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合成生物学
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合成生物学/Journal Synthetic Biology JournalCSCDCSTPCD北大核心
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    基于高通量液相色谱质谱技术的菌株筛选与关键分子定量分析研究进展

    吴玉洁刘欣欣刘健慧杨开广...
    1000-1019页
    查看更多>>摘要:合成生物学是21世纪新兴的交叉学科,已经为医药、化工、能源、食品和农业等领域带来了显著的改变.微生物细胞工厂(microbial cell factory,MCF)的构建和应用是合成生物学的重要研究内容,正迅速向实用化、产业化的方向发展.得益于基因编辑技术的进步,MCF菌株文库构建的能力大幅提升,亦产生了数量庞大的待测样本,亟需发展高通量自动化的分析检测方法与之匹配.此外,针对关键代谢酶或代谢物的高通量检测技术,也对MCF改造乃至工业化生产有重要的指导意义.液相色谱质谱技术是生物分子检测分析的重要手段,在蛋白质、代谢物定量分析方面占据重要地位.因此本文总结回顾了近年来高通量液相色谱质谱技术在微生物菌株筛选及关键分子定量分析方面的研究进展,从样品制备、色谱分离、质谱分析及数据处理等层面展开阐述,并对这一领域与自动化平台结合的前景及如何深度融合的挑战进行简要概括,为推动基于合成生物学生物智造领域的快速发展提供指导.

    液相色谱质谱高通量筛选蛋白质组学代谢组学合成生物学微生物细胞工厂

    单细胞拉曼光谱测试分选装备研制及应用进展

    刁志钿王喜先孙晴徐健...
    1020-1035页
    查看更多>>摘要:合成生物学的跨越式发展,取决于"设计-构建-测试-学习"(design-build-test-learn)这四大环节的突破.随着基因组测序、编辑、合成以及人工智能技术的日新月异,业界设计和构建突变体甚至人工细胞工厂的能力已经突飞猛进.然而,合成生物学至今仍面临的困境之一便是"大体系的复杂性难以处理",一旦体系变大,细胞表型测试与分选的工作量就非常艰巨,甚至不可完成.单细胞拉曼光谱(SCRS)技术能够在活体单细胞水平、非标记状态下识别全景信息从而分辨复杂功能表型,且具有快速、低成本、能够与下游细胞组学研究耦联等优势,被视为全新的单细胞表型识别技术.目前,基于SCRS技术强大的表型识别能力已发展了系列合成表型的测试与分选装备,并进行了广泛的应用示范,展示了其助力合成生物学表型测试与分选的巨大潜力.本文选取自主研制的单细胞拉曼光镊分选仪(RACS-Seq)、单细胞微液滴分选系统(EasySort)和高通量流式拉曼分选仪(FlowRACS)为典型仪器装备,分别概述其技术原理和技术迭代以及特色应用案例等.本文最后对当前基于SCRS技术的合成表型测试分选装备所存在的问题及潜在解决策略进行了探讨和展望.

    合成生物学单细胞拉曼光谱技术细胞工厂单细胞表型识别高通量分选

    面向自动化铸造平台的多功能微孔板检测系统

    马翠杨凡张君泰何凯...
    1036-1049页
    查看更多>>摘要:生物分析技术正向高通量、高灵敏度、多功能方向发展,微孔板检测仪作为高通量分析的基础仪器,需要满足微量化、自动化、集成化的要求.目前国内单一功能的微孔板检测仪器技术成熟,检测精度已与国际水平相当,但多功能的微孔板检测仪还较少,大多使用进口仪器.进口产品价格昂贵,有些操作指令不公开,不易集成到自主研发的合成生物自动化铸造平台项目.本研究将对高精度吸光度检测和高灵敏度荧光检测等关键技术进行研究,开发具有吸光检测和荧光检测功能的微孔板检测仪,并自主开发控制系统及数据采集分析软件,使其易于接入自动化铸造平台.该微孔板检测仪结构紧凑,吸光检测和荧光检测模块独立,波段可扩展.通过实验测试,所研发的微孔板检测仪的吸光度检测重复性为0.3%,10 s内可完成96孔的吸光检测;荧光检测数据在皮摩尔浓度范围内线性度较好,对荧光素钠溶液的检测灵敏度大约3.9 pmol/L.此外,该系统可通过串口直接连接自动化平台集成控制系统,也可通过TCP方式进行远程通信控制.

    微孔板自动化平台吸光度荧光检测

    征稿简则

    封3页