决定作用.

    草地贪夜蛾地理种群肠道可培养细菌多样性云南

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