本发明公开了一种液态发酵制备金线莲醋的方法,包括以下步骤:1)以甘蔗加工余料为原料液态发酵制备发酵醋液:将甘蔗加工余料清洗、粉碎后与水混合,向其中加入复合酶进行液化发酵,然后加入糖化酶进行糖化发酵;再加入活性干酵母进行酒精发酵;最后加入活化后的醋酸菌进行醋酸发酵,过滤收集滤液。2)制备金线莲干粉:将一年生金线莲植株清洗、烘干、粉碎备用;3)制备金线莲醋:将所述以甘蔗加工余料为原料液态发酵制备的发酵醋液与所述金线莲干粉混合并搅拌均匀经高温处理、常温晾晒后即得所述金线莲醋。该方法制得的金线莲醋酸味柔和,口味醇厚,清香优雅,产品同时富含金线莲和甘蔗皮渣、叶片中有益成分。其方法易于掌握,可规模化量产,且能实现废物的利用和环境的保护。