查看更多>>摘要:为了解山东省H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)流行及遗传变异情况,采用H9亚型AIV荧光定量RT-PCR方法对采集自山东部分地区有呼吸道症状养鸡场的492份鸡气管和肺脏组织样品进行检测,并对检测出的阳性样品进行鸡胚接种,利用Illumina Miseq测序平台将分离株进行全基因组测序,并构建了进化树,分析了与流感病毒传播能力及致病性相关的关键氨基酸位点的特征.结果显示,492份样品中有72份为H9亚型AIV阳性,阳性率14.63%,阳性样品经鸡胚传代后获得34株H9亚型AIV,通过全基因组测序后分析可得34株分离株均为H9N2亚型AIV.通过HA和NA基因进化树分析,34株分离株HA基因均属于Y280-like分支,NA基因均属于F/98-like分支,在此分支基础上,均存在明显的时间节点小分支,一支为"2013年以前分离株"分支,一支为"2013年以后分离株"分支.分离株HA裂解位点均为325 PSRSSR ↓ GLF333,符合低致病性AIV特征,所有病毒均发生了Q226 L具有结合哺乳动物α-2,6受体的能力的氨基酸位点突变.内部基因哺乳动物适应性关键氨基酸位点中,所有病毒PB1蛋白发生了 I368V增强病毒在哺乳动物传播能力的氨基酸位点突变,部分毒株PB2蛋白发生I292 V和A588 V哺乳动物适应性增强的氨基酸位点突变.结果表明,山东省H9N2亚型AIV各基因节段存在不同程度的重组和基因变异情况,需加强病毒变异监测.