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期刊信息/Journal information
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院
南方农业学报

广西壮族自治区农业科学院

李杨瑞

月刊

2095-1191

nfnyxb@163.com

0771-3243905、3244920

530007

广西南宁市大学东路174号

南方农业学报/Journal Journal of Southern AgricultureCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由广西农业科学院主办的综合性农业科技期刊，主要报道农业科研新成果、新技术、新方法，农业生产新经验、新产业等。
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    淡水养殖凡纳滨对虾生长相关基因HDAC1克隆及其表达分析

    骆永丽刘红于忠利王文雁...
    1388-1398页
    查看更多>>摘要：[目的]分析组蛋白去乙酰基酶1基因(HDAC1)在不同淡水生长特性家系凡纳滨对虾中的表达情况,明确HDAC1基因在对虾淡水养殖过程中的功能作用,为揭示凡纳滨对虾生长调控的分子机制提供参考依据.[方法]通过RACE克隆凡纳滨对虾HADC1基因cDNA序列,利用DNAMAN、ProtParam、ProtScale、PSORT等在线软件进行生物信息学分析,以实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾HDAC1基因组织表达特征;选取4个家系凡纳滨对虾在1‰盐度下进行淡水养殖,养殖70 d后统计对虾存活率(RS)、日增重率、体长日增率、特定生长率(SGR)及饲料转化率(FCR),并利用实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾肠道中的HDAC1基因表达情况.[结果]凡纳滨对虾HDAC1基因cDNA全长3230 bp,包括67 bp的5'非编码区(5'-UTR)、1711 bp的3'非编码区(3'-UTR)及1452 bp的开放阅读框(ORF),共编码483个氨基酸残基;HDAC1基因DNA全长4692 bp,含有8个外显子和7个内含子.凡纳滨对虾HDAC1基因编码蛋白分子量为54640.22 Da,理论等电点(pI)为5.59,属于稳定的亲水性蛋白,具有1个Histone deacetylase 1结构域,无跨膜结构.凡纳滨对虾HDAC1氨基酸序列与斑节对虾HDAC1氨基酸序列的相似性最高,达99.79％.HDAC1基因在凡纳滨对虾各组织中均有表达,以在肠道中的相对表达量显著高于在其他组织中的相对表达量(P<0.05);在4个家系群体中,无论是大虾还是小虾,生长慢的群体中HDAC1基因相对表达量较低,生长快的群体中HDAC1基因相对表达量较高.[结论]HDAC1基因在凡纳滨对虾各组织中均有表达,以肠道中的相对表达量最高,且HDAC1基因相对表达量与凡纳滨对虾的生长速度成正比,故推测其参与凡纳滨对虾的生长调节过程.

    凡纳滨对虾HDAC1基因肠道生长调节淡水养殖

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    斜带石斑鱼BAG-1基因克隆及表达分析

    李星吴子杰温依铭刘结红...
    1399-1406页
    查看更多>>摘要：[目的]明确斜带石斑鱼(Epinephelu coioides)BAG-1基因(EcBAG-1)的结构特征、组织表达分布及在脂多糖(LPS)和聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后的表达变化,进一步揭示鱼类BAG-1在病原感染中的作用机制,也为了解鱼类的抗病免疫提供参考依据.[方法]依据EcBAG-1基因EST序列设计特异性引物克隆EcBAG-1基因,通过SMART、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL、ExPASy、ClustalX及MEGA 5.0等在线软件进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR检测EcBAG-1基因的组织表达特征及其在LPS和PolyI:C刺激后的表达模式.[结果]克隆获得的EcBAG-1基因开放阅读框(ORF)长624 bp,共编码207个氨基酸残基;EcBAG-1蛋白分子量为49.84 kD,理论等电点(pI)为5.18,为疏水性蛋白.EcBAG-1蛋白具有BAG-1家族保守的BAG结构域和UBQ泛素相关结构域,无跨膜结构域,主要分布在细胞质和细胞核,其二级结构中α-螺旋占65.22％、延伸链占10.63％、无规则卷曲占20.29％、β-转角仅占3.86％.EcBAG-1氨基酸序列与大黄鱼的BAG-1氨基酸序列相似性最高(96.62％),亲缘关系最近;与原鸡和热带爪蛙的亲缘关系相对较远,对应的BAG-1氨基酸序列相似性分别为58.45％和57.50％.EcBAG-1基因在斜带石斑鱼的肝脏、胸腺、脾脏、头肾、鳃、皮肤、肌肉、大脑、外周血淋巴细胞及心脏等组织中均有表达,且以在大脑中的相对表达量最高,显著高于在其他组织中的相对表达量(P>0.05,下同);经LPS和PolyI:C刺激24 h后,斜带石斑鱼脾脏中的EcBAG-1基因相对表达量显著上调.[结论]EcBAG-1蛋白含有BAG-1蛋白家族典型的BAG结构域和UBQ结构域,具有与哺乳动物BAG-1相似的生物学功能,即EcBAG-1基因在斜带石斑鱼抵御细菌/病毒感染的过程中发挥重要作用,为深入了解鱼类的抗感染机理拓宽了思路.

    斜带石斑鱼BAG-1基因病原感染免疫反应表达分析

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    黄鳍金枪鱼幼鱼日周期性及摄食期间的运动行为规律

    周胜杰杨蕊于刚马振华...
    1407-1414页
    查看更多>>摘要：[目的]在陆基循环水养殖的基础上进行黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)幼鱼运动行为学研究,并构建设施化金枪鱼养殖技术体系,为后续开展金枪鱼深远海养殖和陆基循环水养殖推广打下基础.[方法]以驯化成功后的黄鳍金枪鱼幼鱼(驯化30 d)为研究对象,在室内集约化循环水养殖系统下运用水下摄像技术测定其全长—口径关系,以及摄食与非摄食状态下的游泳速度和深度,并分析其摄食及日周期性运动行为.[结果]黄鳍金枪鱼幼鱼的游泳速度在早晨、傍晚时巡游速度较慢,在8:00—10:00和14:00—16:00时的巡游速度较快;其最初发现食物时暴发游泳速度较快,可达1.84～3.90 m/s,冲刺距离为4.80～5.51 m;摄食中黄鳍金枪鱼幼鱼冲向食物的速度为0.98～1.54 m/s,冲刺距离为0.61～1.09 m.黄鳍金枪鱼幼鱼的初始投喂摄食深度为0.83～1.43 m,其摄食深度(y)与投喂时长(x)的线性方程式为y=0.0002x2–0.021x+1.168(R2=0.360).随着投喂时间的延长,黄鳍金枪鱼幼鱼个体间的摄食深度相差逐渐增大.黄鳍金枪鱼在全长为38.63～51.25 cm时,其45°口径范围为1.87～3.38 cm,90°口径范围为3.45～6.00 cm,体长与口径呈正相关.黄鳍金枪鱼在陆基循环水养殖过程中,早晨(6:00)所处的水深位置最深,8:00—18:00时有轻微波动;摄食深度则随着投喂时间的延长呈由深到浅再缓慢到深的变化趋势.[结论]黄鳍金枪鱼幼鱼在陆基养殖状态下仍存在周期性的游泳速度和游泳深度变化;随着饥饿度的降低,黄鳍金枪鱼幼鱼的摄食积极性逐渐降低,且为保护自身安全,食物距池底<0.70 m时不会主动摄食.该结论可为黄鳍金枪鱼的节律性栖息深度及游泳行为研究积累基础数据资料,同时为优化黄鳍金枪鱼陆基养殖技术提供指导.

    黄鳍金枪鱼游泳速度深度摄食饵料粒径口径

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    温度和pH对中华绒螯蟹幼蟹耗氧率、排氨率和窒息点的影响

    陈雪冯文荣周立水丁秀芳...
    1415-1424页
    查看更多>>摘要：[目的]明确中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)幼蟹在不同环境条件下的呼吸代谢规律,为其幼蟹养殖条件的优化和种苗繁育提供参考依据.[方法]通过密封静水式试验,探究不同温度(10、15、20、25、30℃)和pH(6.0、7.0、8.0、9.0)对不同规格[大规格组(L)的体质量21.68±3.58 g,中规格组(M)的体质量11.31±0.29 g,小规格组(S)的体质量5.84±0.33 g]中华绒螯蟹幼蟹耗氧率、排氨率和窒息点的影响.[结果]温度和pH对中华绒螯蟹幼蟹的耗氧率和排氨率有显著影响(P<0.05,下同).随着温度的升高,中华绒螯蟹幼蟹的耗氧率和排氨率均呈升高趋势;在15～30℃的范围内,幼蟹的耗氧率和排氨率与其体质量呈负相关,即幼蟹的耗氧率和排氨率排序均表现为S组>M组>L组.随着pH的升高,中华绒螯蟹幼蟹的耗氧率呈先降低后升高的变化趋势,排氨率则呈先升高后降低的变化趋势;在pH 6.0～9.0的范围内,幼蟹的耗氧率和排氨率均与体质量呈负相关.温度和pH对中华绒螯蟹幼蟹的窒息点有显著影响,幼蟹在10℃下的窒息点显著高于15～30℃下的窒息点;在pH 6.0～9.0的范围内,幼蟹的窒息点均随pH的升高呈先降低后升高的变化趋势,且S组幼蟹的窒息点显著高于M组和L组.在10～30℃范围内,中华绒螯蟹幼蟹的氨商和能量代谢率均呈先降低后升高的变化趋势;随pH的升高,幼蟹的氨商呈先升高后降低的变化趋势,能量代谢率则呈先降低后升高的变化趋势.[结论]温度和pH变化对不同规格中华绒螯蟹幼蟹呼吸代谢指标均有显著影响,其适宜生长温度为20～25℃,适宜生长pH为8.0,过高或过低均会对中华绒螯蟹幼蟹机体造成应激反应,进而影响其正常生长及存活.

    中华绒螯蟹温度pH体质量耗氧率排氨率窒息点

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    新疆和西藏棕鳟群体的遗传多样性分析

    吴昊天李亚琳王军陈晓雯...
    1425-1433页
    查看更多>>摘要：[目的]了解新疆和西藏地区棕鳟养殖群体的遗传多样性状况,解析两地棕鳟的亲缘关系和遗传差异,为棕鳟的分子辅助育种打下数据和方法基础.[方法]采用第二代高通量测序技术对来自新疆达坂城和西藏亚东的2个棕鳟群体各12个个体进行基因组重测序,利用鉴定得到的多态性信息位点进行群体结构、群体遗传多样性和群体间的选择消除分析.[结果]全基因组重测序在2个棕鳟群体中共获得4694474928条Illumina测序序列(reads),参考棕鳟基因组,共鉴定出8559684个单核苷酸多态性(SNP)位点,根据获得的SNP进行计算后发现,新疆和西藏棕鳟群体的遗传多样性指标相似,西藏棕鳟的遗传多样性略高于新疆棕鳟.个体系统发育进化树、群体结构分析和多态性位点主成分分析均显示,2个群体的亲缘关系相近,而连锁不平衡衰减分析表明,西藏棕鳟群体受到的选择压力较大.基于群体分化指数(FST)和核苷酸多态性(Pi)计算的选择消除分析发现,主要在新疆群体的第5号和第19号染色体上,以及西藏群体的第17号和第18号染色体上的较大区域内存在强烈的选择信号,位于这些区域里的共94个基因可能受到较强的选择压力,其中有21个基因与免疫或疾病相关(17个来自于西藏群体,4个来自新疆群体).[结论]新疆棕鳟和西藏棕鳟源于同一种源,2个群体的遗传多样性差异较小.西藏棕鳟受到的环境选择压力更加明显,受到选择的基因以免疫相关基因为主.

    棕鳟群体遗传学选择消除分析基因组重测序新疆西藏

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    饲料中添加β-葡聚糖对珍珠龙胆石斑鱼生长性能、免疫指标、转录组及肠道菌群的影响

    陈俭代冰涛王红明宋守钢...
    1434-1447页
    查看更多>>摘要：[目的]明确β-葡聚糖诱导珍珠龙胆石斑鱼的免疫响应机制,为β-葡聚糖作为免疫增强剂在水产饲料中的应用提供理论依据.[方法]以珍珠龙胆石斑鱼为研究对象,通过在饲料中添加100 mg/kgβ-葡聚糖进行养殖试验,饲养8周后采样分别进行生长性能、血清生化指标、转录组测序和肠道菌群组成分析.[结果]饲料中添加β-葡聚糖显著提高珍珠龙胆石斑鱼的终末体重、增重率和特定生长率(P<0.05,下同),并降低脏体比.与对照(基础饲料)组相比,β-葡聚糖添加组珍珠龙胆石斑鱼血清总蛋白含量及过氧化氢酶、溶菌酶、胃蛋白酶和肠脂肪酶活性显著升高,而总甘油三酯含量、总胆固醇含量、谷丙转氨酶活性及丙二醛含量呈显著降低趋势.转录组测序结果显示,共组装获得79291条Unigenes,平均长度为941 bp;依据FDR≤0.05且|log2 FC(Sample2/Sample1)|≥1的筛选条件,共筛选获得8014个差异表达基因(4990个上调基因和3024个下调基因);KEGG信号通路富集分析发现有648个差异表达基因被富集到175个KEEG信号通路上,其中有16条通路与免疫功能相关,涉及139个显著差异基因.HiSeq PE250高通量测序分析结果显示:β-葡聚糖组珍珠龙胆石斑鱼肠道菌群OUTs数量、ACE指数和Shannon指数显著高于对照组,Chao1指数和Simpson指数无显著差异(P>0.05).在门分类水平上,珍珠龙胆石斑鱼肠道菌群中以变形菌门、放线菌门拟杆菌门、蓝藻门及厚壁菌门为优势菌群,β-葡聚糖组中变形菌门和蓝藻门的相对丰度显著低于对照组,厚壁菌门和拟杆菌门的相对丰度则极显著高于对照组(P<0.01,下同);在属分类水平上,以发光杆菌属、鞘氨醇单胞菌属、盐单胞菌属、红游动菌属及无色杆菌属为优势菌群,且表现为β-葡聚糖组中发光杆菌属的相对丰度显著低于对照组,盐单胞菌属的相对丰度极显著低于对照组.[结论]β-葡聚糖能有效增强珍珠龙胆石斑鱼的抗氧化能力及提高其肠道菌群物种丰度和多样性以抵御外界有害菌的繁殖,同时提升珍珠龙胆石斑鱼的抗炎症和抗病等免疫能力.即β-葡聚糖在珍珠龙胆石斑鱼上具有良好的生长和免疫增强效果,可作为新型免疫增强剂推广应用.

    珍珠龙胆石斑鱼β-葡聚糖生长性能免疫能力转录组肠道菌群

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    织锦巴非蛤幼虫对不同种类单胞藻的摄食和消化效果

    邓正华翟子钦魏海军赵旺...
    1448-1456页
    查看更多>>摘要：[目的]明确织锦巴非蛤幼虫在不同发育时期饲喂单胞藻饵料的合适种类,为织锦巴非蛤的苗种规模化人工繁育提供饵料投喂策略及参考依据.[方法]以从广西北海市铁山港区自然海域捕捞的织锦巴非蛤2龄贝为亲本,人工培育D形幼虫,在幼虫培育期间分别投喂小球藻、微绿球藻、杜氏盐藻、亚心形扁藻、湛江等鞭金藻、球等鞭金藻、绿色巴夫藻、牟氏角毛藻和三角褐指藻,显微镜下观察幼虫在不同时期对不同种类单胞藻的摄食情况和消化效果.[结果]织锦巴非蛤初孵幼虫(D形幼虫)大小(壳长×壳高)为(82.49±3.02)μm×(63.98±2.16)μm,于4 dph(孵化后第4 d)发育至壳顶前期(115.89±3.86)μm×(101.62±3.80)μm,13 dph进入变态期(205.61±15.84)μm×(182.61±13.53)μm,于15 dph变态至稚贝(225.63±8.99)μm×(198.65±8.25)μm.织锦巴非蛤幼虫在运动过程中也伴随着摄食,通过纤毛的摆动形成水流,单胞藻则随着水流方向进入幼虫口沟,在口沟纤毛摆动下进入胃内,胃内的单胞藻在微绒毛摆动下快速旋转并消化.织锦巴非蛤幼虫在1 dph时能摄食小球藻、微绿球藻、绿色巴夫藻、湛江等鞭金藻和球等鞭金藻,在4 dph时有少量幼虫开始摄食杜氏盐藻,至10 dph时幼虫开始摄食亚心形扁藻和牟氏角毛藻,整个浮游幼虫期均不摄食三角褐指藻.在9种单胞藻饵料中,小球藻和微绿球藻较其他种类更难消化.[结论]在织锦巴非蛤幼虫培育过程中,幼虫开口饵料宜选择湛江等鞭金藻、球等鞭金藻和绿色巴夫藻,在10 dph时适宜投喂杜氏盐藻,至13 dph时可投喂牟氏角毛藻和亚心形扁藻;在其他易被摄食和消化单胞藻种类充足的情况下,一般不选取小球藻和微绿球藻作为幼虫培育的首选饵料.

    织锦巴非蛤幼虫单胞藻摄食消化

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    大麻哈鱼消化器官的形态学和组织学观察

    李培伦刘伟鲁万桥唐富江...
    1457-1465页
    查看更多>>摘要：[目的]摸清大麻哈鱼消化器官的形态结构特征,为其人工养殖过程中饵料调配和优化提供参考.[方法]以人工养殖的2龄大麻哈鱼为研究对象,采用解剖学和常规石蜡切片技术对其消化器官的形态学和组织学进行研究.[结果]大麻哈鱼的消化道由口咽腔、食道、胃、幽门盲囊和肠组成.口咽腔中颌齿、咽骨齿发达;食道粗短且肌层发达;胃呈V形,由贲门部、胃体部和幽门部组成,黏膜褶皱较多;胃黏膜层表面为排列紧密的单层柱状上皮细胞,黏膜层内陷形成大量胃小凹,在胃小凹的基部具有数量丰富的胃腺组织,其中贲门部和胃体部胃腺数量较多,而幽门部较少;幽门盲囊呈螺旋式纵行排列,其黏膜层由单层柱状上皮细胞和大量杯状细胞构成;肠道较短,前肠有较薄的黏膜褶皱而黏膜层界限不明显,后肠则未见明显的黏膜层和黏膜褶皱结构.肝脏不分叶,肝小叶界限模糊,中央静脉和胆管结构清晰.[结论]大麻哈鱼消化器官的形态结构特征与其食性功能相适应,具有典型肉食性鱼类消化器官特征.

    大麻哈鱼消化器官形态学组织学

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    2种体型禾花鲤形态性状对体质量的影响

    樊佳佳马冬梅朱华平苏换换...
    1466-1473页
    查看更多>>摘要：[目的]分析广东北部地区传统稻田养殖的短圆体型和长体型禾花鲤的形态特征及其形态性状与体质量的相关性,为确定不同体型禾花鲤新品种选育测量的形态性状参考依据.[方法]以广东北部地区传统稻田养殖的禾花鲤为试验材料,按体型将其分为短圆体型和长体型2个群体,并精确测量其10个生长性状.采用通径分析法和灰色关联度分析法分析6月龄短圆体型和长体型禾花鲤的9个形态性状(全长、体长、头长、体高、尾柄长、尾柄高、尾长、头高、体宽)对体质量的影响.[结果]禾花鲤体质量在短圆体型和长体型群体的变异系数分别为44.51％和43.90％,说明体质量具有较大的选育潜力.短圆体型和长体型群体各生长性状测定结果显示,尾柄高、体宽和体质量性状在两群体间差异不显著(P>0.05),而其他生长性状存在极显著差异(P<0.01).在短圆体型群体起主要作用的形态性状有4个(体长、尾柄高、体高和头高),而在长体型群体起主要作用的形态性状有5个(全长、体宽、体高、头长和头高).短圆体型和长体型群体对体质量起主要作用的形态性状复相关系数(R2)分别为0.951和0.953,说明分析得到的影响体质量的主要形态性状准确性高.采用灰色关联度分析结果表明,短圆体型和长体型灰色关联系数平均值分别为0.827～0.860和0.760～0.803,从同一形态性状来看,短圆体型群体与体重关联系数的平均值均大于长体型群体.[结论]2种体型群体分别取通径分析保留的形态性状与灰色关联分析关联系数排名前5的形态性状的交集,表明短圆型体型群体与体质量最相关的形态性状为体长、尾柄高、体高和头高,而长体型群体与体质量最相关的形态性状为全长、体宽和体高,两种分析结果一致性较好.

    禾花鲤形态性状相关分析多元回归灰色关联度分析通径分析

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    罗氏沼虾野田村病毒和十足目虹彩病毒1二重荧光定量PCR检测方法的建立及应用

    黄玉英杨明伟谭红连梁正...
    1474-1482页
    查看更多>>摘要：[目的]建立能同时检测罗氏沼虾野田村病毒(MrNV)和十足目虹彩病毒1(DIV1)的二重荧光定量PCR,为罗氏沼虾白尾病(WTD)及虹彩病毒病(DIV1D)的临床诊断和疫情监测提供更简便和高效的检测方法.[方法]分别根据MrNV-CP基因和DIV1-MCP基因的保守序列设计特异性引物和TaqMan-MGB探针,将目的基因片段分别克隆至pGM-T载体上制备重组质粒(pGM-T-CPMrNV和pGM-T-MCPDIV1),其中,pGM-T-CPMrNV用Sal I酶切后经体外转录获得MrNV标准品RNA,pGM-T-MCPDIV1则直接作为DIV1标准品DNA;以标准品为模板进行反应条件优化及标准曲线制定,建立可同时检测MrNV和DIV1的二重荧光定量PCR,并对该方法进行特异性、敏感性、重复性及临床应用试验.[结果]制备的MrNV标准品RNA和DIV1标准品DNA均具有很好的稳定性,可作为标准品和阳性对照使用;标准品起始模板范围为1.0×101～1.0×108 Copies/反应时,建立的标准曲线具有良好线性关系.优化后的二重荧光定量PCR灵敏度高,对标准品的检测灵敏度可达10 Copies/反应,对罗氏沼虾组织样品的检测灵敏度约10 Copies/mg;与其他虾类常见病原无交叉反应,且整个检测过程仅需1 h左右.二重荧光定量PCR检测MrNV的组内试验和组间试验变异系数分别为0.31％～0.93％和0.96％～1.33％,检测DIV1的组内试验和组间试验变异系数分别为0.35％～0.81％和0.78％～1.04％.应用建立的二重荧光定量PCR和国内现行有效标准的套式PCR分别对117份临床样品进行MrNV和DIV1检测,结果显示对MrNV和DIV1检测的符合率分别为99.15％和97.44％,且二重荧光定量PCR检测目标病毒拷贝数较低样品时较套式PCR具有更高的灵敏度.2020年广西罗氏沼虾样品MrNV和DIV1的阳性检出率分别为6.0％和11.0％.[结论]结合TaqMan-MGB探针技术建立的二重荧光定量PCR能同时检测MrNV和DIV1,且具有灵敏度高、特异性强、重复性好、简便快速的特点,可为WTD和DIV1D的临床诊断及实时监测提供技术保障.

    罗氏沼虾野田村病毒(MrNV)十足目虹彩病毒1(DIV1)TaqMan-MGB探针二重荧光定量PCR

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