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期刊信息/Journal information
中华实验和临床病毒学杂志
中华实验和临床病毒学杂志

洪涛

双月刊

1003-9279

bianjibu2005@sina.com

010-63540009

100052

北京市宣武区迎新街100号

中华实验和临床病毒学杂志/Journal Chinese Journal of Experimental and Clinical VirologyCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>1987年10月创刊，中国科协主管，中华医学会主办。本刊是医学病毒学专业学术期刊，报道医学病毒学的应用及基础理论研究，人类病毒性疾病预防。栏目：述评、人物述林、病毒学、医学微生物学、传染病学、流行病学、儿科学、免疫学、肿瘤学、分子生物学临床免疫、病毒检测、医药信息等。读者为本专业科研人员、老年医学等学科的科技工作者，从事医学病毒学研究的科研人员；高、中等医药院校的有关教学人员；病毒性传染病的临床医师；生物制品工作者；各级卫生防疫工作者；临床检验工作者，以及与人畜共患病毒性疾病防治有关的基层工作者。
正式出版
收录年代

    新冠感染次数和免疫对病毒变异的影响研究

    许果樊欢付建光余慧燕...
    481-488页
    查看更多>>摘要：目的 分析新冠病毒感染和疫苗接种在病毒变异中的影响.方法 选取了江苏省2023年2 659份本土新型冠状病毒标本的全基因组测序序列进行了分析,并收集人口学和临床特征等相关信息,利用单因素和多因素线性回归模型分析探讨感染及疫苗接种对病毒全基因组变异速率和S基因选择压力的影响.结果 这些感染者的平均年龄为55.0(31.0,74.0)岁,60岁及以上年龄组1 150例(43.2％),男性1 367例(51.4％),有新冠疫苗接种史者2 044例(76.9％),初次感染新冠者1 629例(61.3％);感染者临床症状以轻型为主,共2 434例(91.5％),重型及以上症状者29例(1.1％).SARS-CoV-2 全基因组的平均替换速率为 9.69(9.38,9.98)×10-4 subs/site/year,S 基因的dN/dS值为6.08(5.56,8.66),显著大于1(P＜0.001),表明受到了正选择作用.单因素和多因素线性回归模型分析结果显示,具有疫苗接种史且再次感染、年龄20～30岁、60岁及以上者的SARS-CoV-2替换速率更高,男性、临床症状为中型、重型及以上者的SARS-CoV-2替换速率更低;具有疫苗接种史且再次感染、50～60岁、60岁及以上者的S基因dN/dS更小.结论 在新冠疫苗接种及感染施加的免疫压力下,新冠病毒全基因组变异加快,但S基因的非同义突变率减弱,引起这些现象的机制需进一步深入研究.

    SARS-CoV-2S基因变异特征替换速率选择压力

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    优化SARS-CoV-2 S-EABR在293T细胞中的分泌性表达

    姜苏芮毛彤瑶张鹏段招军...
    489-496页
    查看更多>>摘要：目的 通过优化启动子、终止子、信号肽及胞内序列末端氨基酸来增加SARS-CoV-2 S-EABR蛋白在293T细胞系中的分泌性表达.方法 首先构建四种含有不同元件(启动子和终止子)组合的PCDNA3.1(-)真核载体质粒(Mb、MS、Ab、AS),插入按照人密码子优化的S-EABR-1目的序列,瞬时转染293T细胞,48 h后收取细胞培养上清液和细胞裂解液,通过Western Blot和ELISA检测上清S蛋白的表达水平.然后选择表达最好的元件组合载体,插入S-EABR-1和S-EABR-2(于S-EABR-1尾部添加4个氨基酸——HSLP)目的序列,比较上清S蛋白的表达水平.最后基于上述表达效果最好的元件组合载体及插入目的序列,构建替换SARS-CoV-2 S蛋白原始信号肽的5种载体质粒(tPA,AZ,IFNα2,HSA,GLUC),比较上清S蛋白表达水平.同时利用计算机模拟SRP54亚基与信号肽核酸序列的分子对接,将对接分值(Docking Score)作为对接评价标准,预测两者的结合情况.结果 在293T细胞中,Ab组合的载体分泌表达S-EABR水平最高,产量相较于Mb增加了 125％.基于Ab组合载体,S-EABR-2序列表达分泌S-EABR的水平较S-EABR-1增加了约50％,进一步替换成HSA信号肽后的S-EABR表达分泌水平较S蛋白原始信号肽增加了约83％.此外,计算机模拟结果显示HSA与SRP54亚基的对接分值最高,为1 505.861.结论 通过真核表达元件(启动子、终止子和信号肽)及胞内序列的优化可进一步提高经密码子优化后的S-EABR在293T细胞中的分泌性表达.信号肽与SRP54亚基亲和力的计算模拟对接分值与S-EABR分泌表达水平基本吻合的结果也为后续提高目的基因分泌性表达的信号肽筛选提供了一种设计思路和筛选策略.

    新型冠状病毒S-EABR启动子终止子信号肽信号识别颗粒

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    用人工智能(AI)探索RNA病毒世界

    Xin HouYong HePan FangShi-Qiang Mei...
    496页
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    重组呼吸道合胞病毒G蛋白保守域的腺病毒载体疫苗的研究

    石艺柴鹏弟段招军章青...
    497-505页
    查看更多>>摘要：目的 以非复制型的5型人腺病毒(human adenovirus type 5,Ad5)为载体,构建重组呼吸道合胞病毒G蛋白(RSV-G)保守域的腺病毒载体疫苗,利用小鼠评价其免疫原性及免疫保护效果.方法 利用分子克隆方法构建插入能串联表达A亚型和B亚型RSV-G保守域(Gbcc和Gacc)的重组Ad5载体质粒(Ad5-Gbcc-Gacc)并转染HEK293A细胞,获得重组腺病毒Ad5-Gbcc-Gacc;通过多酶切鉴定病毒Ad5-Gbcc-Gacc的基因组,用Western blot验证Gbcc-Gacc基因的表达水平;重组腺病毒通过肌肉注射免疫BALB/c小鼠1次,在第6周用RSV Long毒株对小鼠以滴鼻的方式进行攻毒.用酶联免疫吸附试验(Elisa)检测和评价免疫小鼠血清IgG及抗体亚型,用微中和检测的方法测定中和抗体水平,同时每天记录小鼠攻毒前后的体重,并检测小鼠肺组织的病理变化、肺和鼻组织中RSV病毒拷贝数.结果 Western blot及多酶切鉴定结果与预期相符,表明重组腺病毒拯救成功.Ad5-Gbcc-Gacc在小鼠体内可以诱导较高滴度的特异性IgG、中和抗体水平及Th1/Th2平衡的免疫反应.与未免疫小鼠比较,经Ad5-Gbcc-Gacc免疫小鼠攻毒后肺部只有轻微病理损伤,且肺部及鼻甲的病毒拷贝数降低.结论 Ad5-Gbcc-Gacc具备良好的免疫原性,并能对RSV感染小鼠有一定的保护作用,为进一步研制基于G蛋白的RSV疫苗奠定了基础.

    腺病毒载体呼吸道合胞病毒G蛋白中央保守域疫苗

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    统计学方法基本要求

    编辑部
    505页
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    HBsAb阳性隐匿性乙型肝炎病毒T细胞及B细胞表位变异分析

    郭燕景媛媛李锦巩晗实...
    506-512页
    查看更多>>摘要：目的 分析隐匿性乙型肝炎病毒(occult hepatitis B virus,OHBV)PreS-S基因T、B细胞表位变异情况,探讨隐匿性乙型肝炎病毒感染(occult hepatitis B virus infection,OBI)及HBsAb+OBI发生机制.方法 利用巢式聚合酶链反应(nested PCR)扩增OBI样品PreS-S区并测序,确定基因型.生物信息学分析HBsAb+/HBsAb-以及不同基因型OBI毒株PreS-S基因T、B细胞表位变异情况,分析高频T细胞突变表位突变前后与人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)亲和力变化以及高频B细胞突变表位突变后抗原特性的改变.结果 85份OBI样品成功扩增出PreS-S基因21 份,其中 HBsAb+OBIB 4 份,HBsAb-OBIB 6 份,HBsAb+OBIC 6 份,HBsAb-OBIC 5 份.OBI 毒株 PreS-S区突变率高于野毒株,差异有显著的统计学意义(OBIB vs.WTB:2.64％:0.66％,P＜0.001;OBIC vs.WTC:3.67％:1.19％,P＜0.001).OBI毒株蛋白免疫区突变率大于非蛋白免疫区,差异有显著的统计学意义(OBIB:3.57％:1.86％,P=0.005;OBIC:4.78％:2.65％,P=0.001).OBIC 毒株蛋白免疫区及非蛋白免疫区突变率均大于OBIB毒株,差异无统计学意义(蛋白免疫区:4.78％:3.57％,P=0.107;非蛋白免疫区:2.65％:1.86％,P=0.142).HBsAb-OBI毒株T、B细胞表位突变率高于HBsAb+OBI毒株,差异无统计学意义(HBsAb-OBIB vs.HBsAb+OBIB:4.17:3.01,P=0.303;HBsAb-OBIC vs.HBsAb+OBIC:5.65:4.26,P=0.207).4 个 T 细胞表位高频突变(T47A/K、S174N、L175S、V177A)以及 3 个 B细胞表位高频突变(G73S、K122R、I126M/T)的亲和力分析和抗原性分析显示多数T细胞表位突变前后与HLA分子亲和力变化不大,B细胞表位免疫原性变化不明显,某些位点突变后亲水性、表面可及性甚至优于野生毒株.结论 OBI毒株PreS-S区突变率显著高于野毒株;OBI毒株蛋白免疫区突变率显著高于非蛋白免疫区;OBIC变异活跃程度大于OBIB;各点突变可能在病毒复制过程中随机发生,未发现HBsAb压力或依赖性;PreS-S区关键位点突变或多表位共同突变可能在OBI形成中发挥重要作用.

    隐匿性乙肝PreS-S区细胞表位变异

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    2014-2016年河北省石家庄地区儿童重症社区获得性肺炎的病原学分析

    李飞安淑华郭佳运李奇...
    513-520页
    查看更多>>摘要：目的 了解河北省儿童重症社区获得性肺炎的病原学分布情况.方法 收集2014年1月至2016年1月在河北省儿童医院住院的314例被诊断为重症肺炎的儿童的临床数据,同时采集鼻咽拭子样本进行实验室检查.结果 在314例患儿中,鼻咽拭子病原阳性为298例(94.94％),其中246例(78.34％)同时检测到多种病原,主要为混合病毒和细菌(206例,占65.61％).病原体检出总数为848株,其中病毒为483株(56.96％),以呼吸道合胞病毒最常见(A型97株、B型86株);细菌和非典型病原体(肺炎支原体)为365株(43.04％),以肺炎链球菌(220株)和流感嗜血杆菌(119株)为主.不同年龄组中,1岁以下儿童的病原体检出率更高(x2=21.389,P＜0.001).在不同季节中,病原体检出阳性率没有显著差异,但在秋季、冬季和春季分别检出呼吸道合胞病毒A型、呼吸道合胞病毒B型和肺炎链球菌的比例较高,差异有统计学意义(x2=22.205,P＜0.001;x2=37.874,P＜0.001;x2=11.380,P=0.009).结论 儿童重症肺炎鼻咽拭子样本检测的病原体通常为混合病毒和细菌,并且不同病原体在不同年龄和季节的检出率有差异,鼻咽拭子样本病原检测对临床病原判断具有一定的参考价值.

    重症肺炎鼻咽拭子病原学儿童

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    2010-2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒流行株基因特征分析

    李响魏雷雷黄飚程涛...
    521-526页
    查看更多>>摘要：目的 分析2010-2023年吉林省水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)流行株基因型特征.方法 收集吉林省2010-2023年VZV散发病例样本78份,选取经荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,Real-Time PCR)检测后 CT＜25 阳性标本 26 份,采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)扩增开放阅读框(Open reading framme,ORF)ORF22、ORF38 及ORF62,扩增产物测序后根据ORF22的5个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNPs)位点(37902,38019,38055,38081 和 38177)和 ORF38 的 1 个 SNP 位点(69424),进行基因分型,根据ORF38的1个位点(69349)及ORF62的3个位点(106262、107252、108111)确定是疫苗株或野毒株.通过序列比对构建系统进化树.结果 26份样本序列与Dumas株相比,SNPs(37902,38055,38081和38177)四个分型位点发生突变,与pOka株相同,均属于clade2分支,与Dumas和Baike株相比,26份样本均为野毒株.JL2016-4株在38059位点苏氨酸变为天冬胺酰,JL2021-4株在37933位点精氨酸变为脯氨酸,37935位点天冬氨酸变为酪氨酸,38031位点碱基天冬氨酸变为酪氨酸.JL2023-1株在37933位点精氨酸变为亮氨酸.结论 吉林省2010-2023年连续14年均存在VZV流行,主要流行株属于clade2分支,应加强VZV暴发监测,提高VZV疫苗接种的覆盖率.

    水痘-带状疱疹病毒单核苷酸多态性基因型分支

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    2013-2022年安徽省人感染H9N2亚型禽流感病毒分子进化分析

    夏艺丹杨思天胡敏昊周雪...
    527-532页
    查看更多>>摘要：目的 分析2013-2022年安徽省人感染的H9N2亚型禽流感病毒与外环境毒株的遗传进化特点及分子特征,为人感染禽流感防控提供了监测经验.方法 选取安徽省流感监测网络实验室中的外环境样本和人源样本,通过鸡胚分离得到63株病毒,采用RT-PCR法扩增后进行全基因组测序,对其生物信息进行分析,构建基因进化树并分析其遗传进化特征以及潜在糖基化位点.结果 血凝素(HA)基因属于9.2.4.5支系,蛋白裂解位点绝大部分为"PSRSSR\GL",神经氨酸酶(NA)、碱性蛋白1(PB1)、酸性蛋白(PA)、非结构蛋白(NS)和核蛋白(NP)基因属于F/98支系,基质蛋白(MP)基因属于G1/97支系,碱性蛋白2(PB2)基因属于ST/7488支系.HA蛋白发生了 T155N、R164Q、H183N、T189D/V、A190V/T和Q226L突变,NA蛋白发生了 62～64位点缺失,PB2蛋白发生了T271A、I292V/M和E627V/L突变,PA蛋白发生了 K356R和S409N突变.63株分离株存在6个潜在糖基化位点.结论 2013-2022年安徽省外环境和人源采集的H9N2亚型禽流感病毒属于同一进化分支,氨基酸位点突变提示了病毒呈现出一种逐渐适应哺乳动物宿主环境的趋势,因而需进一步研究病毒的适应性进化情况以及开展相关的监测工作.

    H9N2禽流感系统进化分子特征

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    青海1株人呼吸道合胞病毒B亚型的全基因序列测定及其分子特征分析

    何丽芳阴梦琪赵生仓唐志坚...
    533-538页
    查看更多>>摘要：目的 分析1株青海省人呼吸道合胞病毒(HRSV)全基因组的基因特征.方法 收集2024年青海省流感监测哨点医院的发热并伴有严重呼吸道感染症状的标本共300份,通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法筛选出HRSVB阳性标本,对符合测序要求的阳性标本进行全基因组测序.在GenBank数据库下载HRSVB全球各基因型别代表株后进行序列比对、亲缘关系进化树构建和遗传距离的计算分析,分析HRSVB测序株序列核苷酸、氨基酸的同源性和氨基酸变异.结果 青海首株China/qinghai/2024-03的全基因组序列为15 140bp,具有HRSV的所有结构特征,与HRSVA亚型原型株Long株的核苷酸同源性最低为80.0％,与HRSVB亚型原型株核苷酸同源性94.7％,说明青海首株为 HRSVB 亚型;遗传进化显示 China/qinghai/2024-03 与 USA/WA-S23450/2021(0R326803.1)及Germany/2021(OR795235.1)同属一个分支,提示亲缘关系最近,G基因遗传进化分析表明该毒株属于HRSVB亚型BA9基因型,相似性分析表明基因组的高变区域为SH和G基因.结论 本研究首次获得HRSV China/qinghai/2024-03全基因组序列,并阐明了其基本的分子结构特征,填补了青海省HRSV病毒的基因及氨基酸数据空缺,也为HRSV流行病学提供了依据.

    人呼吸道合胞病毒B亚型全基因组分子特征

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