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期刊信息/Journal information
生物学杂志
生物学杂志

宋礼华

双月刊

2095-1736

swxzz@163.com

0551-62673629

230001

安徽省合肥市花园街83号合肥大厦9楼

生物学杂志/Journal Journal of BiologyCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是生命科学的综合性学术期刊，主要刊登动物、植物、微生物及其生理、生化、遗传和生物技术、生物工程、分子生物学、生物教学等方面的文章。
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    在耐热的马克斯克鲁维酵母中构建微生物细胞工厂

    王冬梅洪泂
    1-10页
    查看更多>>摘要：马克斯克鲁维酵母具有耐高温、高生长速率、可利用广泛的碳源等优点,作为微生物细胞工厂的宿主菌有很大优势.野生型的马克斯克鲁维酵母在生产菊糖酶、乙醇、苯乙醇及乙酸乙酯等产品上有了一些研究成果;为了进一步提高其作为微生物细胞工厂的生产效率,也可对该酵母进行基因工程改造,其遗传操作系统包括宿主菌、外源基因的表达方法和基因敲除方法也逐渐建立和完善;在此基础上以马克斯克鲁维酵母为平台通过工程改造构建的微生物细胞工厂具有了一定的高效生产重组蛋白、乙醇、木糖醇、乳酸、果糖、虾青素等产品的能力.但是马克思克鲁维酵母在多种碳源的共利用、抑制物耐受、高浓度底物和产物的耐受等方面能力仍需进一步提高.

    马克斯克鲁维酵母耐热微生物细胞工厂

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    基于图注意力深度神经网络的癫痫脑电尖波识别

    崔昊天宋森
    11-15页
    查看更多>>摘要：头皮脑电记录中的尖波识别能够为癫痫诊断提供重要的帮助和参考,但已报道方法中存在特异性低,忽略多通道间信息等问题.通过建立一种深度神经网络算法,实现癫痫脑电中尖波自动识别.研究中以临床头皮脑电记录为样本,首次建立层叠的卷积与图注意力深度神经网络模型进行识别,分别对脑电电极通道内和通道间的特征作有效提取.实验不仅发现算法的识别准确率达到93.55％,特异性96.83％,相较于对比方法有明显提升;同时通过电极通道间的注意力指数得到和尖波放电明显相关的电极关系图,有尖波发生的电极区域在图中明显聚集并分离于背景电极,可以为癫痫病灶定位提供辅助信息.上述算法,创新地利用多通道间信息,取得了领先的识别准确率,具有良好的临床应用前景.

    头皮脑电尖波识别深度学习注意力模型卷积神经网络

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    γH2AX、53BP1及RAD51焦点用于分析DNA双链断裂损伤

    王依朝樊丽王红霞杨思路...
    16-19页
    查看更多>>摘要：γH2AX、53BP1及RAD51焦点(foci)是DNA双链断裂(DSBs)损伤修复的评价指标.其中,γH2AX分析应用最为广泛,但最新有研究发现其并不完全与DSBs损伤一致.系统分析了DNA损伤时γH2AX、53BP1及RAD51 foci的动力性变化及其在DSBs损伤评估中的合理应用.结果表明,在电离辐射处理时,γH2AX和53BP1 foci具有高度一致性,均可反映DSBs损伤及修复的动力性变化,而RAD51 foci仅出现在部分损伤细胞中,与其主要参与同源重组修复一致.在喜树碱(CPT)处理时,γH2AX呈现两种染色类型(亮而离散的foci和泛核磷酸化),53BP1 foci仅出现在亮而离散的γH2AX foci阳性细胞且与其高度一致.结果提示,单独γH2AX染色阳性并不能准确代表DS-Bs损伤,而应结合53BP1等染色来综合分析DSBs损伤程度;RAD51 foci分析仅能反映部分细胞的DSBs损伤修复(主要是同源重组)情况.

    DNA双链断裂DNA修复电离辐射磷酸化的组蛋白H2AX

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    小鼠CYP2J5基因组织差异表达及蛋白质结构与功能分析

    白皓路宏朝王令王珊珊...
    20-25页
    查看更多>>摘要：为探讨小鼠CYP2J5的结构特征及生物学功能,首先通过实时荧光定量PCR分析了小鼠CYP2J5基因组织差异表达,然后采用生物信息学工具进行了CYP2J5蛋白质结构与功能的预测和分析;为进一步探索和验证CYP2J5生物学功能及对脂代谢和性激素合成的影响,基于基因工程技术构建CYP2J5基因的超表达载体,并通过Western Blot确认构建的载体能正确表达CYP2J5基因.最终将构建的CYP2J5超表达载体导入小鼠TM3细胞,通过qPCR分析了脂代谢和性激素合成相关基因表达.结果显示,小鼠CYP2J5基因在肝脏和肾脏中高水平表达,该基因属可溶性胞质蛋白质,蛋白质二、三级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,有信号肽存在并在第13～35及75～97个氨基酸之间存在跨膜区,其主要功能是参与细胞脂代谢和脂肪酸代谢等生物调节过程.在TM3细胞中超表达CYP2J5基因后,脂代谢与性激素通路关键基因有显著变化.结果为CYP2J5基因功能的研究与开发利用提供了生物信息学和分子生物学方面的基础数据.

    CYP2J5基因超表达载体生物信息学

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    水稻脆茎突变体细胞壁组分与茎秆力学性能的研究

    汪清焰刘斌美杨阳叶亚峰...
    26-29页
    查看更多>>摘要：水稻抗倒伏能力是稳定水稻生产力的重要因素.利用重离子辐照水稻'武运粳7号'(野生型)获得11种脆茎突变体.基于上述12种材料,研究成熟期细胞壁组分与水稻茎秆弯曲强度和拉应力等力学性能的关系,以期为水稻抗倒伏品种选育提供科学借鉴.研究结果表明,脆茎突变体茎秆细胞壁纤维素含量均比野生型低,降低幅度为4.45％ ～33.63％;半纤维含量高于野生型,提高幅度为19.80％ ～37.88％.茎秆弯曲强度与纤维素含量呈显著正相关(R=0.9342).分别分析倒1至倒44个节间的拉应力与纤维素含量关系,其相关系数分别为:R1=0.8475,R2=0.9212,R3=0.8791,R4=0.9203(P<0.05);4个节间的拉应力与半纤维素和木质素含量没有明显线性关系.上述结果表明茎秆脆性的力学特性主要由细胞壁组分中纤维素决定.

    脆茎突变体茎秆细胞壁组分弯曲强度拉应力

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    豆科植物dxr基因密码子偏好性分析

    李凌烜陈安琪黄凯郝博新...
    30-34页
    查看更多>>摘要：1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase,DXR)是MEP途径的关键酶之一,参与植物萜类与蒽醌等化合物的生物合成.萜类与蒽醌类化合物在较多豆科植物中存在,研究豆科植物dxr基因的密码子偏好性,对以dxr基因为靶点的分子调控具有重要指导意义.运用CodonW、CHIPS、CUSP和CAI等程序分析豆科植物drx基因密码子的偏好性,并用豆科植物决明的dxr基因对分析结果的可靠性进行验证.研究成果显示,以A或U结尾的密码子在dxr基因的密码子中表现出较强的偏好性.相比于烟草,拟南芥更适合作为研究dxr基因功能的模式植物.比较豆科植物dxr基因与大肠杆菌及酵母基因组密码子偏好性,发现酵母的差异明显低于大肠杆菌,表明对于豆科植物dxr基因来说,酵母表达系统比大肠杆菌表达系统更好.但是要使豆科植物dxr基因在酵母表达系统中具有高表达效率,仍需对其密码子进行优化.

    豆科植物1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶密码子偏好性聚类分析

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    N-氨甲酰谷氨酸对猪胎盘滋养层细胞增殖及基因表达的影响

    韦尚丽马文清白佳桦许晓玲...
    35-38页
    查看更多>>摘要：N-氨甲酰谷氨酸(NCG)对母猪胎盘发育和功能存在积极地调控作用.为研究NCG对母猪胎盘调控的作用机理,使用猪胎盘滋养层细胞(pTr)作为模型,用NCG体外处理猪pTr,研究NCG对细胞增殖和胎盘功能相关基因表达的影响.结果显示:1～25 mmol/L的NCG可以促进猪pTr细胞增殖1.2～1.5倍(P<0.05),10 mmol/L的NCG处理猪pTr后可显著上调CDK4、CCND1、SLC2A1和CAT基因的表达水平(P<0.05).可见,NCG通过调控细胞周期、葡萄糖转运和抗氧化应激促进猪pTr细胞增殖.

    N-氨甲酰谷氨酸胎盘滋养层细胞细胞增殖基因表达

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    亲本引起断乳前小鼠的位置偏爱及神经内分泌反应

    马小梅刘朝宝赫晨王建礼...
    39-44页
    查看更多>>摘要：断乳前紧密的亲-子联系对于哺乳动物非常重要,这种联系促进了亲-子双方形成对彼此的情感依附,但关于幼体对亲本形成依附的机制还不清楚.精氨酸加压素(AVP)和皮质酮(CORT)在社会互作和社会联系中具有重要作用.为了探讨ICR品系小鼠幼体对母本或父本形成依附的可能机制,利用条件位置偏爱(CPP)实验检测了断乳前雄性幼体经过父鼠或母鼠4d强化后的位置偏爱,利用免疫组织化学方法检测了形成位置偏爱时幼鼠下丘脑室旁核(PVN)和视上核(SON)AVP和c-Fos免疫活性神经元的表达,通过酶联免疫实验检测了血清CORT水平.结果发现,断乳前幼体能够产生对母鼠或父鼠信息箱的位置偏爱(P<0.05),与空箱强化相比,母鼠或父鼠强化均增加了幼体PVN的c-Fos阳性神经元表达(P<0.05),减少了血清CORT水平(P<0.05),而且经过母鼠强化的幼体PVN呈现出更多的AVP阳性神经元(P<0.05).与父鼠强化的幼体相比,母鼠强化的幼体PVN的c-Fos阳性神经元较少(P<0.05),血清CORT水平较低(P<0.05).SON的c-Fos和AVP免疫活性神经元没有显著性差异(P>0.05).这些结果表明母鼠或父鼠强化可以引起幼鼠的位置偏爱,这种位置偏爱可能与PVN的神经元活动、AVP释放及血清CORT的改变有关,而且母鼠强化和父鼠强化引起幼鼠的神经内分泌活动不同.

    ICR品系小鼠位置偏爱精氨酸加压素皮质酮c-Fos

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    北京地区不同分娩方式婴幼儿肠道菌群分析

    安云鹤安涛武会娟程小艳...
    45-49页
    查看更多>>摘要：婴幼儿时期肠道菌群的定殖是肠道菌群形成的关键时期,影响未来生长发育和健康状况.旨在探讨不同分娩方式婴幼儿肠道菌群多样性差异.选取258例0～3岁北京地区健康婴幼儿肠道粪便样品,其中包括97例剖宫产样品、161例自然分娩样品.通过高通量测序技术分析表明,某些细菌的相对丰度发生显著改变.与剖宫产婴幼儿相比,自然分娩婴幼儿肠道中的放线菌门(优势菌,13.92％VS 16.86％)和酸杆菌门(劣势菌,0％VS 0.00204％)的相对丰度显著升高(P<0.05);而厚壁菌门(优势菌,67.17％VS 61.16％)和柔膜菌门(劣势菌,0.074％VS 0.051％)的相对丰度明显下降(P<0.05).在属水平上,优势菌中的双歧杆菌属(13.01％VS 15.74％)在自然分娩婴幼儿肠道粪便中的含量显著升高,而梭菌属(2.25％VS 1.53％)显著降低.

    分娩方式婴幼儿肠道菌群年龄BMI

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    南沙海区深海沉积物中细菌多样性分析

    苏洁明红霞陈泉睿张春鑫...
    50-53页
    查看更多>>摘要：为研究南沙海区深海沉积物中细菌多样性,采用16S rDNA克隆文库方法对南沙群岛3个深海站位沉积物中获得的565个阳性克隆子进行序列测定.发现3个站位所获的序列涵盖了变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、放线菌门(Actinobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospira)、绿屈挠杆菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Ac-idobacteria)、螺旋体(Spirochaetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)共10个门.其中变形菌、浮霉菌和放线菌均为群落优势类群,这些优势类群组成与陆地以及海水中细菌优势类群存在显著差异,同时各站位细菌群落又表现出一定差异.上述结果表明南沙海区深海沉积物中具有丰富的细菌多样性,并且与其生存的环境密切相关.

    南沙深海沉积物细菌多样性

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