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微生物学通报
微生物学通报

赫荣乔

月刊

0253-2654

tongbao@im.ac.cn

010-64807511

100101

北京朝阳区北辰西路1号院2号中国科学院微生物研究所B401

微生物学通报/Journal MicrobiologyCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊1974年创刊,是中国微生物学会和中国科学院微生物研究所主办,国内外公开发行,以微生物学应用基础研究及高新技术创新为主的综合性双月学术期刊。主要刊登微生物学、生物工程、病毒学、酶工程、发酵工程、细胞工程等领域的最新研究成果,产业化新技术和新进展。设置的栏目有:研究报告、研究快报、专论与综述、技术与方法、高等院校教学、名师讲堂以及企业高科技信息与新产品介绍、专题专栏、专家论坛、书讯、会讯等。读者对象为科研院所、大专院校、医院、卫生防疫(检疫监察部门)、生物工程公司、环境保护、企业厂矿等单位。发行范围涵盖教育、科研、工业、农业、医药、环境、食品保健等领域。
正式出版
收录年代

    慢性阻塞性肺疾病小鼠肠道免疫球蛋白A包被微生物组成及基因功能分析

    康宇婷李秋洁邱卓然续超...
    2676-2689页
    查看更多>>摘要:[背景]小气道免疫球蛋白A(immunoglobulin A,IgA)在慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的病理生理学中发挥着重要作用.然而肠黏膜来源的IgA在COPD病程中的作用及包被微生物群尚不明确.[目的]探讨COPD小鼠肠来源IgA包被肠道微生物组成、丰度及菌群基因功能变化.[方法]采用鼻腔滴入脂多糖和熏香烟法相结合建立COPD小鼠模型.收集COPD小鼠和野生型小鼠粪便样品各 12 份,IgA磁珠分选IgA包被的肠道微生物菌群,16S rRNA基因高通量测序分析其组成及功能.[结果]通过比较两组肺组织切片染色、平均内衬间隔(mean linear intercept,mLI)和肺泡灌洗液炎症因子浓度证实COPD模型鼠建模成功.OTU和主成分分析(principal component analysis,PCA)均发现两组间粪便样品中肠来源IgA包被微生物群落差异大,具有可比性.α多样性分析显示两组间物种多样性无显著统计学差异(P>0.05).物种组成分析显示:两组肠来源IgA包被的菌群结构和菌群差异具有统计学意义(P<0.05).COPD组的菌群结构中显著富集的菌目是:蛭弧菌目(Bdellovibrionales)、梭菌目(Clostridiales)和双歧杆菌目(Bifidobacteriales);科层面分类中富集的主要是:普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、梭菌科(Clostridiaceae)、类芽孢杆菌科(Paenibacillaceae)、蛭弧菌科(Bdellovibrionaceae)及双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae);菌属层面分类上主要富集拟普雷沃氏菌属(Alloprevotella)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus)、狭义梭菌属(Clostridium-sensu-stricto)、苏黎世杆菌属(Turicibacter)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、吸血弧菌属(Vampirovibrio)和双歧杆菌属(Bifidobacterium).菌群差异基因通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库通路富集分析结果显示 COPD 组细胞生长与死亡、核苷酸代谢以及消化系统相关通路明显上调,而膜运输相关通路显著下调.[结论]COPD小鼠肠来源IgA包被肠道微生物存在紊乱及基因功能失调.

    慢性阻塞性肺疾病免疫球蛋白A包被肠道微生物16SrRNA基因测序

    抗氧化菌株的筛选及其对HepG2细胞氧化应激损伤的保护作用

    苏林浩杜晓娜蔡奕贤张帮周...
    2690-2701页
    查看更多>>摘要:[背景]机体的氧化损伤会引发多种疾病和机体衰老,研究发现益生菌可以改善宿主的代谢水平,提高宿主的抗氧化能力,为抗氧化产品开发提供新方向.[目的]筛选具有良好抗氧化效果的菌株,为抗氧化药物以及保健品的开发和研究提供菌种材料.[方法]将从江西省宜春市温汤长寿村地区的健康人群粪便中筛选出的菌株进行16S rRNA基因鉴定,挑取其中6株益生菌,通过测定其培养液上清中的超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GSH-Px)酶活及 1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-dipheny-2-picrylhydrazyl,DPPH)自由基清除能力,选取一株抗氧化能力最佳的菌株进行后续细胞实验.建立HepG2 细胞氧化应激损伤模型,使用CCK-8 法评估其培养液上清对HepG2 细胞氧化应激损伤的保护效果,通过试剂盒测定培养液上清对细胞中SOD酶活的保护作用,并进一步验证其培养液上清的抗氧化效果.[结果]筛选出的 6 株益生菌培养液上清中,菌株H0661 表现出最佳的抗氧化能力,其培养液上清中GSH-Px酶活为 586.11 U/mL(P<0.01),SOD酶活为 1278.00 U/mL(P<0.01),DPPH自由基的清除能力达到 40.5%.结合 16S rRNA基因鉴定结果,将其命名为木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus)TG022.木糖葡萄球菌TG022 培养液上清浓度为 15%时对HepG2 细胞氧化应激损伤的保护效果最佳(P<0.01).此外,木糖葡萄球菌TG022 培养液上清能有效保护HepG2 细胞氧化应激损伤中SOD活性(P<0.01).经木糖葡萄球菌TG022 培养液上清处理后可以有效提高HepG2 细胞的抗氧化活性(P<0.05).[结论]本研究筛选出一株木糖葡萄球菌TG022,其培养液上清表现出良好的抗氧化效果,为研发抗氧化药物和保健品提供了一个潜在的菌株材料.

    菌株筛选木糖葡糖球菌抗氧化

    分光光度法快速测定副鸡禽杆菌菌液浓度的应用

    佟仁冬冯妍刘燕张一帜...
    2702-2710页
    查看更多>>摘要:[背景]感染副鸡禽杆菌(Avibacterium paragallinarum)会引起一种鸡的急性上呼吸道疾病——传染性鼻炎.一般情况下该病潜伏期短、发病急且传染性强,易给养殖场造成巨大的经济损失.[目的]比较分光光度法(spectrophotometry,SP)与平板菌落计数法(plate colony count,PCC)测定副鸡禽杆菌菌液浓度的准确性,探究 SP 替代 PCC 的可行性.[方法]无菌生理盐水悬浮副鸡禽杆菌菌液沉淀物,用SP测定不同稀释度菌悬液吸光度值(OD值),用PCC测定活菌数.以不同波长(450、540、600 和 650 nm)测定的OD值为自变量,活菌数为因变量,获得标准曲线和线性方程,比较分析确定最适测定波长.设置胰蛋白胨大豆肉汤培养基(tryptone soy broth,TSB)组和无菌生理盐水(sterile physiological saline solution,SPSS)组,分别以TSB和SPSS为悬浮液和稀释液,用 SP 和 PCC法分别测定不同稀释度的副鸡禽杆菌菌悬液,通过标准曲线和线性方程比较分析两种悬液对OD值与菌液浓度相关性的影响.取不同培养阶段(10、12、14、16 和 18 h)菌液,以测定OD值直接输入线性方程获得菌液浓度,同时进行平板菌落计数,采用SPSS 17.0 软件统计分析以验证SP法适用性.[结果]在波长 600 nm下测定的OD值与PCC结果线性关系最佳(R2>0.995).在该波长下,TSB组与SPSS组测定的OD值与PCC结果无显著差异(R2差=0.0005),且TSB组略优于SPSS组(R2TSB=0.9989>R2SPSS=0.9984).培养 10、12、14 h时SP与PCC法测定结果差异不显著(P>0.05),而培养 16 h和 18 h时差异显著(P<0.05).[结论]在对数生长期及稳定期,采用分光光度法测定OD600 值可快速确定副鸡禽杆菌菌液浓度.

    副鸡禽杆菌分光光度法平板菌落计数法菌液浓度

    基于CiteSpace文献计量的畜禽粪便抗生素抗性基因研究进展与热点分析

    徐超蝶沈菊培贺纪正
    2711-2726页
    查看更多>>摘要:自 20 世纪 40 年代抗生素被发现以来,抗生素广泛应用于畜禽养殖系统,极大地促进了畜禽健康和生长.由于大多数抗生素的性质都是水溶性的,有 30%-90%的兽用抗生素会以母体化合物的形式通过尿液或粪便释放到环境中.抗生素的不当使用会对环境产生选择性压力,促使抗生素抗性基因(antibiotic resistance gene,ARG)快速传播,对人类健康和生态系统构成潜在风险.因此,认识和回顾近 20 年国内外关于畜禽粪便ARG的研究热点、前沿和趋势,可为畜禽粪便ARG污染管控提供重要参考,也为今后的研究提供思路.本研究应用 CiteSpace可视化软件对 2002-2022 年发表在Web of Science(WoS)核心合集和中国知网(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)的文献通过关键词共现分析、关键词聚类分析、关键词突现分析、发文数量分析、国家分布机构合作共现等方式对畜禽养殖系统中ARG研究现状及新兴趋势进行分析,最终共筛选出 896篇有效文献.自2011 年以来,畜禽粪便 ARG国内外文献发表数量逐年增加,2014 年以后增速明显加快,其中英文文献的发文量要多于中文文献;中国是发文量最多的国家,而中国科学院是发文量最多的机构.热门的研究领域包括ARG的产生和来源、在环境中的传播及其对人类病原体的潜在暴露途径及消减机制.今后研究工作可利用宏基组学技术、高通量定量基因芯片手段和单细胞拉曼光谱等新兴分子生物学技术进行更为深入的机理性探索,同时加强畜禽粪便 ARG 消减技术策略的发展和应用.本文以可视化的方式阐释了畜禽粪便ARG研究发展态势,提出了未来重点研究方向,为管控畜禽粪便ARG提供了理论基础.

    畜禽粪便抗生素抗性基因文献计量研究进展热点